Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G077200.1,Sobic.010G077200.2
Synonym GRF5, AtGRF5, Sb10g006690
Functional annotation growth regulating factor protein, putative, expressed
UniProt A0A1W0VRY2 , Q8W0U7
Pfam PF08879 PF08880 PF08879
Panther DB PTHR31602 PTHR31602:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006351; transcription, DNA-templated GO:0005634nucleus GO:0006355regulation of transcription, DNA-templated GO:0005634nucleus GO:0005524ATP binding GO:0006351transcription, DNA-templated


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G13960 : growth-regulating factor 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g10310.1 : growth regulating factor protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a056942 , Zm00025a049628 , Zm00025a042463 , Zm00025a009932 , Zm00025a021685 , Zm00025a032451
Brachypodium KQJ84396 , PNT76252 , PNT76253
Barley HORVU4Hr1G010080.7 , HORVU4Hr1G010080.6 , HORVU4Hr1G010080.5 , HORVU4Hr1G010080.4 , HORVU4Hr1G010080.3 , HORVU4Hr1G010080.2 , HORVU4Hr1G010080.9 , HORVU4Hr1G010080.8 , HORVU7Hr1G034610.1 , HORVU2Hr1G101770.18 , HORVU2Hr1G101770.14 , HORVU2Hr1G101770.15 , HORVU2Hr1G101770.16 , HORVU2Hr1G101770.17 , HORVU2Hr1G101770.10 , HORVU2Hr1G101770.11 , HORVU2Hr1G101770.13 , HORVU4Hr1G010080.12 , HORVU4Hr1G010080.11 , HORVU4Hr1G010080.10 , HORVU2Hr1G101770.6 , HORVU2Hr1G101770.7 , HORVU2Hr1G101770.4 , HORVU2Hr1G101770.3 , HORVU2Hr1G101770.8 , HORVU2Hr1G101770.9 , HORVU6Hr1G081210.2 , HORVU6Hr1G081210.3 , HORVU6Hr1G081210.1 , HORVU7Hr1G034610.5 , HORVU7Hr1G034610.4 , HORVU7Hr1G034610.3 , HORVU7Hr1G034610.2
Wheat TraesCS4A02G255000 , TraesCS2A02G435100 , TraesCS7A02G165600 , TraesCS6B02G366700 , TraesCS6D02G315700 , TraesCS7B02G070200 , TraesCS6A02G335900 , TraesCS2B02G458400 , TraesCS4B02G060000 , TraesCS2D02G435200 , TraesCS7D02G166400 , TraesCS4D02G059600
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G044401 - -
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10 Sobic.010G214950 - -
11 Sobic.004G087000 ATP synthase subunit beta, putative, expressed K02112: ATPF1B, F-type H+/Na+-transporting ATPase subunit beta
12 Sobic.007G109200 ATP synthase epsilon chain, putative, expressed K02114: ATPF1E, F-type H+-transporting ATPase subunit epsilon
13 Sobic.005G093901 - -
14 Sobic.002G014900 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
15 Sobic.006G145650 - -
16 Sobic.002G288700 - K02711: photosystem II PsbJ protein
17 Sobic.004G251400 - -
18 Sobic.004G198701 - -
19 Sobic.003G166400 - K02911: RP-L32, MRPL32, large subunit ribosomal protein L32
20 Sobic.001G421250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G077200 Sobic010G077200 Sobic004G044401 Sobic004G044401 Sobic010G077200--Sobic004G044401 Sobic005G126900 Sobic005G126900 Sobic010G077200--Sobic005G126900 Sobic002G423901 Sobic002G423901 Sobic010G077200--Sobic002G423901 Sobic003G354050 Sobic003G354050 Sobic010G077200--Sobic003G354050 Sobic001G234733 Sobic001G234733 Sobic010G077200--Sobic001G234733 Sobic003G159300 Sobic003G159300 Sobic010G077200--Sobic003G159300 Sobic001G472050 Sobic001G472050 Sobic010G077200--Sobic001G472050 Sobic007G223250 Sobic007G223250 Sobic010G077200--Sobic007G223250 Sobic001G138100 Sobic001G138100 Sobic010G077200--Sobic001G138100 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic004G044401--Sobic009G029100 Sobic001G523150 Sobic001G523150 Sobic004G044401--Sobic001G523150 Sobic003G166400 Sobic003G166400 Sobic004G044401--Sobic003G166400 Sobic002G270733 Sobic002G270733 Sobic004G044401--Sobic002G270733 Sobic007G052500 Sobic007G052500 Sobic004G044401--Sobic007G052500 Sobic004G337600 Sobic004G337600 Sobic004G044401--Sobic004G337600 Sobic008G039200 Sobic008G039200 Sobic004G044401--Sobic008G039200 Sobic004G044401--Sobic005G126900 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic004G044401--Sobic002G165200 Sobic005G126900--Sobic004G044401 Sobic005G101400 Sobic005G101400 Sobic005G126900--Sobic005G101400 Sobic004G272500 Sobic004G272500 Sobic005G126900--Sobic004G272500 Sobic005G167450 Sobic005G167450 Sobic005G126900--Sobic005G167450 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic005G126900--Sobic001G217800 Sobic007G085966 Sobic007G085966 Sobic005G126900--Sobic007G085966 Sobic005G126900--Sobic003G166400 Sobic001G118600 Sobic001G118600 Sobic005G126900--Sobic001G118600 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic005G126900--Sobic009G069450 Sobic002G288700 Sobic002G288700 Sobic002G423901--Sobic002G288700 Sobic002G423901--Sobic001G472050 Sobic002G423901--Sobic007G223250 Sobic010G008433 Sobic010G008433 Sobic002G423901--Sobic010G008433 Sobic004G087000 Sobic004G087000 Sobic002G423901--Sobic004G087000 Sobic005G093901 Sobic005G093901 Sobic002G423901--Sobic005G093901 Sobic002G423901--Sobic003G354050 Sobic007G109200 Sobic007G109200 Sobic002G423901--Sobic007G109200 Sobic002G423901--Sobic001G234733 Sobic003G354050--Sobic001G234733 Sobic003G354050--Sobic002G423901 Sobic002G014900 Sobic002G014900 Sobic003G354050--Sobic002G014900 Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic003G354050--Sobic003G168350 Sobic003G354050--Sobic007G223250 Sobic003G354050--Sobic004G087000 Sobic004G198701 Sobic004G198701 Sobic003G354050--Sobic004G198701 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic003G354050--Sobic008G157700 Sobic003G354050--Sobic001G138100 Sobic001G234733--Sobic004G198701 Sobic001G234733--Sobic003G354050 Sobic002G277000 Sobic002G277000 Sobic001G234733--Sobic002G277000 Sobic001G059150 Sobic001G059150 Sobic001G234733--Sobic001G059150 Sobic001G234733--Sobic002G423901 Sobic003G200400 Sobic003G200400 Sobic001G234733--Sobic003G200400 Sobic001G234733--Sobic003G159300 Sobic003G277550 Sobic003G277550 Sobic001G234733--Sobic003G277550 Sobic001G234733--Sobic003G168350 Sobic003G159300--Sobic003G277550 Sobic002G427600 Sobic002G427600 Sobic003G159300--Sobic002G427600 Sobic003G159300--Sobic001G234733 Sobic007G212250 Sobic007G212250 Sobic003G159300--Sobic007G212250 Sobic003G159300--Sobic003G354050 Sobic001G382332 Sobic001G382332 Sobic003G159300--Sobic001G382332 Sobic002G406000 Sobic002G406000 Sobic003G159300--Sobic002G406000 Sobic007G220033 Sobic007G220033 Sobic003G159300--Sobic007G220033 Sobic003G125751 Sobic003G125751 Sobic003G159300--Sobic003G125751 Sobic001G472050--Sobic005G093901 Sobic001G472050--Sobic002G423901 Sobic001G489550 Sobic001G489550 Sobic001G472050--Sobic001G489550 Sobic001G472050--Sobic010G008433 Sobic002G413100 Sobic002G413100 Sobic001G472050--Sobic002G413100 Sobic003G117850 Sobic003G117850 Sobic001G472050--Sobic003G117850 Sobic004G320900 Sobic004G320900 Sobic001G472050--Sobic004G320900 Sobic001G472050--Sobic004G087000 Sobic002G245700 Sobic002G245700 Sobic001G472050--Sobic002G245700 Sobic007G223250--Sobic002G288700 Sobic007G223250--Sobic002G014900 Sobic007G223250--Sobic004G087000 Sobic006G123800 Sobic006G123800 Sobic007G223250--Sobic006G123800 Sobic001G266000 Sobic001G266000 Sobic007G223250--Sobic001G266000 Sobic002G150032 Sobic002G150032 Sobic007G223250--Sobic002G150032 Sobic003G172900 Sobic003G172900 Sobic007G223250--Sobic003G172900 Sobic004G251400 Sobic004G251400 Sobic007G223250--Sobic004G251400 Sobic007G223250--Sobic007G109200 Sobic006G057050 Sobic006G057050 Sobic001G138100--Sobic006G057050 Sobic001G138100--Sobic007G109200 Sobic001G138100--Sobic004G087000 Sobic001G138100--Sobic004G251400 Sobic003G172701 Sobic003G172701 Sobic001G138100--Sobic003G172701 Sobic001G138100--Sobic004G337600 Sobic001G138100--Sobic005G093901 Sobic004G337850 Sobic004G337850 Sobic001G138100--Sobic004G337850 Sobic001G138100--Sobic003G172900
Octagon: transcription factors


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