Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G109950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R650
Pfam PF13086
Panther DB PTHR10887 PTHR10887:SF338
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G37150 : P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g45910.1 : tRNA-splicing endonuclease positive effector-related, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G137000 - -
2 Sobic.005G093700 - -
3 Sobic.005G157600 cytochrome P450, putative, expressed -
4 Sobic.004G037500 expressed protein -
5 Sobic.008G128500 - -
6 Sobic.008G062700 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@expressed protein -
7 Sobic.003G040700 choline/ethanolamine kinase, putative, expressed K14156: choline/ethanolamine kinase
8 Sobic.001G490950 - -
9 Sobic.001G092400 - -
10 Sobic.010G017501 - -
11 Sobic.003G278600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@sulfate transporter, putative, expressed K17471: sulfate transporter 3
12 Sobic.003G392275 - -
13 Sobic.002G102300 - -
14 Sobic.010G006800 auxin-induced protein 5NG4, putative, expressed -
15 Sobic.010G104600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Caleosin-related family protein(PubMedID : 26320239)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@caleosin related protein, putative, expressed K17991: peroxygenase
16 Sobic.002G121450 - -
17 Sobic.004G032600 - -
18 Sobic.004G098800 - -
19 Sobic.007G101600 - -
20 Sobic.007G138000 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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