Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G236600.1
Synonym Sb09g028910
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YVW1
Pfam -
Panther DB PTHR33264 PTHR33264:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G01516 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g49340.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044617
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G419400 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@DnaK family protein, putative, expressed K03283: heat shock 70kDa protein 1/2/6/8
2 Sobic.003G100100 - -
3 Sobic.003G186600 OsFBX13 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.010G083550 - -
5 Sobic.004G028700 polygalacturonase, putative, expressed -
6 Sobic.006G084201 - -
7 Sobic.003G092000 expressed protein K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
8 Sobic.010G081300 expressed protein -
9 Sobic.003G398600 OsMADS98 - MADS-box family gene with M-beta type-box, expressed -
10 Sobic.002G279400 DUF630/DUF632 domains containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.009G118500 zinc finger protein, putative, expressed -
12 Sobic.006G066400 cytochrome P450, putative, expressed K00517: indol-3-yl-methylglucosinolate hydroxylase
13 Sobic.009G154400 - -
14 Sobic.007G067900 expressed protein -
15 Sobic.006G217500 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
16 Sobic.009G128400 peptide-N4-asparagine amidase A, putative, expressed -
17 Sobic.001G468000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@DUF677 domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.005G002350 - -
19 Sobic.001G497800 DUF623 domain containing protein, expressed -
20 Sobic.004G014300 THION20 - Plant thionin family protein precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G236600 Sobic009G236600 Sobic001G419400 Sobic001G419400 Sobic009G236600--Sobic001G419400 Sobic003G100100 Sobic003G100100 Sobic009G236600--Sobic003G100100 Sobic003G186600 Sobic003G186600 Sobic009G236600--Sobic003G186600 Sobic010G083550 Sobic010G083550 Sobic009G236600--Sobic010G083550 Sobic004G028700 Sobic004G028700 Sobic009G236600--Sobic004G028700 Sobic006G084201 Sobic006G084201 Sobic009G236600--Sobic006G084201 Sobic003G092000 Sobic003G092000 Sobic009G236600--Sobic003G092000 Sobic010G081300 Sobic010G081300 Sobic009G236600--Sobic010G081300 Sobic003G398600 Sobic003G398600 Sobic009G236600--Sobic003G398600 Sobic007G048300 Sobic007G048300 Sobic001G419400--Sobic007G048300 Sobic004G015000 Sobic004G015000 Sobic001G419400--Sobic004G015000 Sobic005G009900 Sobic005G009900 Sobic001G419400--Sobic005G009900 Sobic001G419400--Sobic003G398600 Sobic005G189500 Sobic005G189500 Sobic001G419400--Sobic005G189500 Sobic007G125800 Sobic007G125800 Sobic001G419400--Sobic007G125800 Sobic001G419400--Sobic010G081300 Sobic002G331900 Sobic002G331900 Sobic001G419400--Sobic002G331900 Sobic004G029200 Sobic004G029200 Sobic001G419400--Sobic004G029200 Sobic009G154400 Sobic009G154400 Sobic003G100100--Sobic009G154400 Sobic003G100100--Sobic001G419400 Sobic002G051900 Sobic002G051900 Sobic003G100100--Sobic002G051900 Sobic003G100100--Sobic009G236600 Sobic006G093500 Sobic006G093500 Sobic003G100100--Sobic006G093500 Sobic009G115200 Sobic009G115200 Sobic003G100100--Sobic009G115200 Sobic001G088600 Sobic001G088600 Sobic003G100100--Sobic001G088600 Sobic004G014300 Sobic004G014300 Sobic003G100100--Sobic004G014300 Sobic009G191801 Sobic009G191801 Sobic003G100100--Sobic009G191801 Sobic002G306500 Sobic002G306500 Sobic003G186600--Sobic002G306500 Sobic007G072600 Sobic007G072600 Sobic003G186600--Sobic007G072600 Sobic001G043700 Sobic001G043700 Sobic003G186600--Sobic001G043700 Sobic003G186600--Sobic009G236600 Sobic008G147000 Sobic008G147000 Sobic003G186600--Sobic008G147000 Sobic005G033700 Sobic005G033700 Sobic003G186600--Sobic005G033700 Sobic001G201601 Sobic001G201601 Sobic003G186600--Sobic001G201601 Sobic005G030600 Sobic005G030600 Sobic003G186600--Sobic005G030600 Sobic010G180200 Sobic010G180200 Sobic003G186600--Sobic010G180200 Sobic006G211900 Sobic006G211900 Sobic010G083550--Sobic006G211900 Sobic006G140801 Sobic006G140801 Sobic010G083550--Sobic006G140801 Sobic002G279400 Sobic002G279400 Sobic010G083550--Sobic002G279400 Sobic003G002000 Sobic003G002000 Sobic010G083550--Sobic003G002000 Sobic009G057800 Sobic009G057800 Sobic010G083550--Sobic009G057800 Sobic007G209200 Sobic007G209200 Sobic010G083550--Sobic007G209200 Sobic009G208300 Sobic009G208300 Sobic010G083550--Sobic009G208300 Sobic006G274200 Sobic006G274200 Sobic010G083550--Sobic006G274200 Sobic010G023400 Sobic010G023400 Sobic010G083550--Sobic010G023400 Sobic008G070200 Sobic008G070200 Sobic004G028700--Sobic008G070200 Sobic009G040100 Sobic009G040100 Sobic004G028700--Sobic009G040100 Sobic005G125800 Sobic005G125800 Sobic004G028700--Sobic005G125800 Sobic005G042300 Sobic005G042300 Sobic004G028700--Sobic005G042300 Sobic003G402100 Sobic003G402100 Sobic004G028700--Sobic003G402100 Sobic004G028700--Sobic004G014300 Sobic005G116000 Sobic005G116000 Sobic004G028700--Sobic005G116000 Sobic005G051700 Sobic005G051700 Sobic004G028700--Sobic005G051700 Sobic003G029900 Sobic003G029900 Sobic004G028700--Sobic003G029900 Sobic001G143400 Sobic001G143400 Sobic006G084201--Sobic001G143400 Sobic002G268300 Sobic002G268300 Sobic006G084201--Sobic002G268300 Sobic010G220800 Sobic010G220800 Sobic006G084201--Sobic010G220800 Sobic004G000800 Sobic004G000800 Sobic006G084201--Sobic004G000800 Sobic010G168700 Sobic010G168700 Sobic006G084201--Sobic010G168700 Sobic004G003700 Sobic004G003700 Sobic006G084201--Sobic004G003700 Sobic001G313800 Sobic001G313800 Sobic006G084201--Sobic001G313800 Sobic002G426000 Sobic002G426000 Sobic006G084201--Sobic002G426000 Sobic009G047500 Sobic009G047500 Sobic006G084201--Sobic009G047500 Sobic010G078400 Sobic010G078400 Sobic003G092000--Sobic010G078400 Sobic002G390700 Sobic002G390700 Sobic003G092000--Sobic002G390700 Sobic008G017600 Sobic008G017600 Sobic003G092000--Sobic008G017600 Sobic003G092000--Sobic003G398600 Sobic009G128400 Sobic009G128400 Sobic003G092000--Sobic009G128400 Sobic001G088000 Sobic001G088000 Sobic003G092000--Sobic001G088000 Sobic002G187200 Sobic002G187200 Sobic003G092000--Sobic002G187200 Sobic009G180700 Sobic009G180700 Sobic003G092000--Sobic009G180700 Sobic005G141200 Sobic005G141200 Sobic003G092000--Sobic005G141200 Sobic010G081300--Sobic004G029200 Sobic010G081300--Sobic005G009900 Sobic010G081300--Sobic003G398600 Sobic008G130350 Sobic008G130350 Sobic010G081300--Sobic008G130350 Sobic003G279000 Sobic003G279000 Sobic010G081300--Sobic003G279000 Sobic001G538200 Sobic001G538200 Sobic010G081300--Sobic001G538200 Sobic001G494700 Sobic001G494700 Sobic010G081300--Sobic001G494700 Sobic001G129750 Sobic001G129750 Sobic010G081300--Sobic001G129750 Sobic003G020900 Sobic003G020900 Sobic010G081300--Sobic003G020900 Sobic003G398600--Sobic010G081300 Sobic003G398600--Sobic005G009900 Sobic003G398600--Sobic007G048300 Sobic003G398600--Sobic001G419400 Sobic003G398600--Sobic004G029200 Sobic003G398600--Sobic004G015000 Sobic003G398600--Sobic005G189500 Sobic003G398600--Sobic002G331900 Sobic003G066600 Sobic003G066600 Sobic003G398600--Sobic003G066600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.