Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G088800.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PCC2
Pfam -
Panther DB PTHR38398:SF1 PTHR38398
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G50335 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g14220.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054300
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G070900 keratin, type I cytoskeletal 9, putative, expressed -
2 Sobic.003G010700 plant-specific domain TIGR01568 family protein, expressed -
3 Sobic.010G168700 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
4 Sobic.001G175100 DEK C terminal domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G168400 expressed protein -
6 Sobic.001G143400 Trihelix Family(PubMedID : 24864043)@transcription factor, putative, expressed -
7 Sobic.006G163300 aldehyde dehydrogenase, putative, expressed K00128: aldehyde dehydrogenase (NAD+)
8 Sobic.001G455900 "qGL3-2/qLGY3(Ortholog in rice:Yu et al., 2018/Liu et al., 2018)"(PubMedID : 31659846)@determinacy of the spikelet meristem and determining the identity of lemmas and paleas(PubMedID : 15208396)@OsMADS1 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
9 Sobic.004G003700 Trihelix Family(PubMedID : 24864043)@expressed protein -
10 Sobic.002G426000 - -
11 Sobic.003G046400 transcriptional corepressor LEUNIG, putative, expressed -
12 Sobic.001G101900 SCP-like extracellular protein, expressed -
13 Sobic.008G125700 similar to F22D16.26 protein(PubMedID : 29862293)@CSLD4 - cellulose synthase-like family D, expressed K00770: 1,4-beta-D-xylan synthase
14 Sobic.007G147200 OsSub56 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
15 Sobic.005G199700 leucine-rich repeat family protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G237000 down-regulated TF in developmental senescence(PubMedID : 27586543)@"PGL2(Ortholog in rice:Heang and Sassa, 2012b(PubMedID : 31659886)@helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
17 Sobic.002G360600 expressed protein -
18 Sobic.007G121200 YDG/SRA domain containing protein, expressed -
19 Sobic.007G033700 OsFBX309 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G493900 beta-galactosidase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G088800 Sobic008G088800 Sobic010G070900 Sobic010G070900 Sobic008G088800--Sobic010G070900 Sobic003G010700 Sobic003G010700 Sobic008G088800--Sobic003G010700 Sobic010G168700 Sobic010G168700 Sobic008G088800--Sobic010G168700 Sobic001G175100 Sobic001G175100 Sobic008G088800--Sobic001G175100 Sobic005G168400 Sobic005G168400 Sobic008G088800--Sobic005G168400 Sobic001G143400 Sobic001G143400 Sobic008G088800--Sobic001G143400 Sobic006G163300 Sobic006G163300 Sobic008G088800--Sobic006G163300 Sobic001G455900 Sobic001G455900 Sobic008G088800--Sobic001G455900 Sobic004G003700 Sobic004G003700 Sobic008G088800--Sobic004G003700 Sobic007G147200 Sobic007G147200 Sobic010G070900--Sobic007G147200 Sobic002G360600 Sobic002G360600 Sobic010G070900--Sobic002G360600 Sobic003G046400 Sobic003G046400 Sobic010G070900--Sobic003G046400 Sobic010G070900--Sobic006G163300 Sobic006G107500 Sobic006G107500 Sobic010G070900--Sobic006G107500 Sobic002G426000 Sobic002G426000 Sobic010G070900--Sobic002G426000 Sobic007G033700 Sobic007G033700 Sobic010G070900--Sobic007G033700 Sobic010G070900--Sobic010G168700 Sobic010G070900--Sobic001G143400 Sobic002G363300 Sobic002G363300 Sobic003G010700--Sobic002G363300 Sobic006G273600 Sobic006G273600 Sobic003G010700--Sobic006G273600 Sobic007G170100 Sobic007G170100 Sobic003G010700--Sobic007G170100 Sobic003G010700--Sobic006G163300 Sobic005G199700 Sobic005G199700 Sobic003G010700--Sobic005G199700 Sobic003G010700--Sobic002G360600 Sobic009G146700 Sobic009G146700 Sobic003G010700--Sobic009G146700 Sobic003G338700 Sobic003G338700 Sobic003G010700--Sobic003G338700 Sobic010G276600 Sobic010G276600 Sobic003G010700--Sobic010G276600 Sobic009G047500 Sobic009G047500 Sobic010G168700--Sobic009G047500 Sobic010G168700--Sobic001G143400 Sobic010G168700--Sobic005G168400 Sobic010G168700--Sobic004G003700 Sobic010G168700--Sobic010G070900 Sobic010G168700--Sobic005G199700 Sobic010G168700--Sobic010G276600 Sobic010G168700--Sobic002G426000 Sobic010G168700--Sobic006G273600 Sobic008G070700 Sobic008G070700 Sobic001G175100--Sobic008G070700 Sobic001G175100--Sobic004G003700 Sobic004G198100 Sobic004G198100 Sobic001G175100--Sobic004G198100 Sobic006G221800 Sobic006G221800 Sobic001G175100--Sobic006G221800 Sobic001G101700 Sobic001G101700 Sobic001G175100--Sobic001G101700 Sobic001G175100--Sobic008G088800 Sobic001G175100--Sobic007G147200 Sobic001G175100--Sobic001G143400 Sobic008G138000 Sobic008G138000 Sobic001G175100--Sobic008G138000 Sobic005G168400--Sobic010G168700 Sobic005G168400--Sobic001G143400 Sobic005G168400--Sobic004G003700 Sobic003G319900 Sobic003G319900 Sobic005G168400--Sobic003G319900 Sobic001G393200 Sobic001G393200 Sobic005G168400--Sobic001G393200 Sobic005G168400--Sobic009G047500 Sobic005G168400--Sobic005G199700 Sobic001G379900 Sobic001G379900 Sobic005G168400--Sobic001G379900 Sobic007G152300 Sobic007G152300 Sobic005G168400--Sobic007G152300 Sobic001G143400--Sobic004G003700 Sobic001G143400--Sobic010G168700 Sobic001G143400--Sobic005G168400 Sobic001G143400--Sobic007G147200 Sobic001G143400--Sobic010G070900 Sobic001G143400--Sobic009G047500 Sobic001G143400--Sobic005G199700 Sobic001G143400--Sobic008G138000 Sobic007G209200 Sobic007G209200 Sobic001G143400--Sobic007G209200 Sobic006G163300--Sobic002G360600 Sobic006G163300--Sobic001G455900 Sobic006G163300--Sobic003G046400 Sobic006G163300--Sobic003G010700 Sobic006G163300--Sobic010G070900 Sobic006G163300--Sobic007G147200 Sobic006G163300--Sobic007G033700 Sobic006G163300--Sobic006G107500 Sobic001G101900 Sobic001G101900 Sobic006G163300--Sobic001G101900 Sobic001G455900--Sobic003G046400 Sobic001G455900--Sobic006G163300 Sobic001G455900--Sobic007G033700 Sobic009G243000 Sobic009G243000 Sobic001G455900--Sobic009G243000 Sobic010G247000 Sobic010G247000 Sobic001G455900--Sobic010G247000 Sobic006G271600 Sobic006G271600 Sobic001G455900--Sobic006G271600 Sobic001G071600 Sobic001G071600 Sobic001G455900--Sobic001G071600 Sobic001G137600 Sobic001G137600 Sobic001G455900--Sobic001G137600 Sobic001G455900--Sobic010G070900 Sobic004G003700--Sobic001G143400 Sobic004G003700--Sobic007G209200 Sobic004G003700--Sobic010G168700 Sobic004G003700--Sobic007G147200 Sobic004G003700--Sobic006G221800 Sobic004G003700--Sobic009G047500 Sobic004G003700--Sobic001G101700 Sobic004G003700--Sobic005G168400 Sobic004G003700--Sobic008G138000
Octagon: transcription factors


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