Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G232400.1
Synonym Sb01g020370
Functional annotation -
UniProt C5WZJ4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017699
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G168800 carotenoid cleavage dioxygenase, putative, expressed -
2 Sobic.002G025500 expressed protein -
3 Sobic.005G206000 dirigent, putative, expressed -
4 Sobic.008G010500 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
5 Sobic.010G268700 expansin precursor, putative, expressed -
6 Sobic.007G135100 - -
7 Sobic.010G013000 interacting protein of DMI3, putative, expressed -
8 Sobic.001G487800 expressed protein -
9 Sobic.009G219300 expressed protein -
10 Sobic.001G301000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expansin precursor, putative, expressed -
11 Sobic.005G224300 O-methyltransferase, putative, expressed -
12 Sobic.005G060200 cytochrome P450, putative, expressed -
13 Sobic.001G482000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@flavin-containing monooxygenase family protein, putative, expressed K00485: dimethylaniline monooxygenase (N-oxide forming)
14 Sobic.009G076300 expressed protein -
15 Sobic.005G046801 - -
16 Sobic.004G346300 expressed protein -
17 Sobic.003G357700 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@Laccase LAC7 (At)(PubMedID : 27208977)@laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
18 Sobic.007G186500 resistance protein, putative, expressed -
19 Sobic.005G202200 integral membrane protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G177100 glycosyl hydrolase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G232400 Sobic001G232400 Sobic002G168800 Sobic002G168800 Sobic001G232400--Sobic002G168800 Sobic002G025500 Sobic002G025500 Sobic001G232400--Sobic002G025500 Sobic005G206000 Sobic005G206000 Sobic001G232400--Sobic005G206000 Sobic008G010500 Sobic008G010500 Sobic001G232400--Sobic008G010500 Sobic010G268700 Sobic010G268700 Sobic001G232400--Sobic010G268700 Sobic007G135100 Sobic007G135100 Sobic001G232400--Sobic007G135100 Sobic010G013000 Sobic010G013000 Sobic001G232400--Sobic010G013000 Sobic001G487800 Sobic001G487800 Sobic001G232400--Sobic001G487800 Sobic009G219300 Sobic009G219300 Sobic001G232400--Sobic009G219300 Sobic002G168800--Sobic005G206000 Sobic005G177100 Sobic005G177100 Sobic002G168800--Sobic005G177100 Sobic004G002901 Sobic004G002901 Sobic002G168800--Sobic004G002901 Sobic002G168800--Sobic010G268700 Sobic002G168800--Sobic010G013000 Sobic004G346300 Sobic004G346300 Sobic002G168800--Sobic004G346300 Sobic005G220300 Sobic005G220300 Sobic002G168800--Sobic005G220300 Sobic005G060200 Sobic005G060200 Sobic002G168800--Sobic005G060200 Sobic002G168800--Sobic002G025500 Sobic003G443700 Sobic003G443700 Sobic002G025500--Sobic003G443700 Sobic002G025500--Sobic004G346300 Sobic003G357700 Sobic003G357700 Sobic002G025500--Sobic003G357700 Sobic002G025500--Sobic010G268700 Sobic002G366200 Sobic002G366200 Sobic002G025500--Sobic002G366200 Sobic002G025500--Sobic005G060200 Sobic005G216400 Sobic005G216400 Sobic002G025500--Sobic005G216400 Sobic007G177400 Sobic007G177400 Sobic002G025500--Sobic007G177400 Sobic007G111800 Sobic007G111800 Sobic002G025500--Sobic007G111800 Sobic001G301000 Sobic001G301000 Sobic005G206000--Sobic001G301000 Sobic005G206000--Sobic010G268700 Sobic005G206000--Sobic008G010500 Sobic001G231800 Sobic001G231800 Sobic005G206000--Sobic001G231800 Sobic005G206000--Sobic005G177100 Sobic010G245400 Sobic010G245400 Sobic005G206000--Sobic010G245400 Sobic006G097900 Sobic006G097900 Sobic005G206000--Sobic006G097900 Sobic003G053600 Sobic003G053600 Sobic005G206000--Sobic003G053600 Sobic005G206000--Sobic004G002901 Sobic008G010500--Sobic001G301000 Sobic008G010500--Sobic001G231800 Sobic004G121600 Sobic004G121600 Sobic008G010500--Sobic004G121600 Sobic008G010500--Sobic010G268700 Sobic005G119900 Sobic005G119900 Sobic008G010500--Sobic005G119900 Sobic008G010500--Sobic005G206000 Sobic003G441700 Sobic003G441700 Sobic008G010500--Sobic003G441700 Sobic008G010500--Sobic010G245400 Sobic003G053200 Sobic003G053200 Sobic008G010500--Sobic003G053200 Sobic010G268700--Sobic006G097900 Sobic010G268700--Sobic005G060200 Sobic010G268700--Sobic001G301000 Sobic005G216600 Sobic005G216600 Sobic010G268700--Sobic005G216600 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic010G268700--Sobic001G293100 Sobic005G197500 Sobic005G197500 Sobic010G268700--Sobic005G197500 Sobic010G268700--Sobic008G010500 Sobic010G268700--Sobic004G002901 Sobic003G161400 Sobic003G161400 Sobic010G268700--Sobic003G161400 Sobic007G073000 Sobic007G073000 Sobic007G135100--Sobic007G073000 Sobic004G014600 Sobic004G014600 Sobic007G135100--Sobic004G014600 Sobic005G046801 Sobic005G046801 Sobic007G135100--Sobic005G046801 Sobic010G028100 Sobic010G028100 Sobic007G135100--Sobic010G028100 Sobic002G146000 Sobic002G146000 Sobic007G135100--Sobic002G146000 Sobic006G092700 Sobic006G092700 Sobic007G135100--Sobic006G092700 Sobic002G195600 Sobic002G195600 Sobic007G135100--Sobic002G195600 Sobic005G224200 Sobic005G224200 Sobic007G135100--Sobic005G224200 Sobic007G090600 Sobic007G090600 Sobic007G135100--Sobic007G090600 Sobic010G013000--Sobic008G010500 Sobic007G186500 Sobic007G186500 Sobic010G013000--Sobic007G186500 Sobic004G003100 Sobic004G003100 Sobic010G013000--Sobic004G003100 Sobic010G013000--Sobic010G268700 Sobic010G013000--Sobic001G301000 Sobic010G013000--Sobic002G025500 Sobic002G028632 Sobic002G028632 Sobic010G013000--Sobic002G028632 Sobic010G013000--Sobic003G357700 Sobic010G013000--Sobic001G231800 Sobic001G232200 Sobic001G232200 Sobic001G487800--Sobic001G232200 Sobic005G202300 Sobic005G202300 Sobic001G487800--Sobic005G202300 Sobic010G168400 Sobic010G168400 Sobic001G487800--Sobic010G168400 Sobic003G282200 Sobic003G282200 Sobic001G487800--Sobic003G282200 Sobic001G058300 Sobic001G058300 Sobic001G487800--Sobic001G058300 Sobic002G228800 Sobic002G228800 Sobic001G487800--Sobic002G228800 Sobic006G003600 Sobic006G003600 Sobic001G487800--Sobic006G003600 Sobic004G119800 Sobic004G119800 Sobic001G487800--Sobic004G119800 Sobic010G267200 Sobic010G267200 Sobic001G487800--Sobic010G267200 Sobic002G196000 Sobic002G196000 Sobic009G219300--Sobic002G196000 Sobic009G219300--Sobic001G232400 Sobic009G219300--Sobic005G046801 Sobic004G121800 Sobic004G121800 Sobic009G219300--Sobic004G121800 Sobic004G008300 Sobic004G008300 Sobic009G219300--Sobic004G008300 Sobic009G219300--Sobic007G186500 Sobic009G076300 Sobic009G076300 Sobic009G219300--Sobic009G076300 Sobic009G004950 Sobic009G004950 Sobic009G219300--Sobic009G004950 Sobic009G219300--Sobic003G161400
Octagon: transcription factors


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