Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G015400.1
Synonym
Functional annotation DNA binding protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6PAV7
Pfam PF14303
Panther DB PTHR11260 PTHR11260:SF267
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G47680 : DNA binding
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g42890.1 : DNA binding protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G173500 - -
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17 Sobic.010G207325 - -
18 Sobic.005G208200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
19 Sobic.001G380300 - -
20 Sobic.010G060800 glutamate synthase, chloroplast precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G015400 Sobic008G015400 Sobic010G173500 Sobic010G173500 Sobic008G015400--Sobic010G173500 Sobic003G285101 Sobic003G285101 Sobic008G015400--Sobic003G285101 Sobic005G223925 Sobic005G223925 Sobic008G015400--Sobic005G223925 Sobic005G223600 Sobic005G223600 Sobic008G015400--Sobic005G223600 Sobic006G219250 Sobic006G219250 Sobic008G015400--Sobic006G219250 Sobic004G124601 Sobic004G124601 Sobic008G015400--Sobic004G124601 Sobic003G334900 Sobic003G334900 Sobic008G015400--Sobic003G334900 Sobic009G018600 Sobic009G018600 Sobic008G015400--Sobic009G018600 Sobic005G221900 Sobic005G221900 Sobic008G015400--Sobic005G221900 Sobic001G380300 Sobic001G380300 Sobic010G173500--Sobic001G380300 Sobic002G109200 Sobic002G109200 Sobic010G173500--Sobic002G109200 Sobic010G173500--Sobic009G018600 Sobic004G359150 Sobic004G359150 Sobic010G173500--Sobic004G359150 Sobic010G173500--Sobic008G015400 Sobic010G207325 Sobic010G207325 Sobic010G173500--Sobic010G207325 Sobic003G208100 Sobic003G208100 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Octagon: transcription factors


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