Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G267050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S892
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G050800 - -
2 Sobic.010G207900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@prenyltransferase, putative, expressed K09833: HPT, HGGT, homogentisate phytyltransferase / homogentisate geranylgeranyltransferase
3 Sobic.003G055200 expressed protein -
4 Sobic.008G160600 tesmin/TSO1-like CXC domain containing protein, expressed -
5 Sobic.001G485500 - -
6 Sobic.001G053350 - -
7 Sobic.010G059600 galactosyltransferase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.005G057900 - -
9 Sobic.009G056100 splicing factor, arginine/serine-rich, putative, expressed -
10 Sobic.010G036901 - -
11 Sobic.004G286301 - -
12 Sobic.007G126000 - -
13 Sobic.006G018751 - -
14 Sobic.004G076900 - -
15 Sobic.001G541400 LTPL112 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
16 Sobic.004G198300 expressed protein -
17 Sobic.001G194500 - -
18 Sobic.010G109300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@acylphosphatase, putative, expressed K01512: acylphosphatase
19 Sobic.002G133150 - -
20 Sobic.007G086701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G267050 Sobic001G267050 Sobic009G050800 Sobic009G050800 Sobic001G267050--Sobic009G050800 Sobic010G207900 Sobic010G207900 Sobic001G267050--Sobic010G207900 Sobic003G055200 Sobic003G055200 Sobic001G267050--Sobic003G055200 Sobic008G160600 Sobic008G160600 Sobic001G267050--Sobic008G160600 Sobic001G485500 Sobic001G485500 Sobic001G267050--Sobic001G485500 Sobic001G053350 Sobic001G053350 Sobic001G267050--Sobic001G053350 Sobic010G059600 Sobic010G059600 Sobic001G267050--Sobic010G059600 Sobic005G057900 Sobic005G057900 Sobic001G267050--Sobic005G057900 Sobic009G056100 Sobic009G056100 Sobic001G267050--Sobic009G056100 Sobic009G050800--Sobic005G057900 Sobic004G064800 Sobic004G064800 Sobic009G050800--Sobic004G064800 Sobic007G040050 Sobic007G040050 Sobic009G050800--Sobic007G040050 Sobic005G220250 Sobic005G220250 Sobic009G050800--Sobic005G220250 Sobic008G007800 Sobic008G007800 Sobic009G050800--Sobic008G007800 Sobic010G255400 Sobic010G255400 Sobic009G050800--Sobic010G255400 Sobic005G201200 Sobic005G201200 Sobic009G050800--Sobic005G201200 Sobic010G061600 Sobic010G061600 Sobic009G050800--Sobic010G061600 Sobic001G504800 Sobic001G504800 Sobic009G050800--Sobic001G504800 Sobic006G018751 Sobic006G018751 Sobic010G207900--Sobic006G018751 Sobic007G086701 Sobic007G086701 Sobic010G207900--Sobic007G086701 Sobic007G126000 Sobic007G126000 Sobic010G207900--Sobic007G126000 Sobic001G264600 Sobic001G264600 Sobic010G207900--Sobic001G264600 Sobic004G322901 Sobic004G322901 Sobic010G207900--Sobic004G322901 Sobic002G174500 Sobic002G174500 Sobic010G207900--Sobic002G174500 Sobic010G207900--Sobic009G056100 Sobic005G083280 Sobic005G083280 Sobic010G207900--Sobic005G083280 Sobic001G261529 Sobic001G261529 Sobic010G207900--Sobic001G261529 Sobic002G354800 Sobic002G354800 Sobic003G055200--Sobic002G354800 Sobic003G055200--Sobic010G207900 Sobic002G315100 Sobic002G315100 Sobic003G055200--Sobic002G315100 Sobic001G278700 Sobic001G278700 Sobic003G055200--Sobic001G278700 Sobic002G230400 Sobic002G230400 Sobic003G055200--Sobic002G230400 Sobic004G163700 Sobic004G163700 Sobic003G055200--Sobic004G163700 Sobic003G055200--Sobic002G174500 Sobic003G055200--Sobic007G086701 Sobic006G257600 Sobic006G257600 Sobic003G055200--Sobic006G257600 Sobic006G184200 Sobic006G184200 Sobic008G160600--Sobic006G184200 Sobic010G009600 Sobic010G009600 Sobic008G160600--Sobic010G009600 Sobic010G223500 Sobic010G223500 Sobic008G160600--Sobic010G223500 Sobic010G257500 Sobic010G257500 Sobic008G160600--Sobic010G257500 Sobic008G160600--Sobic001G485500 Sobic004G198300 Sobic004G198300 Sobic008G160600--Sobic004G198300 Sobic010G018900 Sobic010G018900 Sobic008G160600--Sobic010G018900 Sobic008G087200 Sobic008G087200 Sobic008G160600--Sobic008G087200 Sobic004G215200 Sobic004G215200 Sobic008G160600--Sobic004G215200 Sobic001G485500--Sobic001G053350 Sobic001G485500--Sobic004G215200 Sobic003G275400 Sobic003G275400 Sobic001G485500--Sobic003G275400 Sobic001G485500--Sobic010G255400 Sobic010G036901 Sobic010G036901 Sobic001G485500--Sobic010G036901 Sobic009G168200 Sobic009G168200 Sobic001G485500--Sobic009G168200 Sobic001G485500--Sobic005G201200 Sobic009G163400 Sobic009G163400 Sobic001G485500--Sobic009G163400 Sobic010G062900 Sobic010G062900 Sobic001G485500--Sobic010G062900 Sobic001G053350--Sobic001G485500 Sobic001G053350--Sobic004G215200 Sobic001G053350--Sobic010G255400 Sobic001G053350--Sobic005G201200 Sobic008G121501 Sobic008G121501 Sobic001G053350--Sobic008G121501 Sobic001G053350--Sobic008G007800 Sobic001G075200 Sobic001G075200 Sobic001G053350--Sobic001G075200 Sobic001G053350--Sobic009G050800 Sobic001G053350--Sobic010G036901 Sobic010G059600--Sobic010G207900 Sobic010G059600--Sobic006G018751 Sobic010G059600--Sobic007G086701 Sobic010G059600--Sobic009G050800 Sobic010G059600--Sobic007G126000 Sobic002G066700 Sobic002G066700 Sobic010G059600--Sobic002G066700 Sobic010G059600--Sobic005G057900 Sobic008G018200 Sobic008G018200 Sobic010G059600--Sobic008G018200 Sobic001G194500 Sobic001G194500 Sobic010G059600--Sobic001G194500 Sobic005G057900--Sobic009G050800 Sobic005G057900--Sobic004G064800 Sobic004G203000 Sobic004G203000 Sobic005G057900--Sobic004G203000 Sobic005G057900--Sobic001G504800 Sobic005G057900--Sobic007G040050 Sobic006G199500 Sobic006G199500 Sobic005G057900--Sobic006G199500 Sobic005G057900--Sobic005G220250 Sobic002G304500 Sobic002G304500 Sobic005G057900--Sobic002G304500 Sobic005G057900--Sobic010G255400 Sobic009G056100--Sobic007G126000 Sobic009G056100--Sobic010G207900 Sobic002G358000 Sobic002G358000 Sobic009G056100--Sobic002G358000 Sobic002G286800 Sobic002G286800 Sobic009G056100--Sobic002G286800 Sobic003G099900 Sobic003G099900 Sobic009G056100--Sobic003G099900 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic009G056100--Sobic007G131100 Sobic008G082300 Sobic008G082300 Sobic009G056100--Sobic008G082300 Sobic008G188200 Sobic008G188200 Sobic009G056100--Sobic008G188200 Sobic008G064100 Sobic008G064100 Sobic009G056100--Sobic008G064100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.