Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G158500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5YYU7
Pfam PF06521
Panther DB PTHR33649 PTHR33649:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G52390 : PAR1 protein
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G181900 aluminum-activated malate transporter, putative, expressed -
2 Sobic.001G508400 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
3 Sobic.009G015500 - -
4 Sobic.009G006500 integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed -
5 Sobic.006G012800 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@acyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial precursor, putative, expressed K00232: E1.3.3.6, ACOX1, acyl-CoA oxidase
6 Sobic.001G101600 - -
7 Sobic.002G416500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
8 Sobic.007G058600 O-methyltransferase, putative, expressed K13066: E2.1.1.68, caffeic acid 3-O-methyltransferase
9 Sobic.010G070750 - -
10 Sobic.009G158600 - -
11 Sobic.006G142000 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
12 Sobic.003G015200 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
13 Sobic.001G452200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@Caleosin-related family protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@caleosin related protein, putative, expressed K17991: peroxygenase
14 Sobic.004G308300 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
15 Sobic.003G024600 CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.7 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed -
16 Sobic.002G389100 cytochrome P450 72A1, putative, expressed -
17 Sobic.003G307100 serpin domain containing protein, putative, expressed K13963: serpin B
18 Sobic.002G107400 aldehyde oxidase, putative, expressed -
19 Sobic.001G323600 transporter family protein, putative, expressed -
20 Sobic.007G164500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G158500 Sobic009G158500 Sobic006G181900 Sobic006G181900 Sobic009G158500--Sobic006G181900 Sobic001G508400 Sobic001G508400 Sobic009G158500--Sobic001G508400 Sobic009G015500 Sobic009G015500 Sobic009G158500--Sobic009G015500 Sobic009G006500 Sobic009G006500 Sobic009G158500--Sobic009G006500 Sobic006G012800 Sobic006G012800 Sobic009G158500--Sobic006G012800 Sobic001G101600 Sobic001G101600 Sobic009G158500--Sobic001G101600 Sobic002G416500 Sobic002G416500 Sobic009G158500--Sobic002G416500 Sobic007G058600 Sobic007G058600 Sobic009G158500--Sobic007G058600 Sobic010G070750 Sobic010G070750 Sobic009G158500--Sobic010G070750 Sobic006G181900--Sobic009G158500 Sobic006G181900--Sobic007G058600 Sobic006G181900--Sobic009G015500 Sobic006G181900--Sobic001G508400 Sobic006G181900--Sobic010G070750 Sobic006G181900--Sobic009G006500 Sobic003G024600 Sobic003G024600 Sobic006G181900--Sobic003G024600 Sobic003G015200 Sobic003G015200 Sobic006G181900--Sobic003G015200 Sobic001G323600 Sobic001G323600 Sobic006G181900--Sobic001G323600 Sobic001G508400--Sobic009G158500 Sobic001G508400--Sobic006G181900 Sobic001G508400--Sobic002G416500 Sobic001G508400--Sobic009G015500 Sobic002G389100 Sobic002G389100 Sobic001G508400--Sobic002G389100 Sobic009G158600 Sobic009G158600 Sobic001G508400--Sobic009G158600 Sobic001G508400--Sobic009G006500 Sobic001G508400--Sobic007G058600 Sobic001G508400--Sobic006G012800 Sobic009G015500--Sobic007G058600 Sobic009G015500--Sobic001G323600 Sobic009G015500--Sobic010G070750 Sobic004G308300 Sobic004G308300 Sobic009G015500--Sobic004G308300 Sobic005G088700 Sobic005G088700 Sobic009G015500--Sobic005G088700 Sobic009G015500--Sobic009G158600 Sobic009G015500--Sobic003G024600 Sobic007G164500 Sobic007G164500 Sobic009G015500--Sobic007G164500 Sobic001G373600 Sobic001G373600 Sobic009G015500--Sobic001G373600 Sobic009G006500--Sobic009G015500 Sobic009G006500--Sobic007G058600 Sobic009G006500--Sobic003G015200 Sobic009G006500--Sobic004G308300 Sobic009G006500--Sobic006G181900 Sobic009G006500--Sobic010G070750 Sobic006G142000 Sobic006G142000 Sobic009G006500--Sobic006G142000 Sobic002G107400 Sobic002G107400 Sobic009G006500--Sobic002G107400 Sobic009G006500--Sobic001G323600 Sobic006G012800--Sobic009G158500 Sobic006G012800--Sobic001G508400 Sobic006G012800--Sobic002G389100 Sobic006G074200 Sobic006G074200 Sobic006G012800--Sobic006G074200 Sobic006G012800--Sobic002G416500 Sobic004G185100 Sobic004G185100 Sobic006G012800--Sobic004G185100 Sobic002G318100 Sobic002G318100 Sobic006G012800--Sobic002G318100 Sobic001G364400 Sobic001G364400 Sobic006G012800--Sobic001G364400 Sobic006G012800--Sobic006G181900 Sobic001G101600--Sobic009G158500 Sobic001G101600--Sobic006G181900 Sobic001G101600--Sobic001G508400 Sobic001G114300 Sobic001G114300 Sobic001G101600--Sobic001G114300 Sobic002G049400 Sobic002G049400 Sobic001G101600--Sobic002G049400 Sobic002G163200 Sobic002G163200 Sobic001G101600--Sobic002G163200 Sobic001G101600--Sobic009G158600 Sobic001G026300 Sobic001G026300 Sobic001G101600--Sobic001G026300 Sobic001G101600--Sobic002G416500 Sobic002G416500--Sobic001G508400 Sobic002G416500--Sobic006G181900 Sobic002G416500--Sobic002G389100 Sobic002G416500--Sobic003G015200 Sobic002G416500--Sobic009G006500 Sobic002G416500--Sobic007G058600 Sobic002G416500--Sobic001G026300 Sobic001G452200 Sobic001G452200 Sobic002G416500--Sobic001G452200 Sobic004G261400 Sobic004G261400 Sobic002G416500--Sobic004G261400 Sobic007G058600--Sobic009G015500 Sobic007G058600--Sobic003G015200 Sobic005G064900 Sobic005G064900 Sobic007G058600--Sobic005G064900 Sobic007G058600--Sobic001G323600 Sobic007G058600--Sobic006G142000 Sobic007G058600--Sobic005G088700 Sobic007G058600--Sobic003G024600 Sobic007G058600--Sobic001G373600 Sobic007G058600--Sobic007G164500 Sobic010G070750--Sobic007G164500 Sobic010G070750--Sobic001G323600 Sobic010G070750--Sobic003G024600 Sobic010G070750--Sobic001G373600 Sobic001G466450 Sobic001G466450 Sobic010G070750--Sobic001G466450
Octagon: transcription factors


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