Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G060400.1
Synonym Sb05g004920
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RGY9
Pfam -
Panther DB PTHR36322
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g07550.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034010
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G109100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
2 Sobic.008G049300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@ECAGL2 - ECA1 gametogenesis related family protein precursor, expressed -
3 Sobic.004G201800 expressed protein -
4 Sobic.003G325000 expressed protein -
5 Sobic.004G106200 receptor-like kinase, putative, expressed -
6 Sobic.002G041900 transferase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G311900 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
8 Sobic.005G008101 - -
9 Sobic.009G160300 - -
10 Sobic.007G052500 - -
11 Sobic.002G341600 lipase, putative, expressed -
12 Sobic.002G130200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G321700 dehydration response related protein, putative, expressed -
14 Sobic.009G111800 OsFBO5 - F-box and other domain containing protein, expressed -
15 Sobic.009G029100 serine/threonine-protein kinase receptor precursor, putative, expressed -
16 Sobic.002G274300 - -
17 Sobic.003G369566 - -
18 Sobic.001G278400 expressed protein -
19 Sobic.010G185250 - -
20 Sobic.004G242900 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G060400 Sobic005G060400 Sobic004G109100 Sobic004G109100 Sobic005G060400--Sobic004G109100 Sobic008G049300 Sobic008G049300 Sobic005G060400--Sobic008G049300 Sobic004G201800 Sobic004G201800 Sobic005G060400--Sobic004G201800 Sobic003G325000 Sobic003G325000 Sobic005G060400--Sobic003G325000 Sobic004G106200 Sobic004G106200 Sobic005G060400--Sobic004G106200 Sobic002G041900 Sobic002G041900 Sobic005G060400--Sobic002G041900 Sobic002G311900 Sobic002G311900 Sobic005G060400--Sobic002G311900 Sobic005G008101 Sobic005G008101 Sobic005G060400--Sobic005G008101 Sobic009G160300 Sobic009G160300 Sobic005G060400--Sobic009G160300 Sobic004G109100--Sobic004G106200 Sobic009G111800 Sobic009G111800 Sobic004G109100--Sobic009G111800 Sobic010G046900 Sobic010G046900 Sobic004G109100--Sobic010G046900 Sobic001G321700 Sobic001G321700 Sobic004G109100--Sobic001G321700 Sobic002G130200 Sobic002G130200 Sobic004G109100--Sobic002G130200 Sobic004G109100--Sobic005G060400 Sobic004G109100--Sobic003G325000 Sobic004G138400 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Octagon: transcription factors


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