Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G151900.1
Synonym Sb08g020110
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YQZ7
Pfam -
Panther DB PTHR34724 PTHR34724:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g47034.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G122201 - -
2 Sobic.002G035100 - -
3 Sobic.004G228000 DUF1771 domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G140101 - -
5 Sobic.001G027400 - -
6 Sobic.004G267950 - -
7 Sobic.010G118401 - -
8 Sobic.004G202750 - -
9 Sobic.002G387000 expressed protein -
10 Sobic.003G251900 expressed protein -
11 Sobic.004G345200 OsWAK11 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
12 Sobic.004G306700 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP40, putative, expressed K05864: PPID, peptidyl-prolyl isomerase D
13 Sobic.002G350800 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
14 Sobic.001G490600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ribosomal L18p/L5e family protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G413800 Spc97 / Spc98 family protein, putative, expressed -
16 Sobic.009G147600 pentatricopeptide, putative, expressed -
17 Sobic.009G184500 cysteine proteinase inhibitor precursor protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G005332 - -
19 Sobic.010G118600 sodium/potassium/calcium exchanger 1, putative, expressed -
20 Sobic.010G278400 coiled-coil domain-containing protein 12, putative, expressed K12871: coiled-coil domain-containing protein 12


Gene co-expression network
sample Sobic008G151900 Sobic008G151900 Sobic009G122201 Sobic009G122201 Sobic008G151900--Sobic009G122201 Sobic002G035100 Sobic002G035100 Sobic008G151900--Sobic002G035100 Sobic004G228000 Sobic004G228000 Sobic008G151900--Sobic004G228000 Sobic001G140101 Sobic001G140101 Sobic008G151900--Sobic001G140101 Sobic001G027400 Sobic001G027400 Sobic008G151900--Sobic001G027400 Sobic004G267950 Sobic004G267950 Sobic008G151900--Sobic004G267950 Sobic010G118401 Sobic010G118401 Sobic008G151900--Sobic010G118401 Sobic004G202750 Sobic004G202750 Sobic008G151900--Sobic004G202750 Sobic002G387000 Sobic002G387000 Sobic008G151900--Sobic002G387000 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic009G122201--Sobic010G041500 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic009G122201--Sobic009G184500 Sobic009G122201--Sobic008G151900 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic009G122201--Sobic004G288900 Sobic004G224100 Sobic004G224100 Sobic009G122201--Sobic004G224100 Sobic004G047001 Sobic004G047001 Sobic009G122201--Sobic004G047001 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Octagon: transcription factors


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