Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G168400.1
Synonym Sb05g022870
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y5C6
Pfam PF14383 PF14309
Panther DB PTHR31680 PTHR31680:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G63430 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g37670.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033924
Brachypodium KQJ88022
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G168700 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
2 Sobic.001G143400 Trihelix Family(PubMedID : 24864043)@transcription factor, putative, expressed -
3 Sobic.004G003700 Trihelix Family(PubMedID : 24864043)@expressed protein -
4 Sobic.003G319900 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf and root"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.1 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family
5 Sobic.001G393200 expressed protein -
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10 Sobic.006G232900 expressed protein -
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12 Sobic.006G084201 - -
13 Sobic.002G426000 - -
14 Sobic.010G070900 keratin, type I cytoskeletal 9, putative, expressed -
15 Sobic.008G088800 expressed protein -
16 Sobic.002G268300 3-ketoacyl-CoA synthase precursor, putative, expressed -
17 Sobic.008G125700 similar to F22D16.26 protein(PubMedID : 29862293)@CSLD4 - cellulose synthase-like family D, expressed K00770: 1,4-beta-D-xylan synthase
18 Sobic.002G360500 expressed protein -
19 Sobic.007G147200 OsSub56 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
20 Sobic.004G000800 ZOS7-01 - C2H2 zinc finger protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G168400 Sobic005G168400 Sobic010G168700 Sobic010G168700 Sobic005G168400--Sobic010G168700 Sobic001G143400 Sobic001G143400 Sobic005G168400--Sobic001G143400 Sobic004G003700 Sobic004G003700 Sobic005G168400--Sobic004G003700 Sobic003G319900 Sobic003G319900 Sobic005G168400--Sobic003G319900 Sobic001G393200 Sobic001G393200 Sobic005G168400--Sobic001G393200 Sobic009G047500 Sobic009G047500 Sobic005G168400--Sobic009G047500 Sobic005G199700 Sobic005G199700 Sobic005G168400--Sobic005G199700 Sobic001G379900 Sobic001G379900 Sobic005G168400--Sobic001G379900 Sobic007G152300 Sobic007G152300 Sobic005G168400--Sobic007G152300 Sobic010G168700--Sobic009G047500 Sobic010G168700--Sobic001G143400 Sobic010G168700--Sobic005G168400 Sobic010G168700--Sobic004G003700 Sobic010G070900 Sobic010G070900 Sobic010G168700--Sobic010G070900 Sobic010G168700--Sobic005G199700 Sobic010G276600 Sobic010G276600 Sobic010G168700--Sobic010G276600 Sobic002G426000 Sobic002G426000 Sobic010G168700--Sobic002G426000 Sobic006G273600 Sobic006G273600 Sobic010G168700--Sobic006G273600 Sobic001G143400--Sobic004G003700 Sobic001G143400--Sobic010G168700 Sobic001G143400--Sobic005G168400 Sobic007G147200 Sobic007G147200 Sobic001G143400--Sobic007G147200 Sobic001G143400--Sobic010G070900 Sobic001G143400--Sobic009G047500 Sobic001G143400--Sobic005G199700 Sobic008G138000 Sobic008G138000 Sobic001G143400--Sobic008G138000 Sobic007G209200 Sobic007G209200 Sobic001G143400--Sobic007G209200 Sobic004G003700--Sobic001G143400 Sobic004G003700--Sobic007G209200 Sobic004G003700--Sobic010G168700 Sobic004G003700--Sobic007G147200 Sobic006G221800 Sobic006G221800 Sobic004G003700--Sobic006G221800 Sobic004G003700--Sobic009G047500 Sobic001G101700 Sobic001G101700 Sobic004G003700--Sobic001G101700 Sobic004G003700--Sobic005G168400 Sobic004G003700--Sobic008G138000 Sobic003G319900--Sobic005G168400 Sobic010G220800 Sobic010G220800 Sobic003G319900--Sobic010G220800 Sobic002G205000 Sobic002G205000 Sobic003G319900--Sobic002G205000 Sobic010G169200 Sobic010G169200 Sobic003G319900--Sobic010G169200 Sobic004G237000 Sobic004G237000 Sobic003G319900--Sobic004G237000 Sobic002G268300 Sobic002G268300 Sobic003G319900--Sobic002G268300 Sobic003G091700 Sobic003G091700 Sobic003G319900--Sobic003G091700 Sobic001G160100 Sobic001G160100 Sobic003G319900--Sobic001G160100 Sobic003G319900--Sobic002G426000 Sobic001G393200--Sobic010G168700 Sobic001G393200--Sobic009G047500 Sobic001G393200--Sobic005G168400 Sobic008G125700 Sobic008G125700 Sobic001G393200--Sobic008G125700 Sobic002G360500 Sobic002G360500 Sobic001G393200--Sobic002G360500 Sobic001G347201 Sobic001G347201 Sobic001G393200--Sobic001G347201 Sobic001G393200--Sobic005G199700 Sobic010G119300 Sobic010G119300 Sobic001G393200--Sobic010G119300 Sobic007G180200 Sobic007G180200 Sobic001G393200--Sobic007G180200 Sobic009G047500--Sobic010G168700 Sobic009G047500--Sobic004G003700 Sobic009G047500--Sobic001G143400 Sobic009G047500--Sobic001G393200 Sobic009G047500--Sobic005G168400 Sobic010G235300 Sobic010G235300 Sobic009G047500--Sobic010G235300 Sobic009G047500--Sobic001G347201 Sobic006G084201 Sobic006G084201 Sobic009G047500--Sobic006G084201 Sobic009G047500--Sobic006G273600 Sobic009G146700 Sobic009G146700 Sobic005G199700--Sobic009G146700 Sobic003G338700 Sobic003G338700 Sobic005G199700--Sobic003G338700 Sobic002G363300 Sobic002G363300 Sobic005G199700--Sobic002G363300 Sobic005G199700--Sobic007G180200 Sobic001G286700 Sobic001G286700 Sobic005G199700--Sobic001G286700 Sobic005G199700--Sobic006G273600 Sobic003G010700 Sobic003G010700 Sobic005G199700--Sobic003G010700 Sobic003G027100 Sobic003G027100 Sobic005G199700--Sobic003G027100 Sobic010G014700 Sobic010G014700 Sobic005G199700--Sobic010G014700 Sobic001G379900--Sobic004G003700 Sobic010G077000 Sobic010G077000 Sobic001G379900--Sobic010G077000 Sobic001G379900--Sobic010G276600 Sobic001G379900--Sobic006G221800 Sobic001G493900 Sobic001G493900 Sobic001G379900--Sobic001G493900 Sobic006G163300 Sobic006G163300 Sobic001G379900--Sobic006G163300 Sobic001G379900--Sobic001G143400 Sobic001G379900--Sobic003G010700 Sobic003G307200 Sobic003G307200 Sobic001G379900--Sobic003G307200 Sobic007G152300--Sobic005G168400 Sobic007G152300--Sobic004G003700 Sobic007G152300--Sobic001G143400 Sobic006G154000 Sobic006G154000 Sobic007G152300--Sobic006G154000 Sobic001G384700 Sobic001G384700 Sobic007G152300--Sobic001G384700 Sobic007G152300--Sobic010G168700 Sobic002G050700 Sobic002G050700 Sobic007G152300--Sobic002G050700 Sobic009G185900 Sobic009G185900 Sobic007G152300--Sobic009G185900 Sobic007G152300--Sobic001G379900
Octagon: transcription factors


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