Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G436500.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt C6JSA2 , A0A120GUN2
Pfam -
Panther DB PTHR31029 PTHR31029:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G12330 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g14500.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052879 , Zm00025a001571
Brachypodium KQK22566
Barley HORVU4Hr1G063050.2 , HORVU4Hr1G063050.6 , HORVU4Hr1G063050.4 , HORVU4Hr1G063050.5 , HORVU4Hr1G063050.1
Wheat TraesCS4A02G080000 , TraesCS4A02G080000 , TraesCS4B02G224000 , TraesCS4B02G224000 , TraesCS4D02G224300
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G049300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@ECAGL2 - ECA1 gametogenesis related family protein precursor, expressed -
2 Sobic.001G477100 purine permease, putative, expressed -
3 Sobic.004G201800 expressed protein -
4 Sobic.010G077200 growth regulating factor protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G109100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G008101 - -
7 Sobic.004G224400 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G130200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G217800 - -
10 Sobic.008G035633 - -
11 Sobic.003G325000 expressed protein -
12 Sobic.005G101400 pyruvate kinase, putative, expressed K00873: PK, pyruvate kinase
13 Sobic.003G089700 - -
14 Sobic.001G540250 - -
15 Sobic.004G044401 - -
16 Sobic.001G484500 - -
17 Sobic.008G157700 BURP domain containing protein, expressed -
18 Sobic.002G002000 expressed protein -
19 Sobic.003G137300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@LOI1, putative, expressed -
20 Sobic.007G052500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G436500 Sobic001G436500 Sobic008G049300 Sobic008G049300 Sobic001G436500--Sobic008G049300 Sobic001G477100 Sobic001G477100 Sobic001G436500--Sobic001G477100 Sobic004G201800 Sobic004G201800 Sobic001G436500--Sobic004G201800 Sobic010G077200 Sobic010G077200 Sobic001G436500--Sobic010G077200 Sobic004G109100 Sobic004G109100 Sobic001G436500--Sobic004G109100 Sobic005G008101 Sobic005G008101 Sobic001G436500--Sobic005G008101 Sobic004G224400 Sobic004G224400 Sobic001G436500--Sobic004G224400 Sobic002G130200 Sobic002G130200 Sobic001G436500--Sobic002G130200 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic001G436500--Sobic001G217800 Sobic008G049300--Sobic005G008101 Sobic008G049300--Sobic004G201800 Sobic006G247400 Sobic006G247400 Sobic008G049300--Sobic006G247400 Sobic010G214950 Sobic010G214950 Sobic008G049300--Sobic010G214950 Sobic009G160300 Sobic009G160300 Sobic008G049300--Sobic009G160300 Sobic001G048300 Sobic001G048300 Sobic008G049300--Sobic001G048300 Sobic005G060400 Sobic005G060400 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Octagon: transcription factors


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