Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G001700.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6P5W9
Pfam PF11820
Panther DB PTHR33128 PTHR33128:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G08391 : Protein of unknown function (DUF 3339)
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g01280.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G118150 - -
2 Sobic.001G424650 - -
3 Sobic.001G334400 protein kinase, putative, expressed -
4 Sobic.002G274000 OsSub59 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
5 Sobic.008G141700 heparanase-like protein precursor, putative, expressed K07964: heparanase
6 Sobic.009G079700 C2 domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.005G110553 - -
8 Sobic.008G016400 - -
9 Sobic.010G249600 macrophage migration inhibitory factor, putative, expressed -
10 Sobic.002G296800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cell cycle control protein, putative, expressed -
11 Sobic.004G224000 - -
12 Sobic.009G088300 SHR5-receptor-like kinase, putative, expressed -
13 Sobic.009G122000 Annexin arabidopsis 3(PubMedID : 26320239)@annexin, putative, expressed -
14 Sobic.009G183650 - -
15 Sobic.001G492400 male sterility protein, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
16 Sobic.006G255200 - -
17 Sobic.004G127600 glyoxalase family protein, putative, expressed K01759: GLO1, lactoylglutathione lyase
18 Sobic.010G129100 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
19 Sobic.003G443601 - -
20 Sobic.008G153300 RING-H2 finger protein ATL3J, putative, expressed K10663: E3 ubiquitin-protein ligase ATL4


Gene co-expression network
sample Sobic009G001700 Sobic009G001700 Sobic006G118150 Sobic006G118150 Sobic009G001700--Sobic006G118150 Sobic001G424650 Sobic001G424650 Sobic009G001700--Sobic001G424650 Sobic001G334400 Sobic001G334400 Sobic009G001700--Sobic001G334400 Sobic002G274000 Sobic002G274000 Sobic009G001700--Sobic002G274000 Sobic008G141700 Sobic008G141700 Sobic009G001700--Sobic008G141700 Sobic009G079700 Sobic009G079700 Sobic009G001700--Sobic009G079700 Sobic005G110553 Sobic005G110553 Sobic009G001700--Sobic005G110553 Sobic008G016400 Sobic008G016400 Sobic009G001700--Sobic008G016400 Sobic010G249600 Sobic010G249600 Sobic009G001700--Sobic010G249600 Sobic006G118150--Sobic008G016400 Sobic004G224000 Sobic004G224000 Sobic006G118150--Sobic004G224000 Sobic006G118150--Sobic001G424650 Sobic001G492400 Sobic001G492400 Sobic006G118150--Sobic001G492400 Sobic009G122000 Sobic009G122000 Sobic006G118150--Sobic009G122000 Sobic003G149400 Sobic003G149400 Sobic006G118150--Sobic003G149400 Sobic007G077466 Sobic007G077466 Sobic006G118150--Sobic007G077466 Sobic001G503700 Sobic001G503700 Sobic006G118150--Sobic001G503700 Sobic006G165700 Sobic006G165700 Sobic006G118150--Sobic006G165700 Sobic009G088300 Sobic009G088300 Sobic001G424650--Sobic009G088300 Sobic001G424650--Sobic001G492400 Sobic001G424650--Sobic005G110553 Sobic001G370800 Sobic001G370800 Sobic001G424650--Sobic001G370800 Sobic001G442000 Sobic001G442000 Sobic001G424650--Sobic001G442000 Sobic001G424650--Sobic009G122000 Sobic001G424650--Sobic001G334400 Sobic001G424650--Sobic004G224000 Sobic006G255200 Sobic006G255200 Sobic001G424650--Sobic006G255200 Sobic009G183650 Sobic009G183650 Sobic001G334400--Sobic009G183650 Sobic001G334400--Sobic002G274000 Sobic001G334400--Sobic009G088300 Sobic001G334400--Sobic001G424650 Sobic004G218400 Sobic004G218400 Sobic001G334400--Sobic004G218400 Sobic006G268100 Sobic006G268100 Sobic001G334400--Sobic006G268100 Sobic002G398600 Sobic002G398600 Sobic001G334400--Sobic002G398600 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic001G334400--Sobic004G072201 Sobic001G334400--Sobic006G255200 Sobic002G274000--Sobic004G218400 Sobic002G274000--Sobic001G334400 Sobic002G274000--Sobic006G268100 Sobic003G067600 Sobic003G067600 Sobic002G274000--Sobic003G067600 Sobic003G001650 Sobic003G001650 Sobic002G274000--Sobic003G001650 Sobic004G173200 Sobic004G173200 Sobic002G274000--Sobic004G173200 Sobic002G274000--Sobic005G110553 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic002G274000--Sobic002G309300 Sobic002G274000--Sobic001G370800 Sobic003G443601 Sobic003G443601 Sobic008G141700--Sobic003G443601 Sobic003G069601 Sobic003G069601 Sobic008G141700--Sobic003G069601 Sobic008G141700--Sobic009G088300 Sobic008G141700--Sobic001G334400 Sobic008G141700--Sobic001G424650 Sobic008G141700--Sobic006G255200 Sobic010G129100 Sobic010G129100 Sobic008G141700--Sobic010G129100 Sobic001G212900 Sobic001G212900 Sobic008G141700--Sobic001G212900 Sobic004G127600 Sobic004G127600 Sobic008G141700--Sobic004G127600 Sobic010G210400 Sobic010G210400 Sobic009G079700--Sobic010G210400 Sobic009G079700--Sobic005G110553 Sobic009G079700--Sobic001G334400 Sobic009G079700--Sobic006G268100 Sobic009G079700--Sobic002G274000 Sobic004G007200 Sobic004G007200 Sobic009G079700--Sobic004G007200 Sobic009G079700--Sobic009G183650 Sobic004G343733 Sobic004G343733 Sobic009G079700--Sobic004G343733 Sobic008G153300 Sobic008G153300 Sobic009G079700--Sobic008G153300 Sobic005G110553--Sobic009G122000 Sobic005G110553--Sobic001G424650 Sobic005G110553--Sobic003G149400 Sobic005G110553--Sobic006G268100 Sobic008G065700 Sobic008G065700 Sobic005G110553--Sobic008G065700 Sobic005G110553--Sobic004G224000 Sobic005G110553--Sobic001G334400 Sobic005G110553--Sobic009G183650 Sobic007G210200 Sobic007G210200 Sobic005G110553--Sobic007G210200 Sobic008G016400--Sobic001G424650 Sobic008G016400--Sobic007G077466 Sobic008G016400--Sobic006G118150 Sobic008G016400--Sobic009G183650 Sobic008G016400--Sobic001G212900 Sobic009G149600 Sobic009G149600 Sobic008G016400--Sobic009G149600 Sobic008G016400--Sobic001G334400 Sobic008G016400--Sobic004G224000 Sobic008G016400--Sobic001G492400 Sobic003G440500 Sobic003G440500 Sobic010G249600--Sobic003G440500 Sobic010G249600--Sobic002G398600 Sobic002G377400 Sobic002G377400 Sobic010G249600--Sobic002G377400 Sobic003G308900 Sobic003G308900 Sobic010G249600--Sobic003G308900 Sobic008G016800 Sobic008G016800 Sobic010G249600--Sobic008G016800 Sobic009G223900 Sobic009G223900 Sobic010G249600--Sobic009G223900 Sobic002G085600 Sobic002G085600 Sobic010G249600--Sobic002G085600 Sobic010G249600--Sobic004G224000 Sobic001G191300 Sobic001G191300 Sobic010G249600--Sobic001G191300
Octagon: transcription factors


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