Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G072300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R226
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G013800 OsMADS26 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
2 Sobic.004G055300 - -
3 Sobic.001G237100 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
4 Sobic.001G074800 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
5 Sobic.003G279700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
6 Sobic.003G358100 O-fucosyltransferase family protein(PubMedID : 26465154)@growth regulator related protein, putative, expressed -
7 Sobic.010G061300 receptor protein kinase, putative, expressed -
8 Sobic.009G207800 expressed protein -
9 Sobic.007G043750 - -
10 Sobic.006G035200 - -
11 Sobic.010G026850 - -
12 Sobic.008G014400 expressed protein -
13 Sobic.004G162100 - -
14 Sobic.010G002301 - -
15 Sobic.002G249700 OsWAK80 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
16 Sobic.001G465600 AMP-binding domain containing protein, expressed -
17 Sobic.003G139600 expressed protein -
18 Sobic.004G282966 - -
19 Sobic.002G286500 carrier, putative, expressed -
20 Sobic.006G094800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G072300 Sobic009G072300 Sobic007G013800 Sobic007G013800 Sobic009G072300--Sobic007G013800 Sobic004G055300 Sobic004G055300 Sobic009G072300--Sobic004G055300 Sobic001G237100 Sobic001G237100 Sobic009G072300--Sobic001G237100 Sobic001G074800 Sobic001G074800 Sobic009G072300--Sobic001G074800 Sobic003G279700 Sobic003G279700 Sobic009G072300--Sobic003G279700 Sobic003G358100 Sobic003G358100 Sobic009G072300--Sobic003G358100 Sobic010G061300 Sobic010G061300 Sobic009G072300--Sobic010G061300 Sobic009G207800 Sobic009G207800 Sobic009G072300--Sobic009G207800 Sobic007G043750 Sobic007G043750 Sobic009G072300--Sobic007G043750 Sobic007G145901 Sobic007G145901 Sobic007G013800--Sobic007G145901 Sobic007G013800--Sobic009G072300 Sobic002G172000 Sobic002G172000 Sobic007G013800--Sobic002G172000 Sobic007G013800--Sobic001G237100 Sobic003G395800 Sobic003G395800 Sobic007G013800--Sobic003G395800 Sobic007G013800--Sobic010G061300 Sobic001G299900 Sobic001G299900 Sobic007G013800--Sobic001G299900 Sobic003G311100 Sobic003G311100 Sobic007G013800--Sobic003G311100 Sobic002G367000 Sobic002G367000 Sobic007G013800--Sobic002G367000 Sobic004G055300--Sobic010G061300 Sobic004G055300--Sobic009G207800 Sobic004G055300--Sobic009G072300 Sobic004G055300--Sobic007G043750 Sobic006G094800 Sobic006G094800 Sobic004G055300--Sobic006G094800 Sobic008G016850 Sobic008G016850 Sobic004G055300--Sobic008G016850 Sobic004G055300--Sobic001G074800 Sobic003G376800 Sobic003G376800 Sobic004G055300--Sobic003G376800 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic004G055300--Sobic004G224733 Sobic001G205950 Sobic001G205950 Sobic001G237100--Sobic001G205950 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic001G237100--Sobic008G156800 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic001G237100--Sobic008G116800 Sobic003G238750 Sobic003G238750 Sobic001G237100--Sobic003G238750 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic001G237100--Sobic010G053700 Sobic001G090600 Sobic001G090600 Sobic001G237100--Sobic001G090600 Sobic010G176000 Sobic010G176000 Sobic001G237100--Sobic010G176000 Sobic003G406850 Sobic003G406850 Sobic001G237100--Sobic003G406850 Sobic001G062066 Sobic001G062066 Sobic001G237100--Sobic001G062066 Sobic002G249700 Sobic002G249700 Sobic001G074800--Sobic002G249700 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic001G074800--Sobic003G139600 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic001G074800--Sobic001G201933 Sobic001G074800--Sobic004G224733 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic001G074800--Sobic006G219400 Sobic004G282966 Sobic004G282966 Sobic001G074800--Sobic004G282966 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic001G074800--Sobic007G028300 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic001G074800--Sobic010G002301 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic001G074800--Sobic004G078200 Sobic003G279700--Sobic002G367000 Sobic003G279700--Sobic007G043750 Sobic003G257650 Sobic003G257650 Sobic003G279700--Sobic003G257650 Sobic003G373700 Sobic003G373700 Sobic003G279700--Sobic003G373700 Sobic005G078600 Sobic005G078600 Sobic003G279700--Sobic005G078600 Sobic010G020000 Sobic010G020000 Sobic003G279700--Sobic010G020000 Sobic003G394150 Sobic003G394150 Sobic003G279700--Sobic003G394150 Sobic001G089850 Sobic001G089850 Sobic003G279700--Sobic001G089850 Sobic003G198850 Sobic003G198850 Sobic003G279700--Sobic003G198850 Sobic003G097000 Sobic003G097000 Sobic003G358100--Sobic003G097000 Sobic006G164500 Sobic006G164500 Sobic003G358100--Sobic006G164500 Sobic004G098100 Sobic004G098100 Sobic003G358100--Sobic004G098100 Sobic003G358100--Sobic002G249700 Sobic003G172300 Sobic003G172300 Sobic003G358100--Sobic003G172300 Sobic007G145801 Sobic007G145801 Sobic003G358100--Sobic007G145801 Sobic006G016950 Sobic006G016950 Sobic003G358100--Sobic006G016950 Sobic001G502801 Sobic001G502801 Sobic003G358100--Sobic001G502801 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic003G358100--Sobic005G139750 Sobic007G006000 Sobic007G006000 Sobic010G061300--Sobic007G006000 Sobic010G061300--Sobic004G055300 Sobic002G325000 Sobic002G325000 Sobic010G061300--Sobic002G325000 Sobic010G244800 Sobic010G244800 Sobic010G061300--Sobic010G244800 Sobic008G043450 Sobic008G043450 Sobic010G061300--Sobic008G043450 Sobic010G061300--Sobic003G373700 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic010G061300--Sobic001G440401 Sobic002G168750 Sobic002G168750 Sobic010G061300--Sobic002G168750 Sobic005G183900 Sobic005G183900 Sobic010G061300--Sobic005G183900 Sobic009G207800--Sobic004G055300 Sobic009G207800--Sobic009G072300 Sobic009G207800--Sobic006G094800 Sobic007G227500 Sobic007G227500 Sobic009G207800--Sobic007G227500 Sobic006G216500 Sobic006G216500 Sobic009G207800--Sobic006G216500 Sobic010G086400 Sobic010G086400 Sobic009G207800--Sobic010G086400 Sobic009G207800--Sobic007G043750 Sobic003G444900 Sobic003G444900 Sobic009G207800--Sobic003G444900 Sobic009G207800--Sobic010G061300 Sobic003G432400 Sobic003G432400 Sobic007G043750--Sobic003G432400 Sobic009G258000 Sobic009G258000 Sobic007G043750--Sobic009G258000 Sobic004G175800 Sobic004G175800 Sobic007G043750--Sobic004G175800 Sobic007G043750--Sobic003G394150 Sobic007G043750--Sobic003G257650 Sobic002G395400 Sobic002G395400 Sobic007G043750--Sobic002G395400 Sobic008G179400 Sobic008G179400 Sobic007G043750--Sobic008G179400 Sobic010G226100 Sobic010G226100 Sobic007G043750--Sobic010G226100 Sobic001G035700 Sobic001G035700 Sobic007G043750--Sobic001G035700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.