Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G148100.1
Synonym AGL62, Sb10g019770
Functional annotation OsMADS75 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed
UniProt C5Z3G8
Pfam PF00319
Panther DB PTHR11945 PTHR11945:SF203
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G60440 : AGAMOUS-like 62
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g30810.1 : OsMADS75 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a050847
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic010G148100 Sobic010G148100 Sobic004G145550 Sobic004G145550 Sobic010G148100--Sobic004G145550 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic010G148100--Sobic006G206600 Sobic001G444200 Sobic001G444200 Sobic010G148100--Sobic001G444200 Sobic001G201933 Sobic001G201933 Sobic010G148100--Sobic001G201933 Sobic007G107800 Sobic007G107800 Sobic010G148100--Sobic007G107800 Sobic006G263250 Sobic006G263250 Sobic010G148100--Sobic006G263250 Sobic001G520600 Sobic001G520600 Sobic010G148100--Sobic001G520600 Sobic007G113566 Sobic007G113566 Sobic010G148100--Sobic007G113566 Sobic006G135701 Sobic006G135701 Sobic010G148100--Sobic006G135701 Sobic006G244200 Sobic006G244200 Sobic004G145550--Sobic006G244200 Sobic004G145550--Sobic001G520600 Sobic010G093200 Sobic010G093200 Sobic004G145550--Sobic010G093200 Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic004G145550--Sobic003G384750 Sobic002G375200 Sobic002G375200 Sobic004G145550--Sobic002G375200 Sobic008G014400 Sobic008G014400 Sobic004G145550--Sobic008G014400 Sobic001G123400 Sobic001G123400 Sobic004G145550--Sobic001G123400 Sobic009G143600 Sobic009G143600 Sobic004G145550--Sobic009G143600 Sobic004G334601 Sobic004G334601 Sobic004G145550--Sobic004G334601 Sobic007G028300 Sobic007G028300 Sobic006G206600--Sobic007G028300 Sobic006G100150 Sobic006G100150 Sobic006G206600--Sobic006G100150 Sobic004G078200 Sobic004G078200 Sobic006G206600--Sobic004G078200 Sobic004G303900 Sobic004G303900 Sobic006G206600--Sobic004G303900 Sobic009G218700 Sobic009G218700 Sobic006G206600--Sobic009G218700 Sobic006G206600--Sobic006G135701 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic006G206600--Sobic001G118050 Sobic002G088300 Sobic002G088300 Sobic006G206600--Sobic002G088300 Sobic006G206600--Sobic007G113566 Sobic007G160050 Sobic007G160050 Sobic001G444200--Sobic007G160050 Sobic001G444200--Sobic003G384750 Sobic004G208800 Sobic004G208800 Sobic001G444200--Sobic004G208800 Sobic001G159500 Sobic001G159500 Sobic001G444200--Sobic001G159500 Sobic001G444200--Sobic001G201933 Sobic003G047400 Sobic003G047400 Sobic001G444200--Sobic003G047400 Sobic001G444200--Sobic004G145550 Sobic001G395600 Sobic001G395600 Sobic001G444200--Sobic001G395600 Sobic003G139600 Sobic003G139600 Sobic001G444200--Sobic003G139600 Sobic010G002301 Sobic010G002301 Sobic001G201933--Sobic010G002301 Sobic001G201933--Sobic003G139600 Sobic002G191900 Sobic002G191900 Sobic001G201933--Sobic002G191900 Sobic001G201933--Sobic007G113566 Sobic001G465600 Sobic001G465600 Sobic001G201933--Sobic001G465600 Sobic004G162100 Sobic004G162100 Sobic001G201933--Sobic004G162100 Sobic001G201933--Sobic004G078200 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic001G201933--Sobic006G219400 Sobic004G157050 Sobic004G157050 Sobic001G201933--Sobic004G157050 Sobic007G107800--Sobic004G157050 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic007G107800--Sobic004G207800 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic007G107800--Sobic009G192200 Sobic007G107800--Sobic007G113566 Sobic003G290200 Sobic003G290200 Sobic007G107800--Sobic003G290200 Sobic007G107800--Sobic010G002301 Sobic001G332933 Sobic001G332933 Sobic007G107800--Sobic001G332933 Sobic008G171200 Sobic008G171200 Sobic007G107800--Sobic008G171200 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic007G107800--Sobic007G085900 Sobic001G136850 Sobic001G136850 Sobic006G263250--Sobic001G136850 Sobic006G146700 Sobic006G146700 Sobic006G263250--Sobic006G146700 Sobic006G059150 Sobic006G059150 Sobic006G263250--Sobic006G059150 Sobic006G263250--Sobic001G118050 Sobic006G263250--Sobic006G100150 Sobic001G039750 Sobic001G039750 Sobic006G263250--Sobic001G039750 Sobic001G470700 Sobic001G470700 Sobic006G263250--Sobic001G470700 Sobic004G252600 Sobic004G252600 Sobic006G263250--Sobic004G252600 Sobic009G260550 Sobic009G260550 Sobic006G263250--Sobic009G260550 Sobic001G520600--Sobic004G145550 Sobic001G520600--Sobic010G093200 Sobic001G520600--Sobic001G123400 Sobic001G520600--Sobic006G244200 Sobic006G143800 Sobic006G143800 Sobic001G520600--Sobic006G143800 Sobic007G009900 Sobic007G009900 Sobic001G520600--Sobic007G009900 Sobic001G520600--Sobic003G384750 Sobic008G057200 Sobic008G057200 Sobic001G520600--Sobic008G057200 Sobic010G103400 Sobic010G103400 Sobic001G520600--Sobic010G103400 Sobic007G113566--Sobic001G118050 Sobic007G113566--Sobic008G171200 Sobic007G113566--Sobic006G135701 Sobic007G113566--Sobic004G157050 Sobic007G113566--Sobic010G002301 Sobic007G113566--Sobic004G207800 Sobic001G476800 Sobic001G476800 Sobic007G113566--Sobic001G476800 Sobic007G113566--Sobic003G139600 Sobic007G113566--Sobic001G465600 Sobic006G135701--Sobic001G118050 Sobic006G135701--Sobic007G113566 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic006G135701--Sobic002G220400 Sobic004G019550 Sobic004G019550 Sobic006G135701--Sobic004G019550 Sobic006G135701--Sobic001G476800 Sobic001G154000 Sobic001G154000 Sobic006G135701--Sobic001G154000 Sobic006G135701--Sobic004G252600 Sobic010G175550 Sobic010G175550 Sobic006G135701--Sobic010G175550 Sobic006G135701--Sobic008G171200
Octagon: transcription factors


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