Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G053001.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RH03
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G143850 - -
2 Sobic.010G172633 - -
3 Sobic.003G394150 - -
4 Sobic.001G035700 - -
5 Sobic.002G395400 - -
6 Sobic.001G315300 chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed -
7 Sobic.009G258000 S-locus lectin protein kinase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.010G020000 cytochrome P450 86A1, putative, expressed -
9 Sobic.002G204700 ZOS9-06 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
10 Sobic.001G505066 - -
11 Sobic.001G488800 glutaredoxin, putative, expressed K17479: glutaredoxin domain-containing cysteine-rich protein 1
12 Sobic.008G012200 DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, putative, expressed K03013: RPB5, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1
13 Sobic.004G216650 - -
14 Sobic.009G124100 - -
15 Sobic.007G043750 - -
16 Sobic.009G053700 gibberellin 2-oxidase, putative, expressed K04125: gibberellin 2beta-dioxygenase
17 Sobic.003G147800 expressed protein -
18 Sobic.004G282966 - -
19 Sobic.004G224733 - -
20 Sobic.006G216150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G053001 Sobic005G053001 Sobic001G143850 Sobic001G143850 Sobic005G053001--Sobic001G143850 Sobic010G172633 Sobic010G172633 Sobic005G053001--Sobic010G172633 Sobic003G394150 Sobic003G394150 Sobic005G053001--Sobic003G394150 Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic005G053001--Sobic001G035700 Sobic002G395400 Sobic002G395400 Sobic005G053001--Sobic002G395400 Sobic001G315300 Sobic001G315300 Sobic005G053001--Sobic001G315300 Sobic009G258000 Sobic009G258000 Sobic005G053001--Sobic009G258000 Sobic010G020000 Sobic010G020000 Sobic005G053001--Sobic010G020000 Sobic002G204700 Sobic002G204700 Sobic005G053001--Sobic002G204700 Sobic001G143850--Sobic010G172633 Sobic004G216650 Sobic004G216650 Sobic001G143850--Sobic004G216650 Sobic001G143850--Sobic001G315300 Sobic009G053700 Sobic009G053700 Sobic001G143850--Sobic009G053700 Sobic010G246800 Sobic010G246800 Sobic001G143850--Sobic010G246800 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic001G143850--Sobic003G416200 Sobic001G143850--Sobic003G394150 Sobic001G143850--Sobic010G020000 Sobic002G136500 Sobic002G136500 Sobic001G143850--Sobic002G136500 Sobic010G172633--Sobic001G315300 Sobic010G172633--Sobic001G143850 Sobic010G172633--Sobic001G035700 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic010G172633--Sobic001G505066 Sobic001G184950 Sobic001G184950 Sobic010G172633--Sobic001G184950 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic010G172633--Sobic009G147450 Sobic003G147800 Sobic003G147800 Sobic010G172633--Sobic003G147800 Sobic003G132200 Sobic003G132200 Sobic010G172633--Sobic003G132200 Sobic002G109900 Sobic002G109900 Sobic010G172633--Sobic002G109900 Sobic003G394150--Sobic002G395400 Sobic003G394150--Sobic010G020000 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic003G394150--Sobic003G257650 Sobic003G394150--Sobic009G053700 Sobic003G394150--Sobic001G143850 Sobic003G394150--Sobic002G204700 Sobic003G432400 Sobic003G432400 Sobic003G394150--Sobic003G432400 Sobic007G043750 Sobic007G043750 Sobic003G394150--Sobic007G043750 Sobic002G367000 Sobic002G367000 Sobic003G394150--Sobic002G367000 Sobic001G035700--Sobic010G172633 Sobic009G124100 Sobic009G124100 Sobic001G035700--Sobic009G124100 Sobic001G035700--Sobic001G505066 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic001G035700--Sobic001G488800 Sobic004G104250 Sobic004G104250 Sobic001G035700--Sobic004G104250 Sobic002G310400 Sobic002G310400 Sobic001G035700--Sobic002G310400 Sobic010G081950 Sobic010G081950 Sobic001G035700--Sobic010G081950 Sobic001G035700--Sobic001G184950 Sobic001G035700--Sobic001G143850 Sobic002G395400--Sobic003G394150 Sobic004G175800 Sobic004G175800 Sobic002G395400--Sobic004G175800 Sobic002G395400--Sobic003G257650 Sobic002G395400--Sobic010G020000 Sobic008G179400 Sobic008G179400 Sobic002G395400--Sobic008G179400 Sobic003G094900 Sobic003G094900 Sobic002G395400--Sobic003G094900 Sobic002G395400--Sobic007G043750 Sobic002G395400--Sobic002G204700 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic002G395400--Sobic004G224733 Sobic001G315300--Sobic010G172633 Sobic001G315300--Sobic002G109900 Sobic001G315300--Sobic001G143850 Sobic001G315300--Sobic004G216650 Sobic001G315300--Sobic003G147800 Sobic001G315300--Sobic001G184950 Sobic001G315300--Sobic002G136500 Sobic001G074900 Sobic001G074900 Sobic001G315300--Sobic001G074900 Sobic002G286500 Sobic002G286500 Sobic001G315300--Sobic002G286500 Sobic009G258000--Sobic003G432400 Sobic002G359500 Sobic002G359500 Sobic009G258000--Sobic002G359500 Sobic010G226100 Sobic010G226100 Sobic009G258000--Sobic010G226100 Sobic009G258000--Sobic007G043750 Sobic003G198850 Sobic003G198850 Sobic009G258000--Sobic003G198850 Sobic009G258000--Sobic003G257650 Sobic004G115950 Sobic004G115950 Sobic009G258000--Sobic004G115950 Sobic009G258000--Sobic002G109900 Sobic009G258000--Sobic003G394150 Sobic010G020000--Sobic003G394150 Sobic010G020000--Sobic009G053700 Sobic002G168700 Sobic002G168700 Sobic010G020000--Sobic002G168700 Sobic007G083700 Sobic007G083700 Sobic010G020000--Sobic007G083700 Sobic003G383000 Sobic003G383000 Sobic010G020000--Sobic003G383000 Sobic009G178650 Sobic009G178650 Sobic010G020000--Sobic009G178650 Sobic010G020000--Sobic004G216650 Sobic010G020000--Sobic003G257650 Sobic003G373050 Sobic003G373050 Sobic010G020000--Sobic003G373050 Sobic002G204700--Sobic003G394150 Sobic002G204700--Sobic001G143850 Sobic001G308350 Sobic001G308350 Sobic002G204700--Sobic001G308350 Sobic002G204700--Sobic002G395400 Sobic002G204700--Sobic009G053700 Sobic006G216150 Sobic006G216150 Sobic002G204700--Sobic006G216150 Sobic002G204700--Sobic001G035700 Sobic002G204700--Sobic010G172633 Sobic002G204700--Sobic004G224733
Octagon: transcription factors


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