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Transcriptome id Sobic.005G093700.1
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UniProt A0A1B6PR92
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G104600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Caleosin-related family protein(PubMedID : 26320239)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@caleosin related protein, putative, expressed K17991: peroxygenase
2 Sobic.003G008000 cyclin-T1-1, putative, expressed -
3 Sobic.003G187700 polygalacturonase, putative, expressed -
4 Sobic.004G253200 amino acid transporter, putative, expressed K14207: SLC38A2, solute carrier family 38 (sodium-coupled neutral amino acid transporter), member 2
5 Sobic.008G128500 - -
6 Sobic.010G158900 - -
7 Sobic.010G137000 - -
8 Sobic.001G342101 - -
9 Sobic.010G089600 Up-regulation in phyB-1 mutant(PubMedID : 26893475)@trehalose phosphatase, putative, expressed K01087: trehalose 6-phosphate phosphatase
10 Sobic.010G242700 expressed protein -
11 Sobic.008G055600 OsFBX430 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.010G189432 - -
13 Sobic.001G213666 - -
14 Sobic.007G127500 - -
15 Sobic.008G023300 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
16 Sobic.001G350100 expressed high in San Chi San (an efficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@RING-H2 finger protein ATL5H precursor, putative, expressed K10664: E3 ubiquitin-protein ligase ATL6/9/15/31/42/55
17 Sobic.004G007400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CCT/B-box zinc finger protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G180950 - -
19 Sobic.006G256000 - -
20 Sobic.003G065100 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR1 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G093700 Sobic005G093700 Sobic010G104600 Sobic010G104600 Sobic005G093700--Sobic010G104600 Sobic003G008000 Sobic003G008000 Sobic005G093700--Sobic003G008000 Sobic003G187700 Sobic003G187700 Sobic005G093700--Sobic003G187700 Sobic004G253200 Sobic004G253200 Sobic005G093700--Sobic004G253200 Sobic008G128500 Sobic008G128500 Sobic005G093700--Sobic008G128500 Sobic010G158900 Sobic010G158900 Sobic005G093700--Sobic010G158900 Sobic010G137000 Sobic010G137000 Sobic005G093700--Sobic010G137000 Sobic001G342101 Sobic001G342101 Sobic005G093700--Sobic001G342101 Sobic010G089600 Sobic010G089600 Sobic005G093700--Sobic010G089600 Sobic005G135100 Sobic005G135100 Sobic010G104600--Sobic005G135100 Sobic001G240700 Sobic001G240700 Sobic010G104600--Sobic001G240700 Sobic007G112500 Sobic007G112500 Sobic010G104600--Sobic007G112500 Sobic002G333001 Sobic002G333001 Sobic010G104600--Sobic002G333001 Sobic002G073600 Sobic002G073600 Sobic010G104600--Sobic002G073600 Sobic002G001200 Sobic002G001200 Sobic010G104600--Sobic002G001200 Sobic007G176900 Sobic007G176900 Sobic010G104600--Sobic007G176900 Sobic006G093600 Sobic006G093600 Sobic010G104600--Sobic006G093600 Sobic005G043300 Sobic005G043300 Sobic010G104600--Sobic005G043300 Sobic003G008000--Sobic010G104600 Sobic004G046800 Sobic004G046800 Sobic003G008000--Sobic004G046800 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic003G008000--Sobic008G029800 Sobic009G044700 Sobic009G044700 Sobic003G008000--Sobic009G044700 Sobic004G007400 Sobic004G007400 Sobic003G008000--Sobic004G007400 Sobic008G030501 Sobic008G030501 Sobic003G008000--Sobic008G030501 Sobic002G070100 Sobic002G070100 Sobic003G008000--Sobic002G070100 Sobic003G008000--Sobic001G240700 Sobic001G253750 Sobic001G253750 Sobic003G008000--Sobic001G253750 Sobic003G187700--Sobic004G253200 Sobic008G055600 Sobic008G055600 Sobic003G187700--Sobic008G055600 Sobic010G189432 Sobic010G189432 Sobic003G187700--Sobic010G189432 Sobic003G187700--Sobic001G342101 Sobic009G119600 Sobic009G119600 Sobic003G187700--Sobic009G119600 Sobic001G213666 Sobic001G213666 Sobic003G187700--Sobic001G213666 Sobic005G144000 Sobic005G144000 Sobic003G187700--Sobic005G144000 Sobic004G120500 Sobic004G120500 Sobic003G187700--Sobic004G120500 Sobic001G279000 Sobic001G279000 Sobic003G187700--Sobic001G279000 Sobic004G253200--Sobic008G055600 Sobic004G253200--Sobic003G187700 Sobic004G253200--Sobic009G119600 Sobic004G253200--Sobic010G189432 Sobic004G253200--Sobic004G120500 Sobic004G253200--Sobic001G342101 Sobic004G253200--Sobic005G144000 Sobic004G253200--Sobic001G213666 Sobic004G253200--Sobic001G279000 Sobic001G024400 Sobic001G024400 Sobic008G128500--Sobic001G024400 Sobic008G128500--Sobic010G104600 Sobic008G036600 Sobic008G036600 Sobic008G128500--Sobic008G036600 Sobic010G202200 Sobic010G202200 Sobic008G128500--Sobic010G202200 Sobic009G230800 Sobic009G230800 Sobic008G128500--Sobic009G230800 Sobic003G236000 Sobic003G236000 Sobic008G128500--Sobic003G236000 Sobic001G519600 Sobic001G519600 Sobic008G128500--Sobic001G519600 Sobic001G024100 Sobic001G024100 Sobic008G128500--Sobic001G024100 Sobic001G405100 Sobic001G405100 Sobic008G128500--Sobic001G405100 Sobic010G158900--Sobic005G093700 Sobic009G181300 Sobic009G181300 Sobic010G158900--Sobic009G181300 Sobic005G071800 Sobic005G071800 Sobic010G158900--Sobic005G071800 Sobic004G094000 Sobic004G094000 Sobic010G158900--Sobic004G094000 Sobic009G157300 Sobic009G157300 Sobic010G158900--Sobic009G157300 Sobic005G093500 Sobic005G093500 Sobic010G158900--Sobic005G093500 Sobic007G127550 Sobic007G127550 Sobic010G158900--Sobic007G127550 Sobic004G035400 Sobic004G035400 Sobic010G158900--Sobic004G035400 Sobic002G197000 Sobic002G197000 Sobic010G158900--Sobic002G197000 Sobic008G109950 Sobic008G109950 Sobic010G137000--Sobic008G109950 Sobic010G137000--Sobic005G093700 Sobic001G261750 Sobic001G261750 Sobic010G137000--Sobic001G261750 Sobic001G494600 Sobic001G494600 Sobic010G137000--Sobic001G494600 Sobic002G093600 Sobic002G093600 Sobic010G137000--Sobic002G093600 Sobic001G342101--Sobic008G055600 Sobic001G342101--Sobic005G144000 Sobic001G342101--Sobic003G187700 Sobic001G342101--Sobic004G253200 Sobic003G441000 Sobic003G441000 Sobic001G342101--Sobic003G441000 Sobic001G342101--Sobic001G279000 Sobic001G342101--Sobic010G189432 Sobic005G050400 Sobic005G050400 Sobic001G342101--Sobic005G050400 Sobic001G400000 Sobic001G400000 Sobic001G342101--Sobic001G400000 Sobic008G023300 Sobic008G023300 Sobic010G089600--Sobic008G023300 Sobic010G089600--Sobic004G035400 Sobic007G127500 Sobic007G127500 Sobic010G089600--Sobic007G127500 Sobic010G089600--Sobic003G187700 Sobic010G089600--Sobic010G189432 Sobic010G089600--Sobic001G213666 Sobic010G089600--Sobic004G253200 Sobic010G089600--Sobic007G127550 Sobic004G184101 Sobic004G184101 Sobic010G089600--Sobic004G184101
Octagon: transcription factors


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