Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G065501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VVX5
Pfam PF07859
Panther DB PTHR23024 PTHR23024:SF204
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016787; hydrolase activity GO:0008152metabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G06570 : alpha/beta-Hydrolases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g06060.1 : gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a023391 , Zm00025a023385
Brachypodium KQK02499 , KQK06611
Barley -
Wheat TraesCS4D02G130000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G171200 transporter family protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G310000 no apical meristem protein, expressed -
3 Sobic.010G004500 expressed protein -
4 Sobic.002G208850 - -
5 Sobic.008G162400 - -
6 Sobic.001G182400 - -
7 Sobic.009G111100 expressed protein -
8 Sobic.003G325100 NB-ARC domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G181200 RING-H2 finger protein ATL3F, putative, expressed -
10 Sobic.007G072166 - -
11 Sobic.002G202800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@WRKY62, expressed -
12 Sobic.002G354400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@polyol transporter 5, putative, expressed -
13 Sobic.001G363200 expressed protein -
14 Sobic.005G157866 - -
15 Sobic.006G113900 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
16 Sobic.010G256866 - -
17 Sobic.002G041900 transferase family protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G348800 - -
19 Sobic.002G273800 cytochrome P450, putative, expressed -
20 Sobic.003G258700 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G065501 Sobic003G065501 Sobic005G171200 Sobic005G171200 Sobic003G065501--Sobic005G171200 Sobic003G310000 Sobic003G310000 Sobic003G065501--Sobic003G310000 Sobic010G004500 Sobic010G004500 Sobic003G065501--Sobic010G004500 Sobic002G208850 Sobic002G208850 Sobic003G065501--Sobic002G208850 Sobic008G162400 Sobic008G162400 Sobic003G065501--Sobic008G162400 Sobic001G182400 Sobic001G182400 Sobic003G065501--Sobic001G182400 Sobic009G111100 Sobic009G111100 Sobic003G065501--Sobic009G111100 Sobic003G325100 Sobic003G325100 Sobic003G065501--Sobic003G325100 Sobic004G181200 Sobic004G181200 Sobic003G065501--Sobic004G181200 Sobic005G171200--Sobic003G065501 Sobic005G171200--Sobic010G004500 Sobic005G171200--Sobic003G325100 Sobic002G202800 Sobic002G202800 Sobic005G171200--Sobic002G202800 Sobic005G171200--Sobic003G310000 Sobic005G171200--Sobic004G181200 Sobic002G354400 Sobic002G354400 Sobic005G171200--Sobic002G354400 Sobic001G363200 Sobic001G363200 Sobic005G171200--Sobic001G363200 Sobic006G231600 Sobic006G231600 Sobic005G171200--Sobic006G231600 Sobic003G310000--Sobic005G171200 Sobic003G310000--Sobic010G004500 Sobic001G059300 Sobic001G059300 Sobic003G310000--Sobic001G059300 Sobic003G310000--Sobic003G325100 Sobic009G092200 Sobic009G092200 Sobic003G310000--Sobic009G092200 Sobic003G310000--Sobic003G065501 Sobic001G330925 Sobic001G330925 Sobic003G310000--Sobic001G330925 Sobic003G242800 Sobic003G242800 Sobic003G310000--Sobic003G242800 Sobic003G310000--Sobic002G202800 Sobic010G004500--Sobic003G325100 Sobic008G095100 Sobic008G095100 Sobic010G004500--Sobic008G095100 Sobic010G004500--Sobic001G059300 Sobic002G070700 Sobic002G070700 Sobic010G004500--Sobic002G070700 Sobic010G004500--Sobic009G092200 Sobic007G072166 Sobic007G072166 Sobic010G004500--Sobic007G072166 Sobic010G004500--Sobic002G202800 Sobic003G080500 Sobic003G080500 Sobic010G004500--Sobic003G080500 Sobic004G157200 Sobic004G157200 Sobic010G004500--Sobic004G157200 Sobic006G141400 Sobic006G141400 Sobic002G208850--Sobic006G141400 Sobic002G036500 Sobic002G036500 Sobic002G208850--Sobic002G036500 Sobic007G007600 Sobic007G007600 Sobic002G208850--Sobic007G007600 Sobic010G256866 Sobic010G256866 Sobic002G208850--Sobic010G256866 Sobic002G175700 Sobic002G175700 Sobic002G208850--Sobic002G175700 Sobic002G215932 Sobic002G215932 Sobic002G208850--Sobic002G215932 Sobic007G064000 Sobic007G064000 Sobic002G208850--Sobic007G064000 Sobic002G208850--Sobic001G182400 Sobic006G151100 Sobic006G151100 Sobic002G208850--Sobic006G151100 Sobic010G210050 Sobic010G210050 Sobic008G162400--Sobic010G210050 Sobic008G162400--Sobic009G111100 Sobic008G162400--Sobic010G256866 Sobic008G162400--Sobic006G151100 Sobic005G031901 Sobic005G031901 Sobic008G162400--Sobic005G031901 Sobic008G162400--Sobic002G175700 Sobic008G162400--Sobic007G064000 Sobic009G036366 Sobic009G036366 Sobic008G162400--Sobic009G036366 Sobic001G406500 Sobic001G406500 Sobic008G162400--Sobic001G406500 Sobic001G329001 Sobic001G329001 Sobic001G182400--Sobic001G329001 Sobic007G143600 Sobic007G143600 Sobic001G182400--Sobic007G143600 Sobic002G086700 Sobic002G086700 Sobic001G182400--Sobic002G086700 Sobic004G358150 Sobic004G358150 Sobic001G182400--Sobic004G358150 Sobic009G136950 Sobic009G136950 Sobic001G182400--Sobic009G136950 Sobic008G177100 Sobic008G177100 Sobic001G182400--Sobic008G177100 Sobic002G076300 Sobic002G076300 Sobic001G182400--Sobic002G076300 Sobic001G182400--Sobic002G036500 Sobic003G410000 Sobic003G410000 Sobic001G182400--Sobic003G410000 Sobic009G111100--Sobic008G162400 Sobic009G111100--Sobic003G065501 Sobic003G278633 Sobic003G278633 Sobic009G111100--Sobic003G278633 Sobic001G491900 Sobic001G491900 Sobic009G111100--Sobic001G491900 Sobic006G165700 Sobic006G165700 Sobic009G111100--Sobic006G165700 Sobic009G111100--Sobic010G210050 Sobic006G088450 Sobic006G088450 Sobic009G111100--Sobic006G088450 Sobic001G033800 Sobic001G033800 Sobic009G111100--Sobic001G033800 Sobic005G221800 Sobic005G221800 Sobic009G111100--Sobic005G221800 Sobic004G138400 Sobic004G138400 Sobic003G325100--Sobic004G138400 Sobic003G325100--Sobic002G202800 Sobic003G325100--Sobic010G004500 Sobic002G064200 Sobic002G064200 Sobic003G325100--Sobic002G064200 Sobic003G325100--Sobic008G095100 Sobic009G111800 Sobic009G111800 Sobic003G325100--Sobic009G111800 Sobic003G325100--Sobic003G242800 Sobic004G106200 Sobic004G106200 Sobic003G325100--Sobic004G106200 Sobic003G325100--Sobic001G059300 Sobic006G113400 Sobic006G113400 Sobic004G181200--Sobic006G113400 Sobic004G181200--Sobic001G363200 Sobic004G160300 Sobic004G160300 Sobic004G181200--Sobic004G160300 Sobic001G259500 Sobic001G259500 Sobic004G181200--Sobic001G259500 Sobic006G246200 Sobic006G246200 Sobic004G181200--Sobic006G246200
Octagon: transcription factors


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