Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G401500.1
Synonym Sb03g043770
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XG79
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g68800.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039344
Brachypodium KQK11191
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G330925 - -
2 Sobic.009G173800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@RING-H2 finger protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G064200 expressed protein -
4 Sobic.001G448800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@lecithin cholesterol acyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.009G233900 dehydrogenase, putative, expressed -
6 Sobic.004G179500 APO, putative, expressed -
7 Sobic.004G138400 WRKY51, expressed -
8 Sobic.009G115500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
9 Sobic.009G082800 - -
10 Sobic.003G325100 NB-ARC domain containing protein, expressed -
11 Sobic.008G095100 SAM domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G449800 OsWAK25 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
13 Sobic.002G202800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@WRKY62, expressed -
14 Sobic.006G187401 - -
15 Sobic.002G130500 expressed protein -
16 Sobic.001G299400 metalloendoproteinase 1 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.004G109100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
18 Sobic.009G192100 DUF567 domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.006G007450 - -
20 Sobic.002G202700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@WRKY76, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G401500 Sobic003G401500 Sobic001G330925 Sobic001G330925 Sobic003G401500--Sobic001G330925 Sobic009G173800 Sobic009G173800 Sobic003G401500--Sobic009G173800 Sobic002G064200 Sobic002G064200 Sobic003G401500--Sobic002G064200 Sobic001G448800 Sobic001G448800 Sobic003G401500--Sobic001G448800 Sobic009G233900 Sobic009G233900 Sobic003G401500--Sobic009G233900 Sobic004G179500 Sobic004G179500 Sobic003G401500--Sobic004G179500 Sobic004G138400 Sobic004G138400 Sobic003G401500--Sobic004G138400 Sobic009G115500 Sobic009G115500 Sobic003G401500--Sobic009G115500 Sobic009G082800 Sobic009G082800 Sobic003G401500--Sobic009G082800 Sobic001G330925--Sobic004G138400 Sobic002G202800 Sobic002G202800 Sobic001G330925--Sobic002G202800 Sobic001G330925--Sobic009G115500 Sobic002G214500 Sobic002G214500 Sobic001G330925--Sobic002G214500 Sobic001G330925--Sobic003G401500 Sobic003G242800 Sobic003G242800 Sobic001G330925--Sobic003G242800 Sobic003G325100 Sobic003G325100 Sobic001G330925--Sobic003G325100 Sobic003G258700 Sobic003G258700 Sobic001G330925--Sobic003G258700 Sobic002G354400 Sobic002G354400 Sobic001G330925--Sobic002G354400 Sobic009G173800--Sobic009G115500 Sobic008G095100 Sobic008G095100 Sobic009G173800--Sobic008G095100 Sobic009G173800--Sobic002G064200 Sobic009G173800--Sobic003G401500 Sobic009G173800--Sobic002G202800 Sobic009G173800--Sobic003G325100 Sobic009G173800--Sobic009G082800 Sobic003G086200 Sobic003G086200 Sobic009G173800--Sobic003G086200 Sobic002G173900 Sobic002G173900 Sobic009G173800--Sobic002G173900 Sobic002G064200--Sobic002G202800 Sobic002G064200--Sobic009G115500 Sobic010G172300 Sobic010G172300 Sobic002G064200--Sobic010G172300 Sobic002G202700 Sobic002G202700 Sobic002G064200--Sobic002G202700 Sobic010G225500 Sobic010G225500 Sobic002G064200--Sobic010G225500 Sobic002G130500 Sobic002G130500 Sobic002G064200--Sobic002G130500 Sobic002G064200--Sobic002G173900 Sobic006G007450 Sobic006G007450 Sobic002G064200--Sobic006G007450 Sobic001G363200 Sobic001G363200 Sobic002G064200--Sobic001G363200 Sobic004G007500 Sobic004G007500 Sobic001G448800--Sobic004G007500 Sobic009G075100 Sobic009G075100 Sobic001G448800--Sobic009G075100 Sobic001G448800--Sobic004G179500 Sobic002G174801 Sobic002G174801 Sobic001G448800--Sobic002G174801 Sobic004G078600 Sobic004G078600 Sobic001G448800--Sobic004G078600 Sobic003G214000 Sobic003G214000 Sobic001G448800--Sobic003G214000 Sobic009G000900 Sobic009G000900 Sobic001G448800--Sobic009G000900 Sobic001G448800--Sobic009G233900 Sobic001G320700 Sobic001G320700 Sobic001G448800--Sobic001G320700 Sobic001G056500 Sobic001G056500 Sobic009G233900--Sobic001G056500 Sobic009G233900--Sobic009G075100 Sobic004G209500 Sobic004G209500 Sobic009G233900--Sobic004G209500 Sobic002G423600 Sobic002G423600 Sobic009G233900--Sobic002G423600 Sobic009G233900--Sobic004G078600 Sobic004G217700 Sobic004G217700 Sobic009G233900--Sobic004G217700 Sobic001G201800 Sobic001G201800 Sobic009G233900--Sobic001G201800 Sobic001G449800 Sobic001G449800 Sobic009G233900--Sobic001G449800 Sobic009G115400 Sobic009G115400 Sobic009G233900--Sobic009G115400 Sobic004G179500--Sobic001G448800 Sobic004G179500--Sobic006G007450 Sobic003G255100 Sobic003G255100 Sobic004G179500--Sobic003G255100 Sobic010G182800 Sobic010G182800 Sobic004G179500--Sobic010G182800 Sobic001G198700 Sobic001G198700 Sobic004G179500--Sobic001G198700 Sobic004G179500--Sobic003G401500 Sobic001G452700 Sobic001G452700 Sobic004G179500--Sobic001G452700 Sobic004G179500--Sobic002G064200 Sobic004G179500--Sobic008G095100 Sobic004G138400--Sobic003G325100 Sobic009G111800 Sobic009G111800 Sobic004G138400--Sobic009G111800 Sobic004G138400--Sobic001G330925 Sobic004G138400--Sobic002G202800 Sobic004G106200 Sobic004G106200 Sobic004G138400--Sobic004G106200 Sobic004G109100 Sobic004G109100 Sobic004G138400--Sobic004G109100 Sobic004G138400--Sobic003G242800 Sobic001G321700 Sobic001G321700 Sobic004G138400--Sobic001G321700 Sobic001G476100 Sobic001G476100 Sobic004G138400--Sobic001G476100 Sobic009G115500--Sobic002G064200 Sobic010G046900 Sobic010G046900 Sobic009G115500--Sobic010G046900 Sobic009G115500--Sobic002G202800 Sobic009G115500--Sobic002G130500 Sobic009G115500--Sobic002G202700 Sobic009G115300 Sobic009G115300 Sobic009G115500--Sobic009G115300 Sobic009G115500--Sobic002G173900 Sobic009G115500--Sobic009G173800 Sobic006G123400 Sobic006G123400 Sobic009G115500--Sobic006G123400 Sobic009G082800--Sobic002G064200 Sobic004G303500 Sobic004G303500 Sobic009G082800--Sobic004G303500 Sobic009G082800--Sobic010G172300 Sobic009G082800--Sobic009G115300 Sobic009G082800--Sobic010G225500 Sobic009G082800--Sobic010G046900 Sobic009G082800--Sobic002G202700 Sobic009G082800--Sobic008G095100 Sobic009G082800--Sobic002G173900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.