Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G219300.1
Synonym RTFL15, DVL5
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6P9P5
Pfam PF08137
Panther DB PTHR33102
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G13245 : ROTUNDIFOLIA like 17
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g62605.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK09307
Barley HORVU3Hr1G011440.1 , HORVU5Hr1G054600.1 , HORVU5Hr1G054600.2 , HORVU5Hr1G054600.4 , HORVU5Hr1G054600.5 , HORVU5Hr1G054600.6 , HORVU1Hr1G082600.1 , HORVU1Hr1G082590.1 , HORVU3Hr1G011360.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G196000 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
2 Sobic.001G232400 - -
3 Sobic.005G046801 - -
4 Sobic.004G121800 expansin precursor, putative, expressed -
5 Sobic.004G008300 sphingolipid C4-hydroxylase SUR2, putative, expressed K04713: sphinganine C4-monooxygenase
6 Sobic.007G186500 resistance protein, putative, expressed -
7 Sobic.009G076300 expressed protein -
8 Sobic.009G004950 - -
9 Sobic.003G161400 powdery mildew resistance protein PM3A, putative, expressed -
10 Sobic.010G214300 - -
11 Sobic.008G010500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
12 Sobic.005G066200 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
13 Sobic.007G066508 - -
14 Sobic.001G272800 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
15 Sobic.006G168100 Not investigated(PubMedID : 23766026)@AP2 domain containing protein, expressed K09286: EREBP-like factor
16 Sobic.001G482000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@flavin-containing monooxygenase family protein, putative, expressed K00485: dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)
17 Sobic.010G126800 lectin-like receptor kinase 7, putative, expressed -
18 Sobic.003G204400 hypothetical protein -
19 Sobic.007G135100 - -
20 Sobic.003G204300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic009G219300 Sobic009G219300 Sobic002G196000 Sobic002G196000 Sobic009G219300--Sobic002G196000 Sobic001G232400 Sobic001G232400 Sobic009G219300--Sobic001G232400 Sobic005G046801 Sobic005G046801 Sobic009G219300--Sobic005G046801 Sobic004G121800 Sobic004G121800 Sobic009G219300--Sobic004G121800 Sobic004G008300 Sobic004G008300 Sobic009G219300--Sobic004G008300 Sobic007G186500 Sobic007G186500 Sobic009G219300--Sobic007G186500 Sobic009G076300 Sobic009G076300 Sobic009G219300--Sobic009G076300 Sobic009G004950 Sobic009G004950 Sobic009G219300--Sobic009G004950 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic009G219300--Sobic003G161400 Sobic008G010500 Sobic008G010500 Sobic002G196000--Sobic008G010500 Sobic002G196000--Sobic004G121800 Sobic010G214300 Sobic010G214300 Sobic002G196000--Sobic010G214300 Sobic001G272800 Sobic001G272800 Sobic002G196000--Sobic001G272800 Sobic001G231800 Sobic001G231800 Sobic002G196000--Sobic001G231800 Sobic004G121600 Sobic004G121600 Sobic002G196000--Sobic004G121600 Sobic003G007400 Sobic003G007400 Sobic002G196000--Sobic003G007400 Sobic001G342000 Sobic001G342000 Sobic002G196000--Sobic001G342000 Sobic002G196000--Sobic007G186500 Sobic002G168800 Sobic002G168800 Sobic001G232400--Sobic002G168800 Sobic002G025500 Sobic002G025500 Sobic001G232400--Sobic002G025500 Sobic005G206000 Sobic005G206000 Sobic001G232400--Sobic005G206000 Sobic001G232400--Sobic008G010500 Sobic010G268700 Sobic010G268700 Sobic001G232400--Sobic010G268700 Sobic007G135100 Sobic007G135100 Sobic001G232400--Sobic007G135100 Sobic010G013000 Sobic010G013000 Sobic001G232400--Sobic010G013000 Sobic001G487800 Sobic001G487800 Sobic001G232400--Sobic001G487800 Sobic001G232400--Sobic009G219300 Sobic005G046801--Sobic007G135100 Sobic002G183750 Sobic002G183750 Sobic005G046801--Sobic002G183750 Sobic010G028100 Sobic010G028100 Sobic005G046801--Sobic010G028100 Sobic005G046801--Sobic010G214300 Sobic005G046801--Sobic001G342000 Sobic003G266300 Sobic003G266300 Sobic005G046801--Sobic003G266300 Sobic002G337100 Sobic002G337100 Sobic005G046801--Sobic002G337100 Sobic005G046801--Sobic003G161400 Sobic003G255600 Sobic003G255600 Sobic005G046801--Sobic003G255600 Sobic004G121800--Sobic004G121600 Sobic003G441700 Sobic003G441700 Sobic004G121800--Sobic003G441700 Sobic003G053200 Sobic003G053200 Sobic004G121800--Sobic003G053200 Sobic004G121800--Sobic001G272800 Sobic004G121800--Sobic008G010500 Sobic003G441800 Sobic003G441800 Sobic004G121800--Sobic003G441800 Sobic001G301000 Sobic001G301000 Sobic004G121800--Sobic001G301000 Sobic004G121800--Sobic001G231800 Sobic009G055300 Sobic009G055300 Sobic004G121800--Sobic009G055300 Sobic003G204300 Sobic003G204300 Sobic004G008300--Sobic003G204300 Sobic005G066200 Sobic005G066200 Sobic004G008300--Sobic005G066200 Sobic004G008300--Sobic009G004950 Sobic003G204400 Sobic003G204400 Sobic004G008300--Sobic003G204400 Sobic004G008300--Sobic009G076300 Sobic010G126800 Sobic010G126800 Sobic004G008300--Sobic010G126800 Sobic009G177000 Sobic009G177000 Sobic004G008300--Sobic009G177000 Sobic010G117500 Sobic010G117500 Sobic004G008300--Sobic010G117500 Sobic007G119750 Sobic007G119750 Sobic004G008300--Sobic007G119750 Sobic007G186500--Sobic004G121600 Sobic007G186500--Sobic010G268700 Sobic006G097900 Sobic006G097900 Sobic007G186500--Sobic006G097900 Sobic005G216600 Sobic005G216600 Sobic007G186500--Sobic005G216600 Sobic007G186500--Sobic003G161400 Sobic007G186500--Sobic001G301000 Sobic007G186500--Sobic008G010500 Sobic007G186500--Sobic003G007400 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic007G186500--Sobic005G182900 Sobic009G076300--Sobic004G008300 Sobic009G076300--Sobic003G204300 Sobic009G076300--Sobic003G204400 Sobic009G076300--Sobic009G004950 Sobic007G066508 Sobic007G066508 Sobic009G076300--Sobic007G066508 Sobic005G220300 Sobic005G220300 Sobic009G076300--Sobic005G220300 Sobic002G009100 Sobic002G009100 Sobic009G076300--Sobic002G009100 Sobic009G004950--Sobic010G126800 Sobic009G004950--Sobic003G204300 Sobic009G004950--Sobic005G066200 Sobic002G409200 Sobic002G409200 Sobic009G004950--Sobic002G409200 Sobic009G004950--Sobic004G008300 Sobic009G004950--Sobic007G119750 Sobic002G063700 Sobic002G063700 Sobic009G004950--Sobic002G063700 Sobic005G069332 Sobic005G069332 Sobic009G004950--Sobic005G069332 Sobic008G105800 Sobic008G105800 Sobic009G004950--Sobic008G105800 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic003G161400--Sobic008G033100 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic003G161400--Sobic010G242800 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic003G161400--Sobic001G293100 Sobic003G161400--Sobic005G182900 Sobic007G015000 Sobic007G015000 Sobic003G161400--Sobic007G015000 Sobic003G161400--Sobic010G268700 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic003G161400--Sobic010G213600 Sobic001G415100 Sobic001G415100 Sobic003G161400--Sobic001G415100 Sobic005G097900 Sobic005G097900 Sobic003G161400--Sobic005G097900
Octagon: transcription factors


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