Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G097100.1
Synonym Sb09g013790, ATAZG1, AZG1
Functional annotation permease domain containing protein, putative, expressed
UniProt C5YVV1
Pfam PF00860
Panther DB PTHR11119 PTHR11119:SF9
NCBI CDD -
KEGG Orthology K06901; putative MFS transporter, AGZA family, xanthine/uracil permease
Gene Ontology GO:0016020; membrane GO:0006810transport GO:0005215transporter activity GO:0006863purine nucleobase transport GO:0005345purine nucleobase transmembrane transporter activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G10960 : AZA-guanine resistant1
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g26840.1 : permease domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043495
Brachypodium PNT71543
Barley HORVU1Hr1G012240.2 , HORVU1Hr1G012240.1
Wheat -
Populus PNT07392


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G193000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
2 Sobic.009G205700 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
3 Sobic.003G361900 dehydrodolichyl diphosphate synthase, putative, expressed K11778: DHDDS, RER2, ditrans,polycis-polyprenyl diphosphate synthase
4 Sobic.008G054100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
5 Sobic.005G203300 tropinone reductase 2, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
6 Sobic.004G258400 aspartic proteinase nepenthesin-2 precursor, putative, expressed -
7 Sobic.009G037200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@transferase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.001G363200 expressed protein -
9 Sobic.003G401500 expressed protein -
10 Sobic.007G089300 TKL_IRAK_DUF26-lc.7 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
11 Sobic.002G257100 regulatory protein, putative, expressed -
12 Sobic.010G221032 - -
13 Sobic.001G449800 OsWAK25 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
14 Sobic.010G157500 zinc finger protein, putative, expressed -
15 Sobic.006G187401 - -
16 Sobic.009G019100 expressed protein K13473: chitin elicitor-binding protein
17 Sobic.003G366100 expressed protein -
18 Sobic.001G136300 nodulin family protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G046900 HNH endonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
20 Sobic.006G231600 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G097100 Sobic009G097100 Sobic010G193000 Sobic010G193000 Sobic009G097100--Sobic010G193000 Sobic009G205700 Sobic009G205700 Sobic009G097100--Sobic009G205700 Sobic003G361900 Sobic003G361900 Sobic009G097100--Sobic003G361900 Sobic008G054100 Sobic008G054100 Sobic009G097100--Sobic008G054100 Sobic005G203300 Sobic005G203300 Sobic009G097100--Sobic005G203300 Sobic004G258400 Sobic004G258400 Sobic009G097100--Sobic004G258400 Sobic009G037200 Sobic009G037200 Sobic009G097100--Sobic009G037200 Sobic001G363200 Sobic001G363200 Sobic009G097100--Sobic001G363200 Sobic003G401500 Sobic003G401500 Sobic009G097100--Sobic003G401500 Sobic010G193000--Sobic005G203300 Sobic008G065200 Sobic008G065200 Sobic010G193000--Sobic008G065200 Sobic010G193000--Sobic009G037200 Sobic002G257100 Sobic002G257100 Sobic010G193000--Sobic002G257100 Sobic004G224500 Sobic004G224500 Sobic010G193000--Sobic004G224500 Sobic004G099700 Sobic004G099700 Sobic010G193000--Sobic004G099700 Sobic001G404500 Sobic001G404500 Sobic010G193000--Sobic001G404500 Sobic001G314900 Sobic001G314900 Sobic010G193000--Sobic001G314900 Sobic002G046900 Sobic002G046900 Sobic010G193000--Sobic002G046900 Sobic009G205700--Sobic005G203300 Sobic009G205700--Sobic002G046900 Sobic008G063100 Sobic008G063100 Sobic009G205700--Sobic008G063100 Sobic006G110900 Sobic006G110900 Sobic009G205700--Sobic006G110900 Sobic004G343100 Sobic004G343100 Sobic009G205700--Sobic004G343100 Sobic009G205700--Sobic004G224500 Sobic005G175600 Sobic005G175600 Sobic009G205700--Sobic005G175600 Sobic005G021600 Sobic005G021600 Sobic009G205700--Sobic005G021600 Sobic009G205700--Sobic010G193000 Sobic008G111300 Sobic008G111300 Sobic003G361900--Sobic008G111300 Sobic010G130800 Sobic010G130800 Sobic003G361900--Sobic010G130800 Sobic001G320700 Sobic001G320700 Sobic003G361900--Sobic001G320700 Sobic003G361900--Sobic002G046900 Sobic006G201100 Sobic006G201100 Sobic003G361900--Sobic006G201100 Sobic005G045200 Sobic005G045200 Sobic003G361900--Sobic005G045200 Sobic004G164200 Sobic004G164200 Sobic003G361900--Sobic004G164200 Sobic001G448300 Sobic001G448300 Sobic003G361900--Sobic001G448300 Sobic004G068700 Sobic004G068700 Sobic003G361900--Sobic004G068700 Sobic003G366100 Sobic003G366100 Sobic008G054100--Sobic003G366100 Sobic002G064200 Sobic002G064200 Sobic008G054100--Sobic002G064200 Sobic003G256000 Sobic003G256000 Sobic008G054100--Sobic003G256000 Sobic008G054100--Sobic001G363200 Sobic005G193500 Sobic005G193500 Sobic008G054100--Sobic005G193500 Sobic008G060300 Sobic008G060300 Sobic008G054100--Sobic008G060300 Sobic002G173900 Sobic002G173900 Sobic008G054100--Sobic002G173900 Sobic010G172300 Sobic010G172300 Sobic008G054100--Sobic010G172300 Sobic008G054100--Sobic004G099700 Sobic005G203300--Sobic010G193000 Sobic005G171300 Sobic005G171300 Sobic005G203300--Sobic005G171300 Sobic005G203300--Sobic002G046900 Sobic006G164300 Sobic006G164300 Sobic005G203300--Sobic006G164300 Sobic005G203300--Sobic009G205700 Sobic005G203300--Sobic004G224500 Sobic005G203300--Sobic009G037200 Sobic005G203300--Sobic001G404500 Sobic009G019100 Sobic009G019100 Sobic005G203300--Sobic009G019100 Sobic004G258400--Sobic002G257100 Sobic008G142100 Sobic008G142100 Sobic004G258400--Sobic008G142100 Sobic001G136300 Sobic001G136300 Sobic004G258400--Sobic001G136300 Sobic002G041800 Sobic002G041800 Sobic004G258400--Sobic002G041800 Sobic001G450500 Sobic001G450500 Sobic004G258400--Sobic001G450500 Sobic006G246200 Sobic006G246200 Sobic004G258400--Sobic006G246200 Sobic005G093300 Sobic005G093300 Sobic004G258400--Sobic005G093300 Sobic001G362001 Sobic001G362001 Sobic004G258400--Sobic001G362001 Sobic004G258400--Sobic009G037200 Sobic009G037200--Sobic010G193000 Sobic009G037200--Sobic006G246200 Sobic009G037200--Sobic002G257100 Sobic009G037200--Sobic005G203300 Sobic005G217700 Sobic005G217700 Sobic009G037200--Sobic005G217700 Sobic007G157100 Sobic007G157100 Sobic009G037200--Sobic007G157100 Sobic009G037200--Sobic001G136300 Sobic005G085500 Sobic005G085500 Sobic009G037200--Sobic005G085500 Sobic007G089300 Sobic007G089300 Sobic009G037200--Sobic007G089300 Sobic004G160300 Sobic004G160300 Sobic001G363200--Sobic004G160300 Sobic004G181200 Sobic004G181200 Sobic001G363200--Sobic004G181200 Sobic002G354400 Sobic002G354400 Sobic001G363200--Sobic002G354400 Sobic003G258700 Sobic003G258700 Sobic001G363200--Sobic003G258700 Sobic002G202800 Sobic002G202800 Sobic001G363200--Sobic002G202800 Sobic001G363200--Sobic002G173900 Sobic001G363200--Sobic002G064200 Sobic003G037100 Sobic003G037100 Sobic001G363200--Sobic003G037100 Sobic001G363200--Sobic003G256000 Sobic001G330925 Sobic001G330925 Sobic003G401500--Sobic001G330925 Sobic009G173800 Sobic009G173800 Sobic003G401500--Sobic009G173800 Sobic003G401500--Sobic002G064200 Sobic001G448800 Sobic001G448800 Sobic003G401500--Sobic001G448800 Sobic009G233900 Sobic009G233900 Sobic003G401500--Sobic009G233900 Sobic004G179500 Sobic004G179500 Sobic003G401500--Sobic004G179500 Sobic004G138400 Sobic004G138400 Sobic003G401500--Sobic004G138400 Sobic009G115500 Sobic009G115500 Sobic003G401500--Sobic009G115500 Sobic009G082800 Sobic009G082800 Sobic003G401500--Sobic009G082800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.