Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G089200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QI07
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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cDNA sequences
Sobic.001G089200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G244701 - -
2 Sobic.001G434450 - K13101: G patch domain and KOW motifs-containing protein
3 Sobic.006G256801 - -
4 Sobic.004G152501 - -
5 Sobic.006G094400 - -
6 Sobic.008G164525 - -
7 Sobic.001G120100 DUF1295 domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.007G013100 OsFBX142 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G082151 - -
10 Sobic.004G314750 - -
11 Sobic.004G251350 - -
12 Sobic.003G038300 - -
13 Sobic.001G016900 RNA-binding protein Luc7-like, putative, expressed -
14 Sobic.003G379500 gibberellin 20 oxidase 2, putative, expressed -
15 Sobic.009G085600 acetyltransferase, GNAT family, putative, expressed -
16 Sobic.007G116600 5-AMP-activated protein kinase beta-1 subunit-related, putative, expressed -
17 Sobic.006G180500 - -
18 Sobic.004G016600 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
19 Sobic.003G167825 - -
20 Sobic.009G250800 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@polygalacturonase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G089200 Sobic001G089200 Sobic010G244701 Sobic010G244701 Sobic001G089200--Sobic010G244701 Sobic001G434450 Sobic001G434450 Sobic001G089200--Sobic001G434450 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic001G089200--Sobic006G256801 Sobic004G152501 Sobic004G152501 Sobic001G089200--Sobic004G152501 Sobic006G094400 Sobic006G094400 Sobic001G089200--Sobic006G094400 Sobic008G164525 Sobic008G164525 Sobic001G089200--Sobic008G164525 Sobic001G120100 Sobic001G120100 Sobic001G089200--Sobic001G120100 Sobic007G013100 Sobic007G013100 Sobic001G089200--Sobic007G013100 Sobic004G082151 Sobic004G082151 Sobic001G089200--Sobic004G082151 Sobic010G244701--Sobic006G256801 Sobic003G379500 Sobic003G379500 Sobic010G244701--Sobic003G379500 Sobic004G314750 Sobic004G314750 Sobic010G244701--Sobic004G314750 Sobic010G244701--Sobic001G434450 Sobic010G244701--Sobic008G164525 Sobic010G244701--Sobic001G089200 Sobic001G115900 Sobic001G115900 Sobic010G244701--Sobic001G115900 Sobic009G258150 Sobic009G258150 Sobic010G244701--Sobic009G258150 Sobic009G085600 Sobic009G085600 Sobic010G244701--Sobic009G085600 Sobic001G434450--Sobic008G164525 Sobic001G434450--Sobic004G314750 Sobic001G434450--Sobic006G256801 Sobic001G434450--Sobic006G094400 Sobic003G008850 Sobic003G008850 Sobic001G434450--Sobic003G008850 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic001G434450--Sobic009G094000 Sobic001G434450--Sobic010G244701 Sobic001G434450--Sobic001G120100 Sobic006G222800 Sobic006G222800 Sobic001G434450--Sobic006G222800 Sobic006G256801--Sobic003G008850 Sobic006G256801--Sobic008G164525 Sobic006G256801--Sobic006G094400 Sobic006G256801--Sobic001G434450 Sobic006G180500 Sobic006G180500 Sobic006G256801--Sobic006G180500 Sobic006G256801--Sobic001G120100 Sobic006G256801--Sobic006G222800 Sobic006G256801--Sobic010G244701 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic006G256801--Sobic002G165401 Sobic006G069050 Sobic006G069050 Sobic004G152501--Sobic006G069050 Sobic003G038300 Sobic003G038300 Sobic004G152501--Sobic003G038300 Sobic003G126400 Sobic003G126400 Sobic004G152501--Sobic003G126400 Sobic010G201000 Sobic010G201000 Sobic004G152501--Sobic010G201000 Sobic010G074980 Sobic010G074980 Sobic004G152501--Sobic010G074980 Sobic004G152501--Sobic001G115900 Sobic004G152501--Sobic004G082151 Sobic003G427500 Sobic003G427500 Sobic004G152501--Sobic003G427500 Sobic004G152501--Sobic009G258150 Sobic006G094400--Sobic006G256801 Sobic006G094400--Sobic001G434450 Sobic006G094400--Sobic008G164525 Sobic006G094400--Sobic004G314750 Sobic006G094400--Sobic006G180500 Sobic004G001900 Sobic004G001900 Sobic006G094400--Sobic004G001900 Sobic006G094400--Sobic009G094000 Sobic006G094400--Sobic002G165401 Sobic006G094400--Sobic003G008850 Sobic008G164525--Sobic001G434450 Sobic008G164525--Sobic006G256801 Sobic008G164525--Sobic004G314750 Sobic008G164525--Sobic003G008850 Sobic008G164525--Sobic006G094400 Sobic008G164525--Sobic006G222800 Sobic008G119000 Sobic008G119000 Sobic008G164525--Sobic008G119000 Sobic004G016600 Sobic004G016600 Sobic008G164525--Sobic004G016600 Sobic008G164525--Sobic003G038300 Sobic001G537900 Sobic001G537900 Sobic001G120100--Sobic001G537900 Sobic001G120100--Sobic004G016600 Sobic007G111600 Sobic007G111600 Sobic001G120100--Sobic007G111600 Sobic004G251350 Sobic004G251350 Sobic001G120100--Sobic004G251350 Sobic001G016900 Sobic001G016900 Sobic001G120100--Sobic001G016900 Sobic001G120100--Sobic003G008850 Sobic010G179150 Sobic010G179150 Sobic001G120100--Sobic010G179150 Sobic009G152901 Sobic009G152901 Sobic001G120100--Sobic009G152901 Sobic007G204500 Sobic007G204500 Sobic001G120100--Sobic007G204500 Sobic007G116600 Sobic007G116600 Sobic007G013100--Sobic007G116600 Sobic007G013100--Sobic010G179150 Sobic007G013100--Sobic007G111600 Sobic003G099500 Sobic003G099500 Sobic007G013100--Sobic003G099500 Sobic007G013100--Sobic004G251350 Sobic007G013100--Sobic001G016900 Sobic008G131800 Sobic008G131800 Sobic007G013100--Sobic008G131800 Sobic003G368150 Sobic003G368150 Sobic007G013100--Sobic003G368150 Sobic007G013100--Sobic004G016600 Sobic004G082151--Sobic010G074980 Sobic004G082151--Sobic003G427500 Sobic004G082151--Sobic010G201000 Sobic007G093400 Sobic007G093400 Sobic004G082151--Sobic007G093400 Sobic006G065700 Sobic006G065700 Sobic004G082151--Sobic006G065700 Sobic001G525000 Sobic001G525000 Sobic004G082151--Sobic001G525000 Sobic003G120400 Sobic003G120400 Sobic004G082151--Sobic003G120400 Sobic002G210200 Sobic002G210200 Sobic004G082151--Sobic002G210200 Sobic002G320900 Sobic002G320900 Sobic004G082151--Sobic002G320900
Octagon: transcription factors


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