Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G244150.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VUJ3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G350850 - -
2 Sobic.007G223801 - -
3 Sobic.003G023901 - -
4 Sobic.005G175700 ThiF family domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G248900 exocyst complex component 6, putative, expressed -
6 Sobic.010G157600 expressed protein -
7 Sobic.001G120750 - -
8 Sobic.002G109900 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
9 Sobic.006G150500 - -
10 Sobic.002G286500 carrier, putative, expressed -
11 Sobic.006G171801 - -
12 Sobic.004G194950 - -
13 Sobic.004G039800 cyclin-related protein, putative, expressed -
14 Sobic.003G271000 - -
15 Sobic.002G232100 purine permease, putative, expressed -
16 Sobic.010G028366 - -
17 Sobic.001G258700 - -
18 Sobic.001G072550 - -
19 Sobic.007G206900 - -
20 Sobic.001G315300 chloroplast 30S ribosomal protein S2, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G244150 Sobic010G244150 Sobic003G350850 Sobic003G350850 Sobic010G244150--Sobic003G350850 Sobic007G223801 Sobic007G223801 Sobic010G244150--Sobic007G223801 Sobic003G023901 Sobic003G023901 Sobic010G244150--Sobic003G023901 Sobic005G175700 Sobic005G175700 Sobic010G244150--Sobic005G175700 Sobic001G248900 Sobic001G248900 Sobic010G244150--Sobic001G248900 Sobic010G157600 Sobic010G157600 Sobic010G244150--Sobic010G157600 Sobic001G120750 Sobic001G120750 Sobic010G244150--Sobic001G120750 Sobic002G109900 Sobic002G109900 Sobic010G244150--Sobic002G109900 Sobic006G150500 Sobic006G150500 Sobic010G244150--Sobic006G150500 Sobic003G350850--Sobic007G223801 Sobic002G232100 Sobic002G232100 Sobic003G350850--Sobic002G232100 Sobic004G194950 Sobic004G194950 Sobic003G350850--Sobic004G194950 Sobic003G350850--Sobic010G157600 Sobic003G350850--Sobic003G023901 Sobic006G171801 Sobic006G171801 Sobic003G350850--Sobic006G171801 Sobic002G143600 Sobic002G143600 Sobic003G350850--Sobic002G143600 Sobic010G028366 Sobic010G028366 Sobic003G350850--Sobic010G028366 Sobic002G286500 Sobic002G286500 Sobic003G350850--Sobic002G286500 Sobic007G223801--Sobic003G023901 Sobic007G223801--Sobic003G350850 Sobic007G223801--Sobic010G157600 Sobic007G223801--Sobic002G109900 Sobic007G223801--Sobic002G286500 Sobic007G223801--Sobic006G171801 Sobic007G223801--Sobic004G194950 Sobic007G223801--Sobic002G232100 Sobic007G223801--Sobic001G248900 Sobic003G023901--Sobic007G223801 Sobic003G023901--Sobic002G109900 Sobic003G023901--Sobic002G286500 Sobic001G526050 Sobic001G526050 Sobic003G023901--Sobic001G526050 Sobic003G023901--Sobic003G350850 Sobic001G315300 Sobic001G315300 Sobic003G023901--Sobic001G315300 Sobic003G023901--Sobic001G248900 Sobic003G023901--Sobic010G157600 Sobic003G023901--Sobic006G171801 Sobic004G304900 Sobic004G304900 Sobic005G175700--Sobic004G304900 Sobic010G265100 Sobic010G265100 Sobic005G175700--Sobic010G265100 Sobic003G271000 Sobic003G271000 Sobic005G175700--Sobic003G271000 Sobic008G183900 Sobic008G183900 Sobic005G175700--Sobic008G183900 Sobic004G337975 Sobic004G337975 Sobic005G175700--Sobic004G337975 Sobic005G175700--Sobic010G244150 Sobic005G203500 Sobic005G203500 Sobic005G175700--Sobic005G203500 Sobic008G172400 Sobic008G172400 Sobic005G175700--Sobic008G172400 Sobic006G233400 Sobic006G233400 Sobic005G175700--Sobic006G233400 Sobic001G248900--Sobic002G286500 Sobic001G248900--Sobic002G109900 Sobic001G248900--Sobic003G023901 Sobic001G074900 Sobic001G074900 Sobic001G248900--Sobic001G074900 Sobic006G035200 Sobic006G035200 Sobic001G248900--Sobic006G035200 Sobic001G248900--Sobic001G315300 Sobic001G248900--Sobic007G223801 Sobic002G157050 Sobic002G157050 Sobic001G248900--Sobic002G157050 Sobic001G248900--Sobic001G526050 Sobic010G157600--Sobic006G171801 Sobic010G157600--Sobic004G194950 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic010G157600--Sobic009G184450 Sobic010G157600--Sobic002G232100 Sobic010G157600--Sobic010G028366 Sobic010G157600--Sobic007G223801 Sobic010G157600--Sobic002G109900 Sobic010G157600--Sobic003G350850 Sobic002G136500 Sobic002G136500 Sobic010G157600--Sobic002G136500 Sobic001G055300 Sobic001G055300 Sobic001G120750--Sobic001G055300 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic001G120750--Sobic002G185000 Sobic010G133800 Sobic010G133800 Sobic001G120750--Sobic010G133800 Sobic006G107332 Sobic006G107332 Sobic001G120750--Sobic006G107332 Sobic001G258700 Sobic001G258700 Sobic001G120750--Sobic001G258700 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic001G120750--Sobic003G076300 Sobic001G461101 Sobic001G461101 Sobic001G120750--Sobic001G461101 Sobic005G226700 Sobic005G226700 Sobic001G120750--Sobic005G226700 Sobic001G120750--Sobic009G184450 Sobic002G109900--Sobic001G315300 Sobic002G109900--Sobic003G023901 Sobic002G109900--Sobic002G286500 Sobic002G109900--Sobic007G223801 Sobic002G109900--Sobic010G157600 Sobic002G109900--Sobic001G074900 Sobic004G039800 Sobic004G039800 Sobic002G109900--Sobic004G039800 Sobic001G184950 Sobic001G184950 Sobic002G109900--Sobic001G184950 Sobic009G258000 Sobic009G258000 Sobic002G109900--Sobic009G258000 Sobic003G335000 Sobic003G335000 Sobic006G150500--Sobic003G335000 Sobic003G016950 Sobic003G016950 Sobic006G150500--Sobic003G016950 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic006G150500--Sobic009G186300 Sobic006G048400 Sobic006G048400 Sobic006G150500--Sobic006G048400 Sobic006G150500--Sobic006G233400 Sobic002G324801 Sobic002G324801 Sobic006G150500--Sobic002G324801 Sobic003G334400 Sobic003G334400 Sobic006G150500--Sobic003G334400 Sobic002G181066 Sobic002G181066 Sobic006G150500--Sobic002G181066 Sobic007G052000 Sobic007G052000 Sobic006G150500--Sobic007G052000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.