Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G087600.1
Synonym SD2-5, Sb09g008070
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed
UniProt C5YV85
Pfam PF00024 PF00954 PF01453 PF00069
Panther DB PTHR27002 PTHR27002:SF146
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G32300 : S-domain-2 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g30890.1 : S-locus-like receptor protein kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043217
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G120420.1 , HORVU5Hr1G120420.2 , HORVU5Hr1G120420.3
Wheat TraesCS5B02G532700 , TraesCS5B02G532700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.010G088100 ADP-ribosylation factor 1, putative, expressed K07977: Arf/Sar family, other


Gene co-expression network
sample Sobic009G087600 Sobic009G087600 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic009G087600--Sobic009G026700 Sobic004G033650 Sobic004G033650 Sobic009G087600--Sobic004G033650 Sobic004G118000 Sobic004G118000 Sobic009G087600--Sobic004G118000 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic009G087600--Sobic006G072701 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic009G087600--Sobic008G142200 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic009G087600--Sobic008G083100 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic009G087600--Sobic009G074800 Sobic001G001800 Sobic001G001800 Sobic009G087600--Sobic001G001800 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic009G087600--Sobic001G191500 Sobic009G026700--Sobic009G074800 Sobic009G026700--Sobic006G072701 Sobic009G026700--Sobic004G033650 Sobic009G026700--Sobic008G142200 Sobic009G026700--Sobic008G083100 Sobic010G183350 Sobic010G183350 Sobic009G026700--Sobic010G183350 Sobic008G190600 Sobic008G190600 Sobic009G026700--Sobic008G190600 Sobic009G026700--Sobic001G001800 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic009G026700--Sobic001G250750 Sobic004G033650--Sobic001G001800 Sobic004G033650--Sobic009G074800 Sobic004G033650--Sobic008G083100 Sobic004G033650--Sobic008G142200 Sobic004G033650--Sobic009G026700 Sobic004G033650--Sobic001G191500 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic004G033650--Sobic007G141900 Sobic004G033650--Sobic008G190600 Sobic004G033650--Sobic004G118000 Sobic004G118000--Sobic004G033650 Sobic004G118000--Sobic001G191500 Sobic002G209450 Sobic002G209450 Sobic004G118000--Sobic002G209450 Sobic004G118000--Sobic006G072701 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic004G118000--Sobic010G088100 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic004G118000--Sobic006G041200 Sobic002G413700 Sobic002G413700 Sobic004G118000--Sobic002G413700 Sobic004G118000--Sobic008G083100 Sobic004G118000--Sobic009G026700 Sobic006G072701--Sobic008G083100 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic006G072701--Sobic004G084600 Sobic006G072701--Sobic001G191500 Sobic006G072701--Sobic009G026700 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic006G072701--Sobic002G171901 Sobic007G182300 Sobic007G182300 Sobic006G072701--Sobic007G182300 Sobic006G072701--Sobic006G041200 Sobic006G072701--Sobic009G074800 Sobic006G072701--Sobic001G250750 Sobic004G227700 Sobic004G227700 Sobic008G142200--Sobic004G227700 Sobic008G142200--Sobic001G191500 Sobic009G094200 Sobic009G094200 Sobic008G142200--Sobic009G094200 Sobic008G142200--Sobic008G190600 Sobic003G263900 Sobic003G263900 Sobic008G142200--Sobic003G263900 Sobic008G142200--Sobic004G033650 Sobic008G142200--Sobic009G026700 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic008G142200--Sobic001G038700 Sobic008G072800 Sobic008G072800 Sobic008G142200--Sobic008G072800 Sobic008G083100--Sobic006G072701 Sobic008G083100--Sobic004G033650 Sobic008G083100--Sobic001G191500 Sobic008G113200 Sobic008G113200 Sobic008G083100--Sobic008G113200 Sobic008G083100--Sobic009G074800 Sobic008G083100--Sobic009G026700 Sobic008G083100--Sobic007G182300 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic008G083100--Sobic002G226200 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic008G083100--Sobic004G255550 Sobic009G074800--Sobic008G190600 Sobic009G074800--Sobic009G026700 Sobic009G074800--Sobic004G033650 Sobic009G074800--Sobic008G083100 Sobic003G272000 Sobic003G272000 Sobic009G074800--Sobic003G272000 Sobic009G074800--Sobic006G072701 Sobic009G074800--Sobic001G250750 Sobic009G074800--Sobic001G001800 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic009G074800--Sobic003G375500 Sobic001G001800--Sobic004G033650 Sobic001G001800--Sobic009G094200 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic001G001800--Sobic009G026600 Sobic001G001800--Sobic009G074800 Sobic001G001800--Sobic008G142200 Sobic001G001800--Sobic001G191500 Sobic001G001800--Sobic009G026700 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic001G001800--Sobic009G186300 Sobic001G001800--Sobic001G038700 Sobic001G191500--Sobic008G190600 Sobic001G191500--Sobic008G142200 Sobic009G137401 Sobic009G137401 Sobic001G191500--Sobic009G137401 Sobic006G157450 Sobic006G157450 Sobic001G191500--Sobic006G157450 Sobic001G191500--Sobic006G072701 Sobic001G190900 Sobic001G190900 Sobic001G191500--Sobic001G190900 Sobic001G191500--Sobic008G083100 Sobic001G191500--Sobic004G033650 Sobic001G191500--Sobic009G074800
Octagon: transcription factors


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