Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G128900.2
Synonym BGAL8, Sb10g011733
Functional annotation beta-galactosidase precursor, putative, expressed
UniProt A0A1W0VSQ4
Pfam PF02140
Panther DB PTHR23421 PTHR23421:SF58
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005975; carbohydrate metabolic process GO:0004553hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G28470 : beta-galactosidase 8
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g15020.1 : beta-galactosidase precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001634
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G098098 - -
2 Sobic.007G016000 - -
3 Sobic.002G363700 expressed protein -
4 Sobic.004G180600 expressed protein K18172: COX assembly mitochondrial protein 2
5 Sobic.002G256500 expressed protein -
6 Sobic.006G273500 expressed protein -
7 Sobic.005G076650 - -
8 Sobic.008G119200 - -
9 Sobic.001G000900 expressed protein -
10 Sobic.004G043200 expressed protein -
11 Sobic.008G032300 dual specificity protein phosphatase, putative, expressed -
12 Sobic.004G109500 - -
13 Sobic.009G088401 - -
14 Sobic.007G208500 expressed protein -
15 Sobic.006G278900 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@auxin response factor, putative, expressed -
16 Sobic.009G203400 IQ calmodulin-binding motif family protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G487000 expressed protein -
18 Sobic.001G541601 - -
19 Sobic.007G072400 phosphoribosyl transferase, putative, expressed -
20 Sobic.004G107400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G128900 Sobic010G128900 Sobic008G098098 Sobic008G098098 Sobic010G128900--Sobic008G098098 Sobic007G016000 Sobic007G016000 Sobic010G128900--Sobic007G016000 Sobic002G363700 Sobic002G363700 Sobic010G128900--Sobic002G363700 Sobic004G180600 Sobic004G180600 Sobic010G128900--Sobic004G180600 Sobic002G256500 Sobic002G256500 Sobic010G128900--Sobic002G256500 Sobic006G273500 Sobic006G273500 Sobic010G128900--Sobic006G273500 Sobic005G076650 Sobic005G076650 Sobic010G128900--Sobic005G076650 Sobic008G119200 Sobic008G119200 Sobic010G128900--Sobic008G119200 Sobic001G000900 Sobic001G000900 Sobic010G128900--Sobic001G000900 Sobic008G098098--Sobic008G119200 Sobic008G098098--Sobic001G000900 Sobic008G098098--Sobic006G273500 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic008G098098--Sobic009G223700 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic008G098098--Sobic005G231800 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic008G098098--Sobic004G226300 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic008G098098--Sobic007G183000 Sobic009G088401 Sobic009G088401 Sobic008G098098--Sobic009G088401 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic008G098098--Sobic001G527400 Sobic007G016000--Sobic008G098098 Sobic007G016000--Sobic009G088401 Sobic007G016000--Sobic008G119200 Sobic007G016000--Sobic004G180600 Sobic007G072400 Sobic007G072400 Sobic007G016000--Sobic007G072400 Sobic010G152700 Sobic010G152700 Sobic007G016000--Sobic010G152700 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic007G016000--Sobic003G173032 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic007G016000--Sobic006G171000 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic007G016000--Sobic008G023000 Sobic001G487000 Sobic001G487000 Sobic002G363700--Sobic001G487000 Sobic001G541601 Sobic001G541601 Sobic002G363700--Sobic001G541601 Sobic006G278900 Sobic006G278900 Sobic002G363700--Sobic006G278900 Sobic001G072900 Sobic001G072900 Sobic002G363700--Sobic001G072900 Sobic007G208500 Sobic007G208500 Sobic002G363700--Sobic007G208500 Sobic002G363700--Sobic010G128900 Sobic002G363700--Sobic002G256500 Sobic002G363700--Sobic008G098098 Sobic002G363700--Sobic004G180600 Sobic004G180600--Sobic006G273500 Sobic004G180600--Sobic008G098098 Sobic004G180600--Sobic009G088401 Sobic004G180600--Sobic007G016000 Sobic004G180600--Sobic008G119200 Sobic004G107400 Sobic004G107400 Sobic004G180600--Sobic004G107400 Sobic003G407500 Sobic003G407500 Sobic004G180600--Sobic003G407500 Sobic004G180600--Sobic007G072400 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic004G180600--Sobic005G209800 Sobic002G256500--Sobic008G098098 Sobic002G256500--Sobic006G273500 Sobic002G256500--Sobic008G119200 Sobic004G221150 Sobic004G221150 Sobic002G256500--Sobic004G221150 Sobic002G256500--Sobic009G088401 Sobic002G256500--Sobic007G016000 Sobic002G256500--Sobic001G000900 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic002G256500--Sobic002G285525 Sobic002G256500--Sobic009G223700 Sobic006G273500--Sobic008G098098 Sobic006G273500--Sobic008G119200 Sobic006G273500--Sobic004G107400 Sobic006G273500--Sobic002G285525 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic006G273500--Sobic001G137200 Sobic010G002850 Sobic010G002850 Sobic006G273500--Sobic010G002850 Sobic006G273500--Sobic006G171000 Sobic006G273500--Sobic005G209800 Sobic006G273500--Sobic005G231800 Sobic005G076650--Sobic008G098098 Sobic005G076650--Sobic007G016000 Sobic005G076650--Sobic009G088401 Sobic004G043200 Sobic004G043200 Sobic005G076650--Sobic004G043200 Sobic005G076650--Sobic007G072400 Sobic005G076650--Sobic010G152700 Sobic005G076650--Sobic008G119200 Sobic001G516200 Sobic001G516200 Sobic005G076650--Sobic001G516200 Sobic005G076650--Sobic006G273500 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic008G119200--Sobic002G048250 Sobic008G119200--Sobic007G183000 Sobic008G119200--Sobic004G226300 Sobic008G119200--Sobic005G231800 Sobic008G119200--Sobic001G527400 Sobic008G119200--Sobic002G285525 Sobic008G119200--Sobic008G023000 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic008G119200--Sobic008G002100 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic008G119200--Sobic004G347866 Sobic001G000900--Sobic008G098098 Sobic001G000900--Sobic008G119200 Sobic010G029200 Sobic010G029200 Sobic001G000900--Sobic010G029200 Sobic003G142900 Sobic003G142900 Sobic001G000900--Sobic003G142900 Sobic010G040000 Sobic010G040000 Sobic001G000900--Sobic010G040000 Sobic009G039400 Sobic009G039400 Sobic001G000900--Sobic009G039400 Sobic010G208300 Sobic010G208300 Sobic001G000900--Sobic010G208300 Sobic002G188100 Sobic002G188100 Sobic001G000900--Sobic002G188100 Sobic006G133650 Sobic006G133650 Sobic001G000900--Sobic006G133650
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.