Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G075800.1
Synonym Sb10g006593
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VRW2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.010G075800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G195450 - -
2 Sobic.008G116100 bifunctional 3-dehydroquinate dehydratase/shikimate dehydrogenase,chloroplast precursor, putative, expressed K13832: aroDE, 3-dehydroquinate dehydratase / shikimate dehydrogenase
3 Sobic.002G197800 ZOS4-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
4 Sobic.001G541400 LTPL112 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
5 Sobic.003G239500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@lipase, putative, expressed -
6 Sobic.007G041200 cytochrome P450, putative, expressed -
7 Sobic.002G097601 - -
8 Sobic.004G254500 tentative name(PubMedID : 31536532)@histone-like transcription factor and archaeal histone, putative, expressed -
9 Sobic.006G047700 "Gene located in Ma1, a phosphatidylethanolamine-binding (PEBP) protein domain, "(PubMedID : 27335143)@osFTL13 FT-Like13 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
10 Sobic.003G232332 - -
11 Sobic.005G176875 - -
12 Sobic.009G132650 - -
13 Sobic.010G195301 - -
14 Sobic.009G201100 metalloendoproteinase 1 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.005G074400 OsPDIL1-1 protein disulfide isomerase PDIL1-1, expressed K09580: PDIA1, protein disulfide-isomerase A1
16 Sobic.009G169050 - -
17 Sobic.003G037600 2-aminoethanethiol dioxygenase, putative, expressed K10712: cysteamine dioxygenase
18 Sobic.010G054800 LTPL128 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
19 Sobic.002G273000 OsFBL7 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
20 Sobic.010G084800 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G075800 Sobic010G075800 Sobic010G195450 Sobic010G195450 Sobic010G075800--Sobic010G195450 Sobic008G116100 Sobic008G116100 Sobic010G075800--Sobic008G116100 Sobic002G197800 Sobic002G197800 Sobic010G075800--Sobic002G197800 Sobic001G541400 Sobic001G541400 Sobic010G075800--Sobic001G541400 Sobic003G239500 Sobic003G239500 Sobic010G075800--Sobic003G239500 Sobic007G041200 Sobic007G041200 Sobic010G075800--Sobic007G041200 Sobic002G097601 Sobic002G097601 Sobic010G075800--Sobic002G097601 Sobic004G254500 Sobic004G254500 Sobic010G075800--Sobic004G254500 Sobic006G047700 Sobic006G047700 Sobic010G075800--Sobic006G047700 Sobic010G195450--Sobic006G047700 Sobic010G195450--Sobic002G197800 Sobic010G195450--Sobic004G254500 Sobic010G054800 Sobic010G054800 Sobic010G195450--Sobic010G054800 Sobic005G073700 Sobic005G073700 Sobic010G195450--Sobic005G073700 Sobic007G050900 Sobic007G050900 Sobic010G195450--Sobic007G050900 Sobic010G195450--Sobic001G541400 Sobic002G244800 Sobic002G244800 Sobic010G195450--Sobic002G244800 Sobic010G195450--Sobic008G116100 Sobic008G116100--Sobic007G041200 Sobic009G033500 Sobic009G033500 Sobic008G116100--Sobic009G033500 Sobic010G084800 Sobic010G084800 Sobic008G116100--Sobic010G084800 Sobic008G116100--Sobic002G097601 Sobic004G210000 Sobic004G210000 Sobic008G116100--Sobic004G210000 Sobic005G176875 Sobic005G176875 Sobic008G116100--Sobic005G176875 Sobic004G339900 Sobic004G339900 Sobic008G116100--Sobic004G339900 Sobic006G186300 Sobic006G186300 Sobic008G116100--Sobic006G186300 Sobic010G047300 Sobic010G047300 Sobic008G116100--Sobic010G047300 Sobic002G197800--Sobic006G047700 Sobic002G197800--Sobic010G195450 Sobic002G197800--Sobic004G254500 Sobic002G197800--Sobic010G054800 Sobic002G197800--Sobic001G541400 Sobic002G197800--Sobic005G073700 Sobic002G197800--Sobic002G244800 Sobic003G326200 Sobic003G326200 Sobic002G197800--Sobic003G326200 Sobic002G197800--Sobic007G050900 Sobic001G541400--Sobic002G197800 Sobic002G273000 Sobic002G273000 Sobic001G541400--Sobic002G273000 Sobic001G541400--Sobic010G195450 Sobic010G195301 Sobic010G195301 Sobic001G541400--Sobic010G195301 Sobic001G085200 Sobic001G085200 Sobic001G541400--Sobic001G085200 Sobic009G201100 Sobic009G201100 Sobic001G541400--Sobic009G201100 Sobic001G541400--Sobic005G176875 Sobic002G066000 Sobic002G066000 Sobic001G541400--Sobic002G066000 Sobic004G286301 Sobic004G286301 Sobic001G541400--Sobic004G286301 Sobic003G239500--Sobic004G339900 Sobic003G239500--Sobic010G195450 Sobic001G485200 Sobic001G485200 Sobic003G239500--Sobic001G485200 Sobic003G239500--Sobic010G054800 Sobic003G239500--Sobic008G116100 Sobic006G107900 Sobic006G107900 Sobic003G239500--Sobic006G107900 Sobic002G420400 Sobic002G420400 Sobic003G239500--Sobic002G420400 Sobic004G071050 Sobic004G071050 Sobic003G239500--Sobic004G071050 Sobic010G033500 Sobic010G033500 Sobic003G239500--Sobic010G033500 Sobic007G041200--Sobic008G116100 Sobic007G041200--Sobic009G033500 Sobic007G041200--Sobic010G084800 Sobic007G041200--Sobic010G047300 Sobic007G041200--Sobic002G097601 Sobic007G041200--Sobic006G186300 Sobic007G091200 Sobic007G091200 Sobic007G041200--Sobic007G091200 Sobic008G109600 Sobic008G109600 Sobic007G041200--Sobic008G109600 Sobic010G060100 Sobic010G060100 Sobic007G041200--Sobic010G060100 Sobic001G069100 Sobic001G069100 Sobic002G097601--Sobic001G069100 Sobic002G097601--Sobic007G041200 Sobic001G261700 Sobic001G261700 Sobic002G097601--Sobic001G261700 Sobic004G322550 Sobic004G322550 Sobic002G097601--Sobic004G322550 Sobic002G097601--Sobic005G176875 Sobic002G097601--Sobic010G084800 Sobic002G097601--Sobic010G047300 Sobic009G169050 Sobic009G169050 Sobic002G097601--Sobic009G169050 Sobic002G097601--Sobic008G116100 Sobic004G254500--Sobic006G047700 Sobic004G254500--Sobic002G197800 Sobic004G254500--Sobic010G195450 Sobic004G254500--Sobic010G054800 Sobic004G254500--Sobic005G073700 Sobic004G254500--Sobic007G050900 Sobic004G254500--Sobic002G244800 Sobic003G100000 Sobic003G100000 Sobic004G254500--Sobic003G100000 Sobic001G254700 Sobic001G254700 Sobic004G254500--Sobic001G254700 Sobic006G047700--Sobic002G197800 Sobic006G047700--Sobic004G254500 Sobic006G047700--Sobic010G054800 Sobic006G047700--Sobic010G195450 Sobic006G047700--Sobic005G073700 Sobic006G047700--Sobic007G050900 Sobic006G047700--Sobic002G244800 Sobic006G047700--Sobic003G100000 Sobic006G047700--Sobic001G254700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.