Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G036700.1,Sobic.010G036700.2
Synonym Sb10g003275
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YH70
Pfam -
Panther DB PTHR33120 PTHR33120:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g05410.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a050043
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G296250 - -
2 Sobic.009G223400 hypro1, putative, expressed -
3 Sobic.001G449300 LYK, putative, expressed -
4 Sobic.004G169401 - -
5 Sobic.006G121950 - -
6 Sobic.001G162600 - -
7 Sobic.001G524750 - -
8 Sobic.007G132650 - -
9 Sobic.004G317050 - -
10 Sobic.004G127350 - -
11 Sobic.006G265500 - -
12 Sobic.003G395800 photosystem II 44 kDa reaction center protein, putative, expressed K02705: photosystem II CP43 chlorophyll apoprotein
13 Sobic.003G072000 receptor kinase, putative, expressed -
14 Sobic.010G039150 - -
15 Sobic.002G348850 - -
16 Sobic.001G401750 - -
17 Sobic.006G149900 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G340100 - -
19 Sobic.002G118000 ATP synthase, putative, expressed -
20 Sobic.005G194400 ribulose bisphosphate carboxylase large chain precursor, putative, expressed K01601: ribulose-bisphosphate carboxylase large chain


Gene co-expression network
sample Sobic010G036700 Sobic010G036700 Sobic003G296250 Sobic003G296250 Sobic010G036700--Sobic003G296250 Sobic009G223400 Sobic009G223400 Sobic010G036700--Sobic009G223400 Sobic001G449300 Sobic001G449300 Sobic010G036700--Sobic001G449300 Sobic004G169401 Sobic004G169401 Sobic010G036700--Sobic004G169401 Sobic006G121950 Sobic006G121950 Sobic010G036700--Sobic006G121950 Sobic001G162600 Sobic001G162600 Sobic010G036700--Sobic001G162600 Sobic001G524750 Sobic001G524750 Sobic010G036700--Sobic001G524750 Sobic007G132650 Sobic007G132650 Sobic010G036700--Sobic007G132650 Sobic004G317050 Sobic004G317050 Sobic010G036700--Sobic004G317050 Sobic002G118000 Sobic002G118000 Sobic003G296250--Sobic002G118000 Sobic003G296250--Sobic007G132650 Sobic010G039150 Sobic010G039150 Sobic003G296250--Sobic010G039150 Sobic003G168600 Sobic003G168600 Sobic003G296250--Sobic003G168600 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic003G296250--Sobic004G272950 Sobic001G401750 Sobic001G401750 Sobic003G296250--Sobic001G401750 Sobic004G127350 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Octagon: transcription factors


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