Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G131200.1
Synonym Sb10g012110
Functional annotation glycine rich protein family protein, putative, expressed
UniProt C5Z1M8
Pfam -
Panther DB PTHR37372
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g21210.1 : glycine rich protein family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G422000 "Glucan endo-1,3-beta-d-glucosidase"(PubMedID : 24906815)@"beta-1,3-glucanase "(PubMedID : 25311645)@glycosyl hydrolases family 17, putative, expressed -
2 Sobic.009G002500 polygalacturonase inhibitor precursor, putative, expressed -
3 Sobic.002G051450 - -
4 Sobic.010G248600 - -
5 Sobic.007G094600 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450 protein, putative, expressed -
6 Sobic.008G108900 GRF zinc finger family protein, expressed -
7 Sobic.009G109450 - -
8 Sobic.006G132200 CHIT3 - Chitinase family protein precursor, expressed K01183: chitinase
9 Sobic.004G195700 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
10 Sobic.001G498200 YT521-B-like family domain containing protein, expressed -
11 Sobic.007G115000 - -
12 Sobic.004G256600 KH domain containing protein, putative, expressed K14945: protein quaking
13 Sobic.006G196000 expressed protein -
14 Sobic.005G077400 - -
15 Sobic.008G068400 - -
16 Sobic.009G004700 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
17 Sobic.005G212600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G062300 expressed protein -
19 Sobic.009G078500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
20 Sobic.009G113600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G131200 Sobic010G131200 Sobic003G422000 Sobic003G422000 Sobic010G131200--Sobic003G422000 Sobic009G002500 Sobic009G002500 Sobic010G131200--Sobic009G002500 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic010G131200--Sobic002G051450 Sobic010G248600 Sobic010G248600 Sobic010G131200--Sobic010G248600 Sobic007G094600 Sobic007G094600 Sobic010G131200--Sobic007G094600 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic010G131200--Sobic008G108900 Sobic009G109450 Sobic009G109450 Sobic010G131200--Sobic009G109450 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic010G131200--Sobic006G132200 Sobic004G195700 Sobic004G195700 Sobic010G131200--Sobic004G195700 Sobic003G422000--Sobic008G108900 Sobic003G422000--Sobic006G132200 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic003G422000--Sobic002G062300 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic003G422000--Sobic007G059300 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic003G422000--Sobic009G113600 Sobic002G051400 Sobic002G051400 Sobic003G422000--Sobic002G051400 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic003G422000--Sobic005G212600 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic003G422000--Sobic007G115000 Sobic003G422000--Sobic007G094600 Sobic008G105500 Sobic008G105500 Sobic009G002500--Sobic008G105500 Sobic004G020401 Sobic004G020401 Sobic009G002500--Sobic004G020401 Sobic009G002500--Sobic009G109450 Sobic003G357500 Sobic003G357500 Sobic009G002500--Sobic003G357500 Sobic009G197200 Sobic009G197200 Sobic009G002500--Sobic009G197200 Sobic006G196000 Sobic006G196000 Sobic009G002500--Sobic006G196000 Sobic009G078500 Sobic009G078500 Sobic009G002500--Sobic009G078500 Sobic006G020500 Sobic006G020500 Sobic009G002500--Sobic006G020500 Sobic009G110366 Sobic009G110366 Sobic009G002500--Sobic009G110366 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic002G051450--Sobic006G009400 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic002G051450--Sobic006G262200 Sobic005G015100 Sobic005G015100 Sobic002G051450--Sobic005G015100 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic002G051450--Sobic010G263800 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic002G051450--Sobic008G034600 Sobic004G256600 Sobic004G256600 Sobic002G051450--Sobic004G256600 Sobic009G045700 Sobic009G045700 Sobic002G051450--Sobic009G045700 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic002G051450--Sobic009G004700 Sobic005G077400 Sobic005G077400 Sobic002G051450--Sobic005G077400 Sobic001G498200 Sobic001G498200 Sobic010G248600--Sobic001G498200 Sobic010G270300 Sobic010G270300 Sobic010G248600--Sobic010G270300 Sobic009G085400 Sobic009G085400 Sobic010G248600--Sobic009G085400 Sobic003G416100 Sobic003G416100 Sobic010G248600--Sobic003G416100 Sobic005G019600 Sobic005G019600 Sobic010G248600--Sobic005G019600 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic010G248600--Sobic007G129401 Sobic001G028900 Sobic001G028900 Sobic010G248600--Sobic001G028900 Sobic004G070200 Sobic004G070200 Sobic010G248600--Sobic004G070200 Sobic004G142700 Sobic004G142700 Sobic010G248600--Sobic004G142700 Sobic007G094600--Sobic006G020500 Sobic006G020600 Sobic006G020600 Sobic007G094600--Sobic006G020600 Sobic002G314600 Sobic002G314600 Sobic007G094600--Sobic002G314600 Sobic007G094600--Sobic002G051400 Sobic010G091700 Sobic010G091700 Sobic007G094600--Sobic010G091700 Sobic007G094600--Sobic009G078500 Sobic008G124100 Sobic008G124100 Sobic007G094600--Sobic008G124100 Sobic007G094600--Sobic003G422000 Sobic007G094600--Sobic008G108900 Sobic008G108900--Sobic006G132200 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic008G108900--Sobic009G196700 Sobic008G108900--Sobic002G062300 Sobic008G108900--Sobic009G113600 Sobic008G108900--Sobic007G059300 Sobic008G108900--Sobic005G212600 Sobic003G176100 Sobic003G176100 Sobic008G108900--Sobic003G176100 Sobic008G108900--Sobic002G051400 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic008G108900--Sobic003G031750 Sobic009G109450--Sobic009G078500 Sobic004G199600 Sobic004G199600 Sobic009G109450--Sobic004G199600 Sobic009G180200 Sobic009G180200 Sobic009G109450--Sobic009G180200 Sobic005G130100 Sobic005G130100 Sobic009G109450--Sobic005G130100 Sobic009G231300 Sobic009G231300 Sobic009G109450--Sobic009G231300 Sobic009G109450--Sobic006G196000 Sobic005G121800 Sobic005G121800 Sobic009G109450--Sobic005G121800 Sobic002G376900 Sobic002G376900 Sobic009G109450--Sobic002G376900 Sobic009G109450--Sobic009G110366 Sobic006G132200--Sobic008G108900 Sobic006G132200--Sobic009G196700 Sobic006G132200--Sobic002G062300 Sobic006G132200--Sobic009G113600 Sobic006G132200--Sobic005G212600 Sobic006G132200--Sobic007G059300 Sobic006G132200--Sobic003G031750 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic006G132200--Sobic008G091900 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic006G132200--Sobic008G031350 Sobic005G054300 Sobic005G054300 Sobic004G195700--Sobic005G054300 Sobic004G195700--Sobic005G212600 Sobic005G054600 Sobic005G054600 Sobic004G195700--Sobic005G054600 Sobic004G195700--Sobic008G108900 Sobic004G164650 Sobic004G164650 Sobic004G195700--Sobic004G164650 Sobic004G195700--Sobic002G062300 Sobic005G012000 Sobic005G012000 Sobic004G195700--Sobic005G012000 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic004G195700--Sobic001G271000 Sobic004G195700--Sobic007G115000
Octagon: transcription factors


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