Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G198300.1
Synonym
Functional annotation GRF zinc finger family protein, expressed
UniProt A0A1B6QJV3
Pfam PF06839
Panther DB PTHR33248 PTHR33248:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g31360.1 : GRF zinc finger family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G001500 signal recognition particle receptor subunit beta, putative, expressed K12272: SRPRB, signal recognition particle receptor subunit beta
2 Sobic.001G523050 - -
3 Sobic.006G108766 - -
4 Sobic.002G365300 NBS-LRR type disease resistance protein, putative, expressed -
5 Sobic.003G193900 - -
6 Sobic.003G059500 verticillium wilt disease resistance protein, putative, expressed -
7 Sobic.006G238900 - -
8 Sobic.008G001600 - -
9 Sobic.001G181400 - -
10 Sobic.008G026500 - -
11 Sobic.001G421450 - -
12 Sobic.003G231400 lignin modification(PubMedID : 28529519)@laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
13 Sobic.005G110529 - -
14 Sobic.004G167600 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G261428 - -
16 Sobic.001G079000 - -
17 Sobic.008G093101 - -
18 Sobic.001G290900 - -
19 Sobic.010G058600 expressed protein -
20 Sobic.005G225901 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G198300 Sobic001G198300 Sobic008G001500 Sobic008G001500 Sobic001G198300--Sobic008G001500 Sobic001G523050 Sobic001G523050 Sobic001G198300--Sobic001G523050 Sobic006G108766 Sobic006G108766 Sobic001G198300--Sobic006G108766 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic001G198300--Sobic002G365300 Sobic003G193900 Sobic003G193900 Sobic001G198300--Sobic003G193900 Sobic003G059500 Sobic003G059500 Sobic001G198300--Sobic003G059500 Sobic006G238900 Sobic006G238900 Sobic001G198300--Sobic006G238900 Sobic008G001600 Sobic008G001600 Sobic001G198300--Sobic008G001600 Sobic001G181400 Sobic001G181400 Sobic001G198300--Sobic001G181400 Sobic008G001500--Sobic008G001600 Sobic008G001500--Sobic006G108766 Sobic008G001500--Sobic001G198300 Sobic003G406120 Sobic003G406120 Sobic008G001500--Sobic003G406120 Sobic006G257550 Sobic006G257550 Sobic008G001500--Sobic006G257550 Sobic008G001500--Sobic006G238900 Sobic001G079000 Sobic001G079000 Sobic008G001500--Sobic001G079000 Sobic004G037401 Sobic004G037401 Sobic008G001500--Sobic004G037401 Sobic002G308800 Sobic002G308800 Sobic008G001500--Sobic002G308800 Sobic008G026500 Sobic008G026500 Sobic001G523050--Sobic008G026500 Sobic001G523050--Sobic002G365300 Sobic010G129900 Sobic010G129900 Sobic001G523050--Sobic010G129900 Sobic001G403900 Sobic001G403900 Sobic001G523050--Sobic001G403900 Sobic001G221750 Sobic001G221750 Sobic001G523050--Sobic001G221750 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic001G523050--Sobic004G055400 Sobic006G222200 Sobic006G222200 Sobic001G523050--Sobic006G222200 Sobic001G005100 Sobic001G005100 Sobic001G523050--Sobic001G005100 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic001G523050--Sobic004G272000 Sobic006G108766--Sobic006G238900 Sobic006G108766--Sobic003G406120 Sobic006G108766--Sobic008G001600 Sobic006G108766--Sobic008G001500 Sobic007G155950 Sobic007G155950 Sobic006G108766--Sobic007G155950 Sobic005G230900 Sobic005G230900 Sobic006G108766--Sobic005G230900 Sobic006G108766--Sobic004G037401 Sobic003G040300 Sobic003G040300 Sobic006G108766--Sobic003G040300 Sobic004G207350 Sobic004G207350 Sobic006G108766--Sobic004G207350 Sobic002G365300--Sobic008G026500 Sobic004G089801 Sobic004G089801 Sobic002G365300--Sobic004G089801 Sobic002G365300--Sobic001G523050 Sobic002G365300--Sobic004G272000 Sobic002G365300--Sobic001G005100 Sobic002G365300--Sobic003G059500 Sobic010G000401 Sobic010G000401 Sobic002G365300--Sobic010G000401 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic002G365300--Sobic001G084133 Sobic002G365300--Sobic005G230900 Sobic003G149700 Sobic003G149700 Sobic003G193900--Sobic003G149700 Sobic006G155400 Sobic006G155400 Sobic003G193900--Sobic006G155400 Sobic005G150250 Sobic005G150250 Sobic003G193900--Sobic005G150250 Sobic002G132201 Sobic002G132201 Sobic003G193900--Sobic002G132201 Sobic003G356500 Sobic003G356500 Sobic003G193900--Sobic003G356500 Sobic009G022600 Sobic009G022600 Sobic003G193900--Sobic009G022600 Sobic001G421450 Sobic001G421450 Sobic003G193900--Sobic001G421450 Sobic003G193900--Sobic001G084133 Sobic003G193900--Sobic006G222200 Sobic004G045000 Sobic004G045000 Sobic003G059500--Sobic004G045000 Sobic003G059500--Sobic003G356500 Sobic003G059500--Sobic010G000401 Sobic001G468900 Sobic001G468900 Sobic003G059500--Sobic001G468900 Sobic003G059500--Sobic004G089801 Sobic003G059500--Sobic001G005100 Sobic004G167500 Sobic004G167500 Sobic003G059500--Sobic004G167500 Sobic002G215600 Sobic002G215600 Sobic003G059500--Sobic002G215600 Sobic003G059500--Sobic003G149700 Sobic006G238900--Sobic006G108766 Sobic006G238900--Sobic003G406120 Sobic006G238900--Sobic005G230900 Sobic006G238900--Sobic003G040300 Sobic006G238900--Sobic001G084133 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic006G238900--Sobic001G090700 Sobic006G238900--Sobic001G079000 Sobic006G248450 Sobic006G248450 Sobic006G238900--Sobic006G248450 Sobic001G454600 Sobic001G454600 Sobic006G238900--Sobic001G454600 Sobic008G001600--Sobic006G257550 Sobic008G001600--Sobic003G406120 Sobic002G235000 Sobic002G235000 Sobic008G001600--Sobic002G235000 Sobic008G001600--Sobic008G001500 Sobic010G028366 Sobic010G028366 Sobic008G001600--Sobic010G028366 Sobic008G001600--Sobic006G108766 Sobic001G472900 Sobic001G472900 Sobic008G001600--Sobic001G472900 Sobic008G001600--Sobic001G523050 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic008G001600--Sobic003G076300 Sobic010G058600 Sobic010G058600 Sobic001G181400--Sobic010G058600 Sobic004G223800 Sobic004G223800 Sobic001G181400--Sobic004G223800 Sobic001G222150 Sobic001G222150 Sobic001G181400--Sobic001G222150 Sobic010G122300 Sobic010G122300 Sobic001G181400--Sobic010G122300 Sobic009G058900 Sobic009G058900 Sobic001G181400--Sobic009G058900 Sobic005G036450 Sobic005G036450 Sobic001G181400--Sobic005G036450 Sobic001G073550 Sobic001G073550 Sobic001G181400--Sobic001G073550 Sobic007G199901 Sobic007G199901 Sobic001G181400--Sobic007G199901 Sobic008G039200 Sobic008G039200 Sobic001G181400--Sobic008G039200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.