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Transcriptome id Sobic.001G139500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QIX7
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NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G065400 expressed protein -
2 Sobic.001G453150 - -
3 Sobic.004G107500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@potassium channel KAT1, putative, expressed -
4 Sobic.002G285101 - -
5 Sobic.001G439850 - -
6 Sobic.002G227400 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
7 Sobic.001G495550 - -
8 Sobic.010G090800 no apical meristem protein, expressed -
9 Sobic.010G002201 - -
10 Sobic.002G088500 expressed protein -
11 Sobic.007G129500 expressed protein -
12 Sobic.003G016700 OsFBX380 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.009G253500 OsFBX259 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.005G106900 expressed protein K17757: ATP-dependent NAD(P)H-hydrate dehydratase
15 Sobic.001G057500 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@basic proline-rich protein precursor, putative, expressed -
16 Sobic.008G046100 - -
17 Sobic.007G171300 - -
18 Sobic.008G091500 flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase, putative, expressed -
19 Sobic.004G048201 - -
20 Sobic.002G319700 BCS1 protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G139500 Sobic001G139500 Sobic005G065400 Sobic005G065400 Sobic001G139500--Sobic005G065400 Sobic001G453150 Sobic001G453150 Sobic001G139500--Sobic001G453150 Sobic004G107500 Sobic004G107500 Sobic001G139500--Sobic004G107500 Sobic002G285101 Sobic002G285101 Sobic001G139500--Sobic002G285101 Sobic001G439850 Sobic001G439850 Sobic001G139500--Sobic001G439850 Sobic002G227400 Sobic002G227400 Sobic001G139500--Sobic002G227400 Sobic001G495550 Sobic001G495550 Sobic001G139500--Sobic001G495550 Sobic010G090800 Sobic010G090800 Sobic001G139500--Sobic010G090800 Sobic010G002201 Sobic010G002201 Sobic001G139500--Sobic010G002201 Sobic005G065400--Sobic001G439850 Sobic005G065400--Sobic001G453150 Sobic002G088500 Sobic002G088500 Sobic005G065400--Sobic002G088500 Sobic005G065400--Sobic002G227400 Sobic005G065400--Sobic002G285101 Sobic008G091500 Sobic008G091500 Sobic005G065400--Sobic008G091500 Sobic007G129500 Sobic007G129500 Sobic005G065400--Sobic007G129500 Sobic007G171300 Sobic007G171300 Sobic005G065400--Sobic007G171300 Sobic001G195866 Sobic001G195866 Sobic005G065400--Sobic001G195866 Sobic001G453150--Sobic005G065400 Sobic001G453150--Sobic002G285101 Sobic001G453150--Sobic010G002201 Sobic001G453150--Sobic001G439850 Sobic001G453150--Sobic002G227400 Sobic001G453150--Sobic007G171300 Sobic004G048201 Sobic004G048201 Sobic001G453150--Sobic004G048201 Sobic008G087000 Sobic008G087000 Sobic001G453150--Sobic008G087000 Sobic001G453150--Sobic002G088500 Sobic001G184300 Sobic001G184300 Sobic004G107500--Sobic001G184300 Sobic006G128500 Sobic006G128500 Sobic004G107500--Sobic006G128500 Sobic010G019200 Sobic010G019200 Sobic004G107500--Sobic010G019200 Sobic004G227600 Sobic004G227600 Sobic004G107500--Sobic004G227600 Sobic006G177400 Sobic006G177400 Sobic004G107500--Sobic006G177400 Sobic003G016700 Sobic003G016700 Sobic004G107500--Sobic003G016700 Sobic005G057700 Sobic005G057700 Sobic004G107500--Sobic005G057700 Sobic006G074500 Sobic006G074500 Sobic004G107500--Sobic006G074500 Sobic003G133700 Sobic003G133700 Sobic004G107500--Sobic003G133700 Sobic002G285101--Sobic001G453150 Sobic002G285101--Sobic010G002201 Sobic002G285101--Sobic005G065400 Sobic002G285101--Sobic004G048201 Sobic002G285101--Sobic001G439850 Sobic002G285101--Sobic008G087000 Sobic009G174833 Sobic009G174833 Sobic002G285101--Sobic009G174833 Sobic008G139200 Sobic008G139200 Sobic002G285101--Sobic008G139200 Sobic003G385201 Sobic003G385201 Sobic002G285101--Sobic003G385201 Sobic001G439850--Sobic005G065400 Sobic001G439850--Sobic001G453150 Sobic001G439850--Sobic002G088500 Sobic001G439850--Sobic002G227400 Sobic001G439850--Sobic002G285101 Sobic001G439850--Sobic008G091500 Sobic001G439850--Sobic007G129500 Sobic001G439850--Sobic007G171300 Sobic010G135700 Sobic010G135700 Sobic001G439850--Sobic010G135700 Sobic002G227400--Sobic007G171300 Sobic002G227400--Sobic005G065400 Sobic002G227400--Sobic001G453150 Sobic002G227400--Sobic001G439850 Sobic001G135000 Sobic001G135000 Sobic002G227400--Sobic001G135000 Sobic002G227400--Sobic008G091500 Sobic001G529301 Sobic001G529301 Sobic002G227400--Sobic001G529301 Sobic006G031866 Sobic006G031866 Sobic002G227400--Sobic006G031866 Sobic010G213100 Sobic010G213100 Sobic002G227400--Sobic010G213100 Sobic002G028901 Sobic002G028901 Sobic001G495550--Sobic002G028901 Sobic003G333300 Sobic003G333300 Sobic001G495550--Sobic003G333300 Sobic001G499800 Sobic001G499800 Sobic001G495550--Sobic001G499800 Sobic009G064700 Sobic009G064700 Sobic001G495550--Sobic009G064700 Sobic010G184400 Sobic010G184400 Sobic001G495550--Sobic010G184400 Sobic003G344950 Sobic003G344950 Sobic001G495550--Sobic003G344950 Sobic005G035400 Sobic005G035400 Sobic001G495550--Sobic005G035400 Sobic008G112550 Sobic008G112550 Sobic001G495550--Sobic008G112550 Sobic003G098650 Sobic003G098650 Sobic001G495550--Sobic003G098650 Sobic006G278950 Sobic006G278950 Sobic010G090800--Sobic006G278950 Sobic003G242600 Sobic003G242600 Sobic010G090800--Sobic003G242600 Sobic003G005400 Sobic003G005400 Sobic010G090800--Sobic003G005400 Sobic006G084100 Sobic006G084100 Sobic010G090800--Sobic006G084100 Sobic001G211000 Sobic001G211000 Sobic010G090800--Sobic001G211000 Sobic003G429101 Sobic003G429101 Sobic010G090800--Sobic003G429101 Sobic009G150800 Sobic009G150800 Sobic010G090800--Sobic009G150800 Sobic001G388100 Sobic001G388100 Sobic010G090800--Sobic001G388100 Sobic003G046900 Sobic003G046900 Sobic010G090800--Sobic003G046900 Sobic010G002201--Sobic001G453150 Sobic010G002201--Sobic002G285101 Sobic010G002201--Sobic008G087000 Sobic010G002201--Sobic004G048201 Sobic010G002201--Sobic005G065400 Sobic010G002201--Sobic002G088500 Sobic010G002201--Sobic009G174833 Sobic010G002201--Sobic001G439850 Sobic010G002201--Sobic003G385201
Octagon: transcription factors


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