Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G393200.1
Synonym Sb01g037240
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S9U6
Pfam -
Panther DB PTHR33124 PTHR33124:SF12
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G17100 : sequence-specific DNA binding transcription factors
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g19780.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052541 , Zm00025a002196
Brachypodium KQK21965
Barley HORVU0Hr1G008050.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G168700 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
2 Sobic.009G047500 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
3 Sobic.005G168400 expressed protein -
4 Sobic.008G125700 similar to F22D16.26 protein(PubMedID : 29862293)@CSLD4 - cellulose synthase-like family D, expressed K00770: 1,4-beta-D-xylan synthase
5 Sobic.002G360500 expressed protein -
6 Sobic.001G347201 - -
7 Sobic.005G199700 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
8 Sobic.010G119300 expressed protein -
9 Sobic.007G180200 NC domain-containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.010G235300 acyl-desaturase, chloroplast precursor, putative, expressed K03921: FAB2, SSI2, acyl-[acyl-carrier-protein] desaturase
11 Sobic.001G299600 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
12 Sobic.003G084100 expressed protein -
13 Sobic.003G102000 expressed protein -
14 Sobic.004G003700 Trihelix Family(PubMedID : 24864043)@expressed protein -
15 Sobic.009G217800 - -
16 Sobic.001G143400 Trihelix Family(PubMedID : 24864043)@transcription factor, putative, expressed -
17 Sobic.009G087700 proline-rich family protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G227900 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
19 Sobic.001G496400 Homologous to EPF/EPFL genes in Arabidopsis. Modelling of protein structure.(PubMedID : 23755192)@expressed protein -
20 Sobic.006G273600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G393200 Sobic001G393200 Sobic010G168700 Sobic010G168700 Sobic001G393200--Sobic010G168700 Sobic009G047500 Sobic009G047500 Sobic001G393200--Sobic009G047500 Sobic005G168400 Sobic005G168400 Sobic001G393200--Sobic005G168400 Sobic008G125700 Sobic008G125700 Sobic001G393200--Sobic008G125700 Sobic002G360500 Sobic002G360500 Sobic001G393200--Sobic002G360500 Sobic001G347201 Sobic001G347201 Sobic001G393200--Sobic001G347201 Sobic005G199700 Sobic005G199700 Sobic001G393200--Sobic005G199700 Sobic010G119300 Sobic010G119300 Sobic001G393200--Sobic010G119300 Sobic007G180200 Sobic007G180200 Sobic001G393200--Sobic007G180200 Sobic010G168700--Sobic009G047500 Sobic001G143400 Sobic001G143400 Sobic010G168700--Sobic001G143400 Sobic010G168700--Sobic005G168400 Sobic004G003700 Sobic004G003700 Sobic010G168700--Sobic004G003700 Sobic010G070900 Sobic010G070900 Sobic010G168700--Sobic010G070900 Sobic010G168700--Sobic005G199700 Sobic010G276600 Sobic010G276600 Sobic010G168700--Sobic010G276600 Sobic002G426000 Sobic002G426000 Sobic010G168700--Sobic002G426000 Sobic006G273600 Sobic006G273600 Sobic010G168700--Sobic006G273600 Sobic009G047500--Sobic010G168700 Sobic009G047500--Sobic004G003700 Sobic009G047500--Sobic001G143400 Sobic009G047500--Sobic001G393200 Sobic009G047500--Sobic005G168400 Sobic010G235300 Sobic010G235300 Sobic009G047500--Sobic010G235300 Sobic009G047500--Sobic001G347201 Sobic006G084201 Sobic006G084201 Sobic009G047500--Sobic006G084201 Sobic009G047500--Sobic006G273600 Sobic005G168400--Sobic010G168700 Sobic005G168400--Sobic001G143400 Sobic005G168400--Sobic004G003700 Sobic003G319900 Sobic003G319900 Sobic005G168400--Sobic003G319900 Sobic005G168400--Sobic001G393200 Sobic005G168400--Sobic009G047500 Sobic005G168400--Sobic005G199700 Sobic001G379900 Sobic001G379900 Sobic005G168400--Sobic001G379900 Sobic007G152300 Sobic007G152300 Sobic005G168400--Sobic007G152300 Sobic008G125700--Sobic010G119300 Sobic008G114900 Sobic008G114900 Sobic008G125700--Sobic008G114900 Sobic003G102000 Sobic003G102000 Sobic008G125700--Sobic003G102000 Sobic003G260700 Sobic003G260700 Sobic008G125700--Sobic003G260700 Sobic004G198100 Sobic004G198100 Sobic008G125700--Sobic004G198100 Sobic008G006800 Sobic008G006800 Sobic008G125700--Sobic008G006800 Sobic002G313000 Sobic002G313000 Sobic008G125700--Sobic002G313000 Sobic004G339500 Sobic004G339500 Sobic008G125700--Sobic004G339500 Sobic008G125700--Sobic005G199700 Sobic002G417000 Sobic002G417000 Sobic002G360500--Sobic002G417000 Sobic001G518000 Sobic001G518000 Sobic002G360500--Sobic001G518000 Sobic003G307200 Sobic003G307200 Sobic002G360500--Sobic003G307200 Sobic001G493900 Sobic001G493900 Sobic002G360500--Sobic001G493900 Sobic002G360500--Sobic004G003700 Sobic010G211800 Sobic010G211800 Sobic002G360500--Sobic010G211800 Sobic002G360500--Sobic008G114900 Sobic001G155700 Sobic001G155700 Sobic002G360500--Sobic001G155700 Sobic002G360500--Sobic008G006800 Sobic001G347201--Sobic001G393200 Sobic001G347201--Sobic009G047500 Sobic001G347201--Sobic010G168700 Sobic001G347201--Sobic008G125700 Sobic001G347201--Sobic010G119300 Sobic001G347201--Sobic001G143400 Sobic003G084100 Sobic003G084100 Sobic001G347201--Sobic003G084100 Sobic001G347201--Sobic004G003700 Sobic001G347201--Sobic005G168400 Sobic009G146700 Sobic009G146700 Sobic005G199700--Sobic009G146700 Sobic003G338700 Sobic003G338700 Sobic005G199700--Sobic003G338700 Sobic002G363300 Sobic002G363300 Sobic005G199700--Sobic002G363300 Sobic005G199700--Sobic007G180200 Sobic001G286700 Sobic001G286700 Sobic005G199700--Sobic001G286700 Sobic005G199700--Sobic006G273600 Sobic003G010700 Sobic003G010700 Sobic005G199700--Sobic003G010700 Sobic003G027100 Sobic003G027100 Sobic005G199700--Sobic003G027100 Sobic010G014700 Sobic010G014700 Sobic005G199700--Sobic010G014700 Sobic010G119300--Sobic008G125700 Sobic010G119300--Sobic008G006800 Sobic010G119300--Sobic003G260700 Sobic010G119300--Sobic004G198100 Sobic010G119300--Sobic003G102000 Sobic005G005700 Sobic005G005700 Sobic010G119300--Sobic005G005700 Sobic010G119300--Sobic004G339500 Sobic010G119300--Sobic008G114900 Sobic001G398400 Sobic001G398400 Sobic010G119300--Sobic001G398400 Sobic007G180200--Sobic005G199700 Sobic007G165800 Sobic007G165800 Sobic007G180200--Sobic007G165800 Sobic001G299600 Sobic001G299600 Sobic007G180200--Sobic001G299600 Sobic007G180200--Sobic003G338700 Sobic007G180200--Sobic003G027100 Sobic007G180200--Sobic009G146700 Sobic001G199400 Sobic001G199400 Sobic007G180200--Sobic001G199400 Sobic007G180200--Sobic010G014700 Sobic007G180200--Sobic010G235300
Octagon: transcription factors


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