Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G062700.1
Synonym Sb08g005220,
Functional annotation Up-reguralion under drought (PubMedID : 24916767)
Up-reguralion under combine stress of drought and heat (PubMedID : 24916767)
expressed protein
UniProt C5YT81
Pfam -
Panther DB PTHR34808 PTHR34808:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G33467 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g08700.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054162
Brachypodium KQJ91961
Barley HORVU3Hr1G074360.1
Wheat TraesCS3D02G301600 , TraesCS3B02G336300 , TraesCS7D02G014300 , TraesCS3A02G300300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G086700 expressed protein -
2 Sobic.001G508800 similar to Beta-amylase(PubMedID : 29862293)@beta-amylase, putative, expressed K01177: beta-amylase
3 Sobic.004G103901 - -
4 Sobic.007G138000 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -
5 Sobic.007G101600 - -
6 Sobic.001G226600 Beta amylase BAM (Os)(PubMedID : 27208977)@beta-amylase, putative, expressed K01177: beta-amylase
7 Sobic.010G006800 auxin-induced protein 5NG4, putative, expressed -
8 Sobic.007G148600 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed K06269: serine/threonine-protein phosphatase PP1 catalytic subunit
9 Sobic.004G042501 - -
10 Sobic.006G032000 - -
11 Sobic.002G061300 OsFBX239 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.005G135100 expressed protein -
13 Sobic.006G001100 ELMO/CED-12 family protein, putative, expressed -
14 Sobic.005G187600 - -
15 Sobic.005G003700 - -
16 Sobic.007G176900 beta-galactosidase precursor, putative, expressed -
17 Sobic.004G180100 - -
18 Sobic.002G102300 - -
19 Sobic.003G238250 - -
20 Sobic.003G042800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G062700 Sobic008G062700 Sobic009G086700 Sobic009G086700 Sobic008G062700--Sobic009G086700 Sobic001G508800 Sobic001G508800 Sobic008G062700--Sobic001G508800 Sobic004G103901 Sobic004G103901 Sobic008G062700--Sobic004G103901 Sobic007G138000 Sobic007G138000 Sobic008G062700--Sobic007G138000 Sobic007G101600 Sobic007G101600 Sobic008G062700--Sobic007G101600 Sobic001G226600 Sobic001G226600 Sobic008G062700--Sobic001G226600 Sobic010G006800 Sobic010G006800 Sobic008G062700--Sobic010G006800 Sobic007G148600 Sobic007G148600 Sobic008G062700--Sobic007G148600 Sobic004G042501 Sobic004G042501 Sobic008G062700--Sobic004G042501 Sobic009G086700--Sobic004G103901 Sobic009G086700--Sobic008G062700 Sobic005G187600 Sobic005G187600 Sobic009G086700--Sobic005G187600 Sobic010G142401 Sobic010G142401 Sobic009G086700--Sobic010G142401 Sobic006G269101 Sobic006G269101 Sobic009G086700--Sobic006G269101 Sobic008G055200 Sobic008G055200 Sobic009G086700--Sobic008G055200 Sobic009G086700--Sobic001G226600 Sobic005G185900 Sobic005G185900 Sobic009G086700--Sobic005G185900 Sobic006G097400 Sobic006G097400 Sobic009G086700--Sobic006G097400 Sobic001G508800--Sobic010G006800 Sobic001G508800--Sobic004G103901 Sobic001G508800--Sobic007G101600 Sobic001G508800--Sobic008G062700 Sobic001G286900 Sobic001G286900 Sobic001G508800--Sobic001G286900 Sobic003G238250 Sobic003G238250 Sobic001G508800--Sobic003G238250 Sobic001G261476 Sobic001G261476 Sobic001G508800--Sobic001G261476 Sobic006G204400 Sobic006G204400 Sobic001G508800--Sobic006G204400 Sobic001G508800--Sobic001G226600 Sobic005G170300 Sobic005G170300 Sobic004G103901--Sobic005G170300 Sobic008G103250 Sobic008G103250 Sobic004G103901--Sobic008G103250 Sobic010G124900 Sobic010G124900 Sobic004G103901--Sobic010G124900 Sobic004G103901--Sobic005G187600 Sobic004G103901--Sobic006G204400 Sobic001G094700 Sobic001G094700 Sobic004G103901--Sobic001G094700 Sobic007G138000--Sobic004G042501 Sobic007G070900 Sobic007G070900 Sobic007G138000--Sobic007G070900 Sobic002G106600 Sobic002G106600 Sobic007G138000--Sobic002G106600 Sobic004G180100 Sobic004G180100 Sobic007G138000--Sobic004G180100 Sobic005G003700 Sobic005G003700 Sobic007G138000--Sobic005G003700 Sobic005G135100 Sobic005G135100 Sobic007G138000--Sobic005G135100 Sobic002G340600 Sobic002G340600 Sobic007G138000--Sobic002G340600 Sobic001G357400 Sobic001G357400 Sobic007G138000--Sobic001G357400 Sobic007G138000--Sobic007G101600 Sobic007G101600--Sobic001G286900 Sobic007G101600--Sobic007G138000 Sobic007G101600--Sobic005G135100 Sobic007G101600--Sobic003G238250 Sobic002G257001 Sobic002G257001 Sobic007G101600--Sobic002G257001 Sobic007G101600--Sobic004G042501 Sobic007G101600--Sobic010G006800 Sobic007G101600--Sobic002G106600 Sobic007G101600--Sobic007G070900 Sobic002G282600 Sobic002G282600 Sobic001G226600--Sobic002G282600 Sobic006G032000 Sobic006G032000 Sobic001G226600--Sobic006G032000 Sobic001G220800 Sobic001G220800 Sobic001G226600--Sobic001G220800 Sobic004G350400 Sobic004G350400 Sobic001G226600--Sobic004G350400 Sobic003G438500 Sobic003G438500 Sobic001G226600--Sobic003G438500 Sobic002G091300 Sobic002G091300 Sobic001G226600--Sobic002G091300 Sobic004G131400 Sobic004G131400 Sobic001G226600--Sobic004G131400 Sobic009G116100 Sobic009G116100 Sobic001G226600--Sobic009G116100 Sobic010G056500 Sobic010G056500 Sobic001G226600--Sobic010G056500 Sobic010G006800--Sobic003G238250 Sobic010G006800--Sobic007G101600 Sobic002G102300 Sobic002G102300 Sobic010G006800--Sobic002G102300 Sobic001G490950 Sobic001G490950 Sobic010G006800--Sobic001G490950 Sobic004G074900 Sobic004G074900 Sobic010G006800--Sobic004G074900 Sobic010G006800--Sobic007G138000 Sobic010G006800--Sobic001G286900 Sobic008G057600 Sobic008G057600 Sobic010G006800--Sobic008G057600 Sobic003G392275 Sobic003G392275 Sobic010G006800--Sobic003G392275 Sobic006G071096 Sobic006G071096 Sobic007G148600--Sobic006G071096 Sobic009G087200 Sobic009G087200 Sobic007G148600--Sobic009G087200 Sobic009G177300 Sobic009G177300 Sobic007G148600--Sobic009G177300 Sobic002G351500 Sobic002G351500 Sobic007G148600--Sobic002G351500 Sobic001G473700 Sobic001G473700 Sobic007G148600--Sobic001G473700 Sobic009G216400 Sobic009G216400 Sobic007G148600--Sobic009G216400 Sobic003G178000 Sobic003G178000 Sobic007G148600--Sobic003G178000 Sobic003G027300 Sobic003G027300 Sobic007G148600--Sobic003G027300 Sobic007G148600--Sobic001G226600 Sobic001G488950 Sobic001G488950 Sobic004G042501--Sobic001G488950 Sobic001G333700 Sobic001G333700 Sobic004G042501--Sobic001G333700 Sobic004G042501--Sobic001G094700
Octagon: transcription factors


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