Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G125900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YIQ4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G386350 - -
2 Sobic.005G160801 - -
3 Sobic.001G001066 - -
4 Sobic.009G170900 ATCHX15, putative, expressed -
5 Sobic.001G005400 - -
6 Sobic.009G096566 - -
7 Sobic.007G136000 - -
8 Sobic.002G105501 - -
9 Sobic.007G220066 - -
10 Sobic.005G106700 roothairless 1, putative, expressed -
11 Sobic.010G046200 NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed -
12 Sobic.003G106800 3-beta-hydroxysteroid-Delta-isomerase, putative, expressed K01824: cholestenol Delta-isomerase
13 Sobic.004G349500 membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.004G252850 - -
15 Sobic.010G252550 - -
16 Sobic.001G250800 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
17 Sobic.002G223050 - -
18 Sobic.001G137050 - -
19 Sobic.004G327900 expressed protein -
20 Sobic.004G351932 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G125900 Sobic010G125900 Sobic003G386350 Sobic003G386350 Sobic010G125900--Sobic003G386350 Sobic005G160801 Sobic005G160801 Sobic010G125900--Sobic005G160801 Sobic001G001066 Sobic001G001066 Sobic010G125900--Sobic001G001066 Sobic009G170900 Sobic009G170900 Sobic010G125900--Sobic009G170900 Sobic001G005400 Sobic001G005400 Sobic010G125900--Sobic001G005400 Sobic009G096566 Sobic009G096566 Sobic010G125900--Sobic009G096566 Sobic007G136000 Sobic007G136000 Sobic010G125900--Sobic007G136000 Sobic002G105501 Sobic002G105501 Sobic010G125900--Sobic002G105501 Sobic007G220066 Sobic007G220066 Sobic010G125900--Sobic007G220066 Sobic003G386350--Sobic001G001066 Sobic003G386350--Sobic007G220066 Sobic003G386350--Sobic002G105501 Sobic010G046200 Sobic010G046200 Sobic003G386350--Sobic010G046200 Sobic003G331550 Sobic003G331550 Sobic003G386350--Sobic003G331550 Sobic009G066000 Sobic009G066000 Sobic003G386350--Sobic009G066000 Sobic007G139950 Sobic007G139950 Sobic003G386350--Sobic007G139950 Sobic009G244450 Sobic009G244450 Sobic003G386350--Sobic009G244450 Sobic003G386350--Sobic009G096566 Sobic005G160801--Sobic009G170900 Sobic005G160801--Sobic007G136000 Sobic004G200100 Sobic004G200100 Sobic005G160801--Sobic004G200100 Sobic002G381800 Sobic002G381800 Sobic005G160801--Sobic002G381800 Sobic004G252850 Sobic004G252850 Sobic005G160801--Sobic004G252850 Sobic010G082300 Sobic010G082300 Sobic005G160801--Sobic010G082300 Sobic005G160801--Sobic001G005400 Sobic005G067200 Sobic005G067200 Sobic005G160801--Sobic005G067200 Sobic003G394000 Sobic003G394000 Sobic005G160801--Sobic003G394000 Sobic003G242300 Sobic003G242300 Sobic001G001066--Sobic003G242300 Sobic001G001066--Sobic009G244450 Sobic001G001066--Sobic003G386350 Sobic001G137050 Sobic001G137050 Sobic001G001066--Sobic001G137050 Sobic003G440100 Sobic003G440100 Sobic001G001066--Sobic003G440100 Sobic005G137800 Sobic005G137800 Sobic001G001066--Sobic005G137800 Sobic002G223050 Sobic002G223050 Sobic001G001066--Sobic002G223050 Sobic001G250800 Sobic001G250800 Sobic001G001066--Sobic001G250800 Sobic003G318350 Sobic003G318350 Sobic001G001066--Sobic003G318350 Sobic009G170900--Sobic005G160801 Sobic009G170900--Sobic007G136000 Sobic009G170900--Sobic004G252850 Sobic009G170900--Sobic004G200100 Sobic001G251000 Sobic001G251000 Sobic009G170900--Sobic001G251000 Sobic003G406060 Sobic003G406060 Sobic009G170900--Sobic003G406060 Sobic009G170900--Sobic010G082300 Sobic005G200100 Sobic005G200100 Sobic009G170900--Sobic005G200100 Sobic009G170900--Sobic002G381800 Sobic004G349500 Sobic004G349500 Sobic001G005400--Sobic004G349500 Sobic001G005400--Sobic009G096566 Sobic004G351932 Sobic004G351932 Sobic001G005400--Sobic004G351932 Sobic001G005400--Sobic004G252850 Sobic001G522800 Sobic001G522800 Sobic001G005400--Sobic001G522800 Sobic004G051500 Sobic004G051500 Sobic001G005400--Sobic004G051500 Sobic001G005400--Sobic002G381800 Sobic001G005400--Sobic010G082300 Sobic003G307500 Sobic003G307500 Sobic001G005400--Sobic003G307500 Sobic009G096566--Sobic004G349500 Sobic009G096566--Sobic001G005400 Sobic009G096566--Sobic004G351932 Sobic009G096566--Sobic002G105501 Sobic009G096566--Sobic007G220066 Sobic009G096566--Sobic004G051500 Sobic009G096566--Sobic001G522800 Sobic009G096566--Sobic004G252850 Sobic005G151000 Sobic005G151000 Sobic009G096566--Sobic005G151000 Sobic007G136000--Sobic009G170900 Sobic007G136000--Sobic005G160801 Sobic007G136000--Sobic004G200100 Sobic007G136000--Sobic005G067200 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic007G136000--Sobic003G078000 Sobic006G189600 Sobic006G189600 Sobic007G136000--Sobic006G189600 Sobic007G136000--Sobic003G406060 Sobic005G198600 Sobic005G198600 Sobic007G136000--Sobic005G198600 Sobic007G136000--Sobic003G394000 Sobic002G105501--Sobic007G220066 Sobic002G105501--Sobic009G066000 Sobic002G105501--Sobic007G139950 Sobic002G105501--Sobic009G096566 Sobic006G115400 Sobic006G115400 Sobic002G105501--Sobic006G115400 Sobic002G105501--Sobic003G386350 Sobic002G105501--Sobic004G349500 Sobic002G105501--Sobic003G331550 Sobic002G105501--Sobic010G046200 Sobic007G220066--Sobic002G105501 Sobic007G220066--Sobic009G066000 Sobic007G220066--Sobic007G139950 Sobic007G220066--Sobic009G096566 Sobic007G220066--Sobic006G115400 Sobic007G220066--Sobic003G386350 Sobic007G220066--Sobic004G349500 Sobic007G220066--Sobic003G331550 Sobic007G220066--Sobic010G046200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.