Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G049300.1
Synonym Sb08g004200
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence. (PubMedID : 27586543)
ECAGL2 - ECA1 gametogenesis related family protein precursor, expressed
UniProt C5YSL3
Pfam PF05617
Panther DB PTHR31181 PTHR31181:SF50
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G39340 : Protein of unknown function (DUF1278)
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g06730.1 : ECAGL2 - ECA1 gametogenesis related family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025768
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G008101 - -
2 Sobic.004G201800 expressed protein -
3 Sobic.006G247400 transferase family protein, putative, expressed -
4 Sobic.010G214950 - -
5 Sobic.009G160300 - -
6 Sobic.001G048300 - -
7 Sobic.005G060400 - -
8 Sobic.001G448350 - -
9 Sobic.001G484500 - -
10 Sobic.001G436500 expressed protein -
11 Sobic.005G146900 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G200400 histone deacetylase 19, putative, expressed K06067: histone deacetylase 1/2
13 Sobic.001G059150 - -
14 Sobic.005G161000 expressed protein -
15 Sobic.004G198701 - -
16 Sobic.001G150901 - -
17 Sobic.002G288700 - K02711: photosystem II PsbJ protein
18 Sobic.008G035633 - -
19 Sobic.003G354166 - -
20 Sobic.006G123800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G049300 Sobic008G049300 Sobic005G008101 Sobic005G008101 Sobic008G049300--Sobic005G008101 Sobic004G201800 Sobic004G201800 Sobic008G049300--Sobic004G201800 Sobic006G247400 Sobic006G247400 Sobic008G049300--Sobic006G247400 Sobic010G214950 Sobic010G214950 Sobic008G049300--Sobic010G214950 Sobic009G160300 Sobic009G160300 Sobic008G049300--Sobic009G160300 Sobic001G048300 Sobic001G048300 Sobic008G049300--Sobic001G048300 Sobic005G060400 Sobic005G060400 Sobic008G049300--Sobic005G060400 Sobic001G448350 Sobic001G448350 Sobic008G049300--Sobic001G448350 Sobic001G484500 Sobic001G484500 Sobic008G049300--Sobic001G484500 Sobic005G008101--Sobic004G201800 Sobic003G290050 Sobic003G290050 Sobic005G008101--Sobic003G290050 Sobic006G078450 Sobic006G078450 Sobic005G008101--Sobic006G078450 Sobic003G089700 Sobic003G089700 Sobic005G008101--Sobic003G089700 Sobic005G183450 Sobic005G183450 Sobic005G008101--Sobic005G183450 Sobic006G020350 Sobic006G020350 Sobic005G008101--Sobic006G020350 Sobic006G124850 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Sobic001G278400 Sobic001G278400 Sobic001G484500--Sobic001G278400
Octagon: transcription factors


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