Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G037500.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RL86
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g01940.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G490950 - -
2 Sobic.010G006800 auxin-induced protein 5NG4, putative, expressed -
3 Sobic.003G392275 - -
4 Sobic.004G098800 - -
5 Sobic.002G102300 - -
6 Sobic.007G101600 - -
7 Sobic.003G238250 - -
8 Sobic.004G032600 - -
9 Sobic.003G278600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@sulfate transporter, putative, expressed K17471: sulfate transporter 3
10 Sobic.003G141600 - -
11 Sobic.006G219900 csAtPR5, putative, expressed -
12 Sobic.007G138000 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G356800 universal stress protein domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G226900 zinc finger family protein, putative, expressed -
15 Sobic.005G171700 OsFBDUF20 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
16 Sobic.001G414100 expressed protein -
17 Sobic.008G041450 - -
18 Sobic.008G062700 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@expressed protein -
19 Sobic.001G508800 similar to Beta-amylase(PubMedID : 29862293)@beta-amylase, putative, expressed K01177: beta-amylase
20 Sobic.004G074900 serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B subunitbeta, putative, expressed K11583: serine/threonine-protein phosphatase 2A regulatory subunit B''


Gene co-expression network
sample Sobic004G037500 Sobic004G037500 Sobic001G490950 Sobic001G490950 Sobic004G037500--Sobic001G490950 Sobic010G006800 Sobic010G006800 Sobic004G037500--Sobic010G006800 Sobic003G392275 Sobic003G392275 Sobic004G037500--Sobic003G392275 Sobic004G098800 Sobic004G098800 Sobic004G037500--Sobic004G098800 Sobic002G102300 Sobic002G102300 Sobic004G037500--Sobic002G102300 Sobic007G101600 Sobic007G101600 Sobic004G037500--Sobic007G101600 Sobic003G238250 Sobic003G238250 Sobic004G037500--Sobic003G238250 Sobic004G032600 Sobic004G032600 Sobic004G037500--Sobic004G032600 Sobic003G278600 Sobic003G278600 Sobic004G037500--Sobic003G278600 Sobic001G490950--Sobic002G102300 Sobic001G490950--Sobic010G006800 Sobic004G074900 Sobic004G074900 Sobic001G490950--Sobic004G074900 Sobic001G490950--Sobic007G101600 Sobic001G490950--Sobic003G392275 Sobic001G490950--Sobic003G238250 Sobic001G226900 Sobic001G226900 Sobic001G490950--Sobic001G226900 Sobic002G368100 Sobic002G368100 Sobic001G490950--Sobic002G368100 Sobic007G138000 Sobic007G138000 Sobic001G490950--Sobic007G138000 Sobic010G006800--Sobic003G238250 Sobic010G006800--Sobic007G101600 Sobic010G006800--Sobic002G102300 Sobic010G006800--Sobic001G490950 Sobic010G006800--Sobic004G074900 Sobic010G006800--Sobic007G138000 Sobic001G286900 Sobic001G286900 Sobic010G006800--Sobic001G286900 Sobic008G057600 Sobic008G057600 Sobic010G006800--Sobic008G057600 Sobic010G006800--Sobic003G392275 Sobic003G392275--Sobic002G102300 Sobic003G392275--Sobic001G226900 Sobic003G392275--Sobic001G490950 Sobic003G392275--Sobic010G006800 Sobic003G392275--Sobic007G101600 Sobic003G392275--Sobic004G074900 Sobic003G392275--Sobic003G238250 Sobic003G392275--Sobic004G098800 Sobic003G392275--Sobic008G057600 Sobic010G134700 Sobic010G134700 Sobic004G098800--Sobic010G134700 Sobic008G041450 Sobic008G041450 Sobic004G098800--Sobic008G041450 Sobic004G098800--Sobic003G392275 Sobic003G385000 Sobic003G385000 Sobic004G098800--Sobic003G385000 Sobic004G098800--Sobic010G006800 Sobic003G141600 Sobic003G141600 Sobic004G098800--Sobic003G141600 Sobic004G098800--Sobic001G490950 Sobic004G098800--Sobic002G102300 Sobic004G098800--Sobic004G032600 Sobic002G102300--Sobic010G006800 Sobic002G102300--Sobic007G101600 Sobic002G102300--Sobic003G238250 Sobic002G102300--Sobic001G490950 Sobic002G102300--Sobic004G074900 Sobic002G102300--Sobic003G392275 Sobic004G140400 Sobic004G140400 Sobic002G102300--Sobic004G140400 Sobic002G102300--Sobic001G286900 Sobic002G102300--Sobic007G138000 Sobic007G101600--Sobic001G286900 Sobic007G101600--Sobic007G138000 Sobic005G135100 Sobic005G135100 Sobic007G101600--Sobic005G135100 Sobic007G101600--Sobic003G238250 Sobic002G257001 Sobic002G257001 Sobic007G101600--Sobic002G257001 Sobic004G042501 Sobic004G042501 Sobic007G101600--Sobic004G042501 Sobic007G101600--Sobic010G006800 Sobic002G106600 Sobic002G106600 Sobic007G101600--Sobic002G106600 Sobic007G070900 Sobic007G070900 Sobic007G101600--Sobic007G070900 Sobic003G238250--Sobic007G101600 Sobic003G238250--Sobic010G006800 Sobic003G238250--Sobic001G286900 Sobic003G238250--Sobic002G102300 Sobic003G238250--Sobic004G074900 Sobic003G238250--Sobic007G138000 Sobic003G238250--Sobic002G257001 Sobic003G238250--Sobic005G135100 Sobic005G225500 Sobic005G225500 Sobic003G238250--Sobic005G225500 Sobic004G032600--Sobic001G490950 Sobic004G032600--Sobic004G098800 Sobic004G032600--Sobic001G226900 Sobic004G032600--Sobic003G392275 Sobic004G032600--Sobic002G102300 Sobic004G032600--Sobic010G006800 Sobic006G219900 Sobic006G219900 Sobic004G032600--Sobic006G219900 Sobic004G032600--Sobic002G368100 Sobic004G032600--Sobic003G141600 Sobic002G103800 Sobic002G103800 Sobic003G278600--Sobic002G103800 Sobic002G074800 Sobic002G074800 Sobic003G278600--Sobic002G074800 Sobic004G213500 Sobic004G213500 Sobic003G278600--Sobic004G213500 Sobic010G114200 Sobic010G114200 Sobic003G278600--Sobic010G114200 Sobic004G064200 Sobic004G064200 Sobic003G278600--Sobic004G064200 Sobic004G176200 Sobic004G176200 Sobic003G278600--Sobic004G176200 Sobic006G270000 Sobic006G270000 Sobic003G278600--Sobic006G270000 Sobic007G086900 Sobic007G086900 Sobic003G278600--Sobic007G086900 Sobic006G143900 Sobic006G143900 Sobic003G278600--Sobic006G143900
Octagon: transcription factors


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