Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G111100.1
Synonym Sb09g017940
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YWT8
Pfam PF08224
Panther DB PTHR33377 PTHR33377:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g01560.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G162400 - -
2 Sobic.003G065501 - -
3 Sobic.003G278633 - -
4 Sobic.001G491900 expressed protein -
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9 Sobic.005G221800 - -
10 Sobic.002G259900 expressed protein -
11 Sobic.007G138200 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G288500 serine/threonine kinase, putative, expressed -
13 Sobic.009G213900 exostosin, putative, expressed -
14 Sobic.006G113900 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
15 Sobic.009G223000 - -
16 Sobic.010G196433 - -
17 Sobic.005G031901 - -
18 Sobic.002G100100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
19 Sobic.004G358301 - -
20 Sobic.009G036366 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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