Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G167400.1
Synonym Sb08g021300
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PE67
Pfam PF00304
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g36720.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G035200 - -
2 Sobic.001G244500 sulfate transporter, putative, expressed K17471: sulfate transporter 3
3 Sobic.003G379450 - -
4 Sobic.004G282966 - -
5 Sobic.003G139600 expressed protein -
6 Sobic.003G244250 - -
7 Sobic.001G171700 AT-rich interaction region, putative, expressed -
8 Sobic.001G465600 AMP-binding domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G416200 NADPH-dependent oxidoreductase, putative, expressed -
10 Sobic.001G248900 exocyst complex component 6, putative, expressed -
11 Sobic.009G204501 - -
12 Sobic.009G097400 - -
13 Sobic.002G380550 - -
14 Sobic.006G280400 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@phosphatidylinositol-4-phosphate 5-Kinase, putative, expressed K00921: PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol-3-phosphate 5-kinase
15 Sobic.003G147800 expressed protein -
16 Sobic.001G395600 proteins of unknown function domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G315300 chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed -
18 Sobic.005G021400 - -
19 Sobic.005G053001 - -
20 Sobic.001G143850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G167400 Sobic008G167400 Sobic006G035200 Sobic006G035200 Sobic008G167400--Sobic006G035200 Sobic001G244500 Sobic001G244500 Sobic008G167400--Sobic001G244500 Sobic003G379450 Sobic003G379450 Sobic008G167400--Sobic003G379450 Sobic004G282966 Sobic004G282966 Sobic008G167400--Sobic004G282966 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic008G167400--Sobic003G139600 Sobic003G244250 Sobic003G244250 Sobic008G167400--Sobic003G244250 Sobic001G171700 Sobic001G171700 Sobic008G167400--Sobic001G171700 Sobic001G465600 Sobic001G465600 Sobic008G167400--Sobic001G465600 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic008G167400--Sobic003G416200 Sobic006G035200--Sobic001G171700 Sobic001G278650 Sobic001G278650 Sobic006G035200--Sobic001G278650 Sobic002G157050 Sobic002G157050 Sobic006G035200--Sobic002G157050 Sobic004G322650 Sobic004G322650 Sobic006G035200--Sobic004G322650 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic006G035200--Sobic004G157050 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic006G035200--Sobic008G171200 Sobic006G035200--Sobic003G139600 Sobic006G035200--Sobic004G282966 Sobic002G380550 Sobic002G380550 Sobic006G035200--Sobic002G380550 Sobic006G029200 Sobic006G029200 Sobic001G244500--Sobic006G029200 Sobic003G413000 Sobic003G413000 Sobic001G244500--Sobic003G413000 Sobic005G211801 Sobic005G211801 Sobic001G244500--Sobic005G211801 Sobic001G244500--Sobic008G167400 Sobic001G244500--Sobic003G379450 Sobic001G455300 Sobic001G455300 Sobic001G244500--Sobic001G455300 Sobic005G100400 Sobic005G100400 Sobic001G244500--Sobic005G100400 Sobic003G306000 Sobic003G306000 Sobic001G244500--Sobic003G306000 Sobic005G154600 Sobic005G154600 Sobic001G244500--Sobic005G154600 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic003G379450--Sobic006G219400 Sobic003G379450--Sobic003G139600 Sobic002G191900 Sobic002G191900 Sobic003G379450--Sobic002G191900 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic003G379450--Sobic004G078200 Sobic003G379450--Sobic001G465600 Sobic005G028500 Sobic005G028500 Sobic003G379450--Sobic005G028500 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic003G379450--Sobic001G201933 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic003G379450--Sobic010G002301 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic003G379450--Sobic004G224733 Sobic004G282966--Sobic003G139600 Sobic001G395600 Sobic001G395600 Sobic004G282966--Sobic001G395600 Sobic004G282966--Sobic001G465600 Sobic003G147800 Sobic003G147800 Sobic004G282966--Sobic003G147800 Sobic004G282966--Sobic003G244250 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic004G282966--Sobic004G332200 Sobic004G282966--Sobic010G002301 Sobic010G176000 Sobic010G176000 Sobic004G282966--Sobic010G176000 Sobic004G282966--Sobic004G224733 Sobic003G139600--Sobic010G002301 Sobic003G139600--Sobic001G465600 Sobic003G139600--Sobic004G282966 Sobic003G139600--Sobic001G201933 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic003G139600--Sobic007G113566 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic003G139600--Sobic004G207800 Sobic003G139600--Sobic001G395600 Sobic003G139600--Sobic004G157050 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic003G139600--Sobic001G331650 Sobic002G246100 Sobic002G246100 Sobic003G244250--Sobic002G246100 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic003G244250--Sobic001G436450 Sobic004G260250 Sobic004G260250 Sobic003G244250--Sobic004G260250 Sobic009G079400 Sobic009G079400 Sobic003G244250--Sobic009G079400 Sobic004G187701 Sobic004G187701 Sobic003G244250--Sobic004G187701 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic003G244250--Sobic002G147550 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic003G244250--Sobic006G176900 Sobic003G244250--Sobic003G416200 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic003G244250--Sobic004G207733 Sobic001G171700--Sobic001G278650 Sobic001G171700--Sobic004G322650 Sobic001G171700--Sobic008G171200 Sobic001G171700--Sobic010G176000 Sobic009G204501 Sobic009G204501 Sobic001G171700--Sobic009G204501 Sobic001G171700--Sobic002G380550 Sobic001G171700--Sobic006G035200 Sobic001G358366 Sobic001G358366 Sobic001G171700--Sobic001G358366 Sobic001G171700--Sobic004G157050 Sobic001G465600--Sobic010G002301 Sobic001G465600--Sobic003G139600 Sobic001G465600--Sobic001G331650 Sobic001G465600--Sobic004G157050 Sobic001G465600--Sobic004G207800 Sobic001G465600--Sobic007G113566 Sobic001G465600--Sobic006G219400 Sobic001G465600--Sobic002G191900 Sobic001G465600--Sobic001G201933 Sobic009G097400 Sobic009G097400 Sobic003G416200--Sobic009G097400 Sobic003G172966 Sobic003G172966 Sobic003G416200--Sobic003G172966 Sobic006G216150 Sobic006G216150 Sobic003G416200--Sobic006G216150 Sobic003G416200--Sobic001G436450 Sobic003G416200--Sobic003G244250 Sobic004G206050 Sobic004G206050 Sobic003G416200--Sobic004G206050 Sobic003G416200--Sobic004G332200 Sobic003G056200 Sobic003G056200 Sobic003G416200--Sobic003G056200 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic003G416200--Sobic010G136700
Octagon: transcription factors


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