Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G084201.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RDT2
Pfam -
Panther DB PTHR31948 PTHR31948:SF18
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G24660 : homeobox protein 22
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g35500.1 : ZF-HD protein dimerisation region containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a011339
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G075950.2 , HORVU2Hr1G075950.3 , HORVU2Hr1G075950.1
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G143400 Trihelix Family(PubMedID : 24864043)@transcription factor, putative, expressed -
2 Sobic.002G268300 3-ketoacyl-CoA synthase precursor, putative, expressed -
3 Sobic.010G220800 zinc-binding protein, putative, expressed -
4 Sobic.004G000800 ZOS7-01 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
5 Sobic.010G168700 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
6 Sobic.004G003700 Trihelix Family(PubMedID : 24864043)@expressed protein -
7 Sobic.001G313800 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G426000 - -
9 Sobic.009G047500 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
10 Sobic.010G035100 AP2 domain containing protein, expressed -
11 Sobic.005G168400 expressed protein -
12 Sobic.003G092400 expressed protein K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
13 Sobic.008G138000 XH domain containing protein, expressed -
14 Sobic.007G121200 YDG/SRA domain containing protein, expressed -
15 Sobic.007G147200 OsSub56 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
16 Sobic.001G101700 OsGIF1(Ortholog in rice:He et al. (2017))(PubMedID : 31659832)@GRF-interacting factor 1, putative, expressed -
17 Sobic.003G238800 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
18 Sobic.002G346700 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
19 Sobic.010G070900 keratin, type I cytoskeletal 9, putative, expressed -
20 Sobic.006G006400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G084201 Sobic006G084201 Sobic001G143400 Sobic001G143400 Sobic006G084201--Sobic001G143400 Sobic002G268300 Sobic002G268300 Sobic006G084201--Sobic002G268300 Sobic010G220800 Sobic010G220800 Sobic006G084201--Sobic010G220800 Sobic004G000800 Sobic004G000800 Sobic006G084201--Sobic004G000800 Sobic010G168700 Sobic010G168700 Sobic006G084201--Sobic010G168700 Sobic004G003700 Sobic004G003700 Sobic006G084201--Sobic004G003700 Sobic001G313800 Sobic001G313800 Sobic006G084201--Sobic001G313800 Sobic002G426000 Sobic002G426000 Sobic006G084201--Sobic002G426000 Sobic009G047500 Sobic009G047500 Sobic006G084201--Sobic009G047500 Sobic001G143400--Sobic004G003700 Sobic001G143400--Sobic010G168700 Sobic005G168400 Sobic005G168400 Sobic001G143400--Sobic005G168400 Sobic007G147200 Sobic007G147200 Sobic001G143400--Sobic007G147200 Sobic010G070900 Sobic010G070900 Sobic001G143400--Sobic010G070900 Sobic001G143400--Sobic009G047500 Sobic005G199700 Sobic005G199700 Sobic001G143400--Sobic005G199700 Sobic008G138000 Sobic008G138000 Sobic001G143400--Sobic008G138000 Sobic007G209200 Sobic007G209200 Sobic001G143400--Sobic007G209200 Sobic002G268300--Sobic004G000800 Sobic002G268300--Sobic001G313800 Sobic003G238800 Sobic003G238800 Sobic002G268300--Sobic003G238800 Sobic002G268300--Sobic010G220800 Sobic004G254300 Sobic004G254300 Sobic002G268300--Sobic004G254300 Sobic002G268300--Sobic002G426000 Sobic002G344201 Sobic002G344201 Sobic002G268300--Sobic002G344201 Sobic004G056500 Sobic004G056500 Sobic002G268300--Sobic004G056500 Sobic003G231000 Sobic003G231000 Sobic002G268300--Sobic003G231000 Sobic010G220800--Sobic001G313800 Sobic010G220800--Sobic004G254300 Sobic007G218400 Sobic007G218400 Sobic010G220800--Sobic007G218400 Sobic010G220800--Sobic002G268300 Sobic010G169200 Sobic010G169200 Sobic010G220800--Sobic010G169200 Sobic009G059800 Sobic009G059800 Sobic010G220800--Sobic009G059800 Sobic009G059932 Sobic009G059932 Sobic010G220800--Sobic009G059932 Sobic009G059866 Sobic009G059866 Sobic010G220800--Sobic009G059866 Sobic002G102800 Sobic002G102800 Sobic010G220800--Sobic002G102800 Sobic004G000800--Sobic002G268300 Sobic004G000800--Sobic001G313800 Sobic001G123650 Sobic001G123650 Sobic004G000800--Sobic001G123650 Sobic010G168700--Sobic009G047500 Sobic010G168700--Sobic001G143400 Sobic010G168700--Sobic005G168400 Sobic010G168700--Sobic004G003700 Sobic010G168700--Sobic010G070900 Sobic010G168700--Sobic005G199700 Sobic010G276600 Sobic010G276600 Sobic010G168700--Sobic010G276600 Sobic010G168700--Sobic002G426000 Sobic006G273600 Sobic006G273600 Sobic010G168700--Sobic006G273600 Sobic004G003700--Sobic001G143400 Sobic004G003700--Sobic007G209200 Sobic004G003700--Sobic010G168700 Sobic004G003700--Sobic007G147200 Sobic006G221800 Sobic006G221800 Sobic004G003700--Sobic006G221800 Sobic004G003700--Sobic009G047500 Sobic001G101700 Sobic001G101700 Sobic004G003700--Sobic001G101700 Sobic004G003700--Sobic005G168400 Sobic004G003700--Sobic008G138000 Sobic002G346700 Sobic002G346700 Sobic001G313800--Sobic002G346700 Sobic001G313800--Sobic004G254300 Sobic001G313800--Sobic004G056500 Sobic002G023500 Sobic002G023500 Sobic001G313800--Sobic002G023500 Sobic001G313800--Sobic002G268300 Sobic010G130900 Sobic010G130900 Sobic001G313800--Sobic010G130900 Sobic004G316000 Sobic004G316000 Sobic001G313800--Sobic004G316000 Sobic010G144600 Sobic010G144600 Sobic001G313800--Sobic010G144600 Sobic001G313800--Sobic002G102800 Sobic002G426000--Sobic002G268300 Sobic002G426000--Sobic004G000800 Sobic002G426000--Sobic010G070900 Sobic002G426000--Sobic010G220800 Sobic002G426000--Sobic010G168700 Sobic007G121200 Sobic007G121200 Sobic002G426000--Sobic007G121200 Sobic003G046400 Sobic003G046400 Sobic002G426000--Sobic003G046400 Sobic004G237000 Sobic004G237000 Sobic002G426000--Sobic004G237000 Sobic007G033700 Sobic007G033700 Sobic002G426000--Sobic007G033700 Sobic009G047500--Sobic010G168700 Sobic009G047500--Sobic004G003700 Sobic009G047500--Sobic001G143400 Sobic001G393200 Sobic001G393200 Sobic009G047500--Sobic001G393200 Sobic009G047500--Sobic005G168400 Sobic010G235300 Sobic010G235300 Sobic009G047500--Sobic010G235300 Sobic001G347201 Sobic001G347201 Sobic009G047500--Sobic001G347201 Sobic009G047500--Sobic006G084201 Sobic009G047500--Sobic006G273600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.