Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G109100.3
Synonym Sb04g008920
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RMV2
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF165
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G40070 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g15010.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.003G172400 conserved hypothetical protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G109100 Sobic004G109100 Sobic004G106200 Sobic004G106200 Sobic004G109100--Sobic004G106200 Sobic009G111800 Sobic009G111800 Sobic004G109100--Sobic009G111800 Sobic010G046900 Sobic010G046900 Sobic004G109100--Sobic010G046900 Sobic001G321700 Sobic001G321700 Sobic004G109100--Sobic001G321700 Sobic002G130200 Sobic002G130200 Sobic004G109100--Sobic002G130200 Sobic005G060400 Sobic005G060400 Sobic004G109100--Sobic005G060400 Sobic003G325000 Sobic003G325000 Sobic004G109100--Sobic003G325000 Sobic004G138400 Sobic004G138400 Sobic004G109100--Sobic004G138400 Sobic005G008101 Sobic005G008101 Sobic004G109100--Sobic005G008101 Sobic004G106200--Sobic004G109100 Sobic004G106200--Sobic009G111800 Sobic004G106200--Sobic002G130200 Sobic004G106200--Sobic001G321700 Sobic010G065001 Sobic010G065001 Sobic004G106200--Sobic010G065001 Sobic008G108300 Sobic008G108300 Sobic004G106200--Sobic008G108300 Sobic010G254000 Sobic010G254000 Sobic004G106200--Sobic010G254000 Sobic009G148950 Sobic009G148950 Sobic004G106200--Sobic009G148950 Sobic003G169100 Sobic003G169100 Sobic004G106200--Sobic003G169100 Sobic002G025000 Sobic002G025000 Sobic009G111800--Sobic002G025000 Sobic009G111800--Sobic004G109100 Sobic009G111800--Sobic004G106200 Sobic009G111800--Sobic001G321700 Sobic009G111800--Sobic005G008101 Sobic007G149750 Sobic007G149750 Sobic009G111800--Sobic007G149750 Sobic010G091100 Sobic010G091100 Sobic009G111800--Sobic010G091100 Sobic009G111800--Sobic003G325000 Sobic009G111800--Sobic004G138400 Sobic010G046900--Sobic004G109100 Sobic009G115500 Sobic009G115500 Sobic010G046900--Sobic009G115500 Sobic002G130500 Sobic002G130500 Sobic010G046900--Sobic002G130500 Sobic003G255800 Sobic003G255800 Sobic010G046900--Sobic003G255800 Sobic002G064200 Sobic002G064200 Sobic010G046900--Sobic002G064200 Sobic010G046900--Sobic009G111800 Sobic010G046900--Sobic004G106200 Sobic010G046900--Sobic001G321700 Sobic010G172300 Sobic010G172300 Sobic010G046900--Sobic010G172300 Sobic001G321700--Sobic004G106200 Sobic001G321700--Sobic009G111800 Sobic001G476100 Sobic001G476100 Sobic001G321700--Sobic001G476100 Sobic001G321700--Sobic010G065001 Sobic001G321700--Sobic004G109100 Sobic001G319000 Sobic001G319000 Sobic001G321700--Sobic001G319000 Sobic008G081500 Sobic008G081500 Sobic001G321700--Sobic008G081500 Sobic009G074200 Sobic009G074200 Sobic001G321700--Sobic009G074200 Sobic004G242900 Sobic004G242900 Sobic001G321700--Sobic004G242900 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic002G130200--Sobic004G251400 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic002G130200--Sobic004G337600 Sobic003G168500 Sobic003G168500 Sobic002G130200--Sobic003G168500 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic002G130200--Sobic003G172900 Sobic002G044500 Sobic002G044500 Sobic002G130200--Sobic002G044500 Sobic008G160300 Sobic008G160300 Sobic002G130200--Sobic008G160300 Sobic003G171900 Sobic003G171900 Sobic002G130200--Sobic003G171900 Sobic003G172850 Sobic003G172850 Sobic002G130200--Sobic003G172850 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic002G130200--Sobic003G172400 Sobic005G060400--Sobic004G109100 Sobic008G049300 Sobic008G049300 Sobic005G060400--Sobic008G049300 Sobic004G201800 Sobic004G201800 Sobic005G060400--Sobic004G201800 Sobic005G060400--Sobic003G325000 Sobic005G060400--Sobic004G106200 Sobic002G041900 Sobic002G041900 Sobic005G060400--Sobic002G041900 Sobic002G311900 Sobic002G311900 Sobic005G060400--Sobic002G311900 Sobic005G060400--Sobic005G008101 Sobic009G160300 Sobic009G160300 Sobic005G060400--Sobic009G160300 Sobic002G341600 Sobic002G341600 Sobic003G325000--Sobic002G341600 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic003G325000--Sobic001G217800 Sobic009G104850 Sobic009G104850 Sobic003G325000--Sobic009G104850 Sobic003G249300 Sobic003G249300 Sobic003G325000--Sobic003G249300 Sobic001G302100 Sobic001G302100 Sobic003G325000--Sobic001G302100 Sobic001G519700 Sobic001G519700 Sobic003G325000--Sobic001G519700 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic003G325000--Sobic010G225400 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic003G325000--Sobic003G160400 Sobic005G167450 Sobic005G167450 Sobic003G325000--Sobic005G167450 Sobic003G325100 Sobic003G325100 Sobic004G138400--Sobic003G325100 Sobic004G138400--Sobic009G111800 Sobic001G330925 Sobic001G330925 Sobic004G138400--Sobic001G330925 Sobic002G202800 Sobic002G202800 Sobic004G138400--Sobic002G202800 Sobic004G138400--Sobic004G106200 Sobic004G138400--Sobic004G109100 Sobic003G242800 Sobic003G242800 Sobic004G138400--Sobic003G242800 Sobic004G138400--Sobic001G321700 Sobic004G138400--Sobic001G476100 Sobic005G008101--Sobic004G201800 Sobic003G290050 Sobic003G290050 Sobic005G008101--Sobic003G290050 Sobic006G078450 Sobic006G078450 Sobic005G008101--Sobic006G078450 Sobic003G089700 Sobic003G089700 Sobic005G008101--Sobic003G089700 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic005G008101--Sobic005G183450 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic005G008101--Sobic006G020350 Sobic006G124850 Sobic006G124850 Sobic005G008101--Sobic006G124850 Sobic008G035633 Sobic008G035633 Sobic005G008101--Sobic008G035633 Sobic006G017266 Sobic006G017266 Sobic005G008101--Sobic006G017266
Octagon: transcription factors


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