Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G094800.1
Synonym Sb06g017940
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RDY1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g36820.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056143 , Zm00025a011223
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G094800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G206600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@tyrosine phosphatase, putative, expressed -
2 Sobic.001G207301 - -
3 Sobic.009G218700 pentatricopeptide, putative, expressed -
4 Sobic.003G314200 TKL_IRAK_DUF26-lc.7 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
5 Sobic.003G226600 WRKY12, expressed -
6 Sobic.001G450900 UNE2, putative, expressed -
7 Sobic.006G100150 - -
8 Sobic.010G186900 - -
9 Sobic.001G148000 a WRKY transcription factor which regulates cell wall biosynthesis genes. Seed shattering-related gene.(PubMedID : 24019506)@WRKY60, expressed -
10 Sobic.008G033800 ABCG protein(PubMedID : 21265893)@pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
11 Sobic.003G169700 - -
12 Sobic.004G252600 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
13 Sobic.007G028300 - -
14 Sobic.005G021400 - -
15 Sobic.009G260550 - -
16 Sobic.006G205800 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G303900 - -
18 Sobic.004G078200 - -
19 Sobic.002G220400 - -
20 Sobic.002G337400 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G094800 Sobic006G094800 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic006G094800--Sobic006G206600 Sobic001G207301 Sobic001G207301 Sobic006G094800--Sobic001G207301 Sobic009G218700 Sobic009G218700 Sobic006G094800--Sobic009G218700 Sobic003G314200 Sobic003G314200 Sobic006G094800--Sobic003G314200 Sobic003G226600 Sobic003G226600 Sobic006G094800--Sobic003G226600 Sobic001G450900 Sobic001G450900 Sobic006G094800--Sobic001G450900 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic006G094800--Sobic006G100150 Sobic010G186900 Sobic010G186900 Sobic006G094800--Sobic010G186900 Sobic001G148000 Sobic001G148000 Sobic006G094800--Sobic001G148000 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic006G206600--Sobic007G028300 Sobic006G206600--Sobic006G100150 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic006G206600--Sobic004G078200 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic006G206600--Sobic004G303900 Sobic006G206600--Sobic009G218700 Sobic006G135701 Sobic006G135701 Sobic006G206600--Sobic006G135701 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic006G206600--Sobic001G118050 Sobic002G088300 Sobic002G088300 Sobic006G206600--Sobic002G088300 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic006G206600--Sobic007G113566 Sobic003G169700 Sobic003G169700 Sobic001G207301--Sobic003G169700 SobicK031400 SobicK031400 Sobic001G207301--SobicK031400 Sobic006G217400 Sobic006G217400 Sobic001G207301--Sobic006G217400 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic001G207301--Sobic004G332200 Sobic006G205800 Sobic006G205800 Sobic001G207301--Sobic006G205800 Sobic006G261650 Sobic006G261650 Sobic001G207301--Sobic006G261650 Sobic003G163000 Sobic003G163000 Sobic001G207301--Sobic003G163000 Sobic001G420150 Sobic001G420150 Sobic001G207301--Sobic001G420150 Sobic004G291300 Sobic004G291300 Sobic001G207301--Sobic004G291300 Sobic009G218700--Sobic006G206600 Sobic009G218700--Sobic003G169700 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic009G218700--Sobic002G220400 Sobic009G218700--Sobic006G100150 Sobic009G218700--Sobic004G303900 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic009G218700--Sobic009G260550 Sobic002G198900 Sobic002G198900 Sobic009G218700--Sobic002G198900 Sobic009G218700--Sobic007G028300 Sobic003G169800 Sobic003G169800 Sobic009G218700--Sobic003G169800 Sobic008G040800 Sobic008G040800 Sobic003G314200--Sobic008G040800 Sobic003G314200--Sobic006G205800 Sobic003G314200--Sobic006G094800 Sobic003G314200--Sobic001G148000 Sobic003G314200--Sobic003G226600 Sobic009G027200 Sobic009G027200 Sobic003G314200--Sobic009G027200 Sobic003G314200--Sobic001G207301 Sobic001G501701 Sobic001G501701 Sobic003G314200--Sobic001G501701 Sobic004G338200 Sobic004G338200 Sobic003G314200--Sobic004G338200 Sobic003G226600--Sobic001G450900 Sobic005G021400 Sobic005G021400 Sobic003G226600--Sobic005G021400 Sobic003G226600--Sobic001G207301 Sobic005G104900 Sobic005G104900 Sobic003G226600--Sobic005G104900 Sobic003G226600--Sobic006G217400 Sobic001G535850 Sobic001G535850 Sobic003G226600--Sobic001G535850 Sobic002G401533 Sobic002G401533 Sobic003G226600--Sobic002G401533 Sobic003G226600--Sobic009G027200 Sobic003G161900 Sobic003G161900 Sobic003G226600--Sobic003G161900 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic001G450900--Sobic004G019550 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic001G450900--Sobic001G154000 Sobic010G035600 Sobic010G035600 Sobic001G450900--Sobic010G035600 Sobic003G286450 Sobic003G286450 Sobic001G450900--Sobic003G286450 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic001G450900--Sobic001G476800 Sobic001G450900--Sobic001G535850 Sobic007G065000 Sobic007G065000 Sobic001G450900--Sobic007G065000 Sobic005G139750 Sobic005G139750 Sobic001G450900--Sobic005G139750 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic001G450900--Sobic008G171200 Sobic006G100150--Sobic004G303900 Sobic006G100150--Sobic004G078200 Sobic006G100150--Sobic007G028300 Sobic006G100150--Sobic009G260550 Sobic004G252600 Sobic004G252600 Sobic006G100150--Sobic004G252600 Sobic006G100150--Sobic003G169700 Sobic006G100150--Sobic001G118050 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic006G100150--Sobic004G207800 Sobic006G100150--Sobic006G206600 Sobic010G186900--Sobic002G220400 Sobic010G186900--Sobic001G154000 Sobic010G186900--Sobic004G019550 Sobic010G186900--Sobic001G535850 Sobic010G186900--Sobic009G260550 Sobic003G173116 Sobic003G173116 Sobic010G186900--Sobic003G173116 Sobic010G186900--Sobic003G286450 Sobic003G159101 Sobic003G159101 Sobic010G186900--Sobic003G159101 Sobic007G011100 Sobic007G011100 Sobic010G186900--Sobic007G011100 Sobic002G413100 Sobic002G413100 Sobic001G148000--Sobic002G413100 Sobic004G176950 Sobic004G176950 Sobic001G148000--Sobic004G176950 Sobic002G245700 Sobic002G245700 Sobic001G148000--Sobic002G245700 Sobic001G148000--Sobic001G450900 Sobic005G093901 Sobic005G093901 Sobic001G148000--Sobic005G093901 Sobic010G268500 Sobic010G268500 Sobic001G148000--Sobic010G268500 Sobic001G022700 Sobic001G022700 Sobic001G148000--Sobic001G022700 Sobic002G423901 Sobic002G423901 Sobic001G148000--Sobic002G423901 Sobic001G148000--Sobic002G220400
Octagon: transcription factors


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