Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G293200.1
Synonym Sb01g028640
Functional annotation peroxidase precursor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5S887
Pfam PF00141
Panther DB PTHR31235 PTHR31235:SF70
NCBI CDD -
KEGG Orthology K00430; peroxidase
Gene Ontology GO:0006979; response to oxidative stress GO:0004601peroxidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G17820 : Peroxidase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g15500.1 : peroxidase precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a051865
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7A02G474200 , TraesCS7B02G375600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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17 Sobic.003G186066 - -
18 Sobic.010G174000 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase protein, putative, expressed K05933: aminocyclopropanecarboxylate oxidase
19 Sobic.008G167900 - -
20 Sobic.008G053800 OsWAK24 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G293200 Sobic001G293200 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic001G293200--Sobic009G184450 Sobic001G087850 Sobic001G087850 Sobic001G293200--Sobic001G087850 Sobic010G123650 Sobic010G123650 Sobic001G293200--Sobic010G123650 Sobic006G171801 Sobic006G171801 Sobic001G293200--Sobic006G171801 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic001G293200--Sobic006G065000 Sobic010G028366 Sobic010G028366 Sobic001G293200--Sobic010G028366 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic001G293200--Sobic004G023800 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic001G293200--Sobic001G436450 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic001G293200--Sobic004G207733 Sobic008G167900 Sobic008G167900 Sobic009G184450--Sobic008G167900 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic009G184450--Sobic003G288700 Sobic009G184450--Sobic006G065000 Sobic009G184450--Sobic004G023800 Sobic009G184450--Sobic001G087850 Sobic001G258700 Sobic001G258700 Sobic009G184450--Sobic001G258700 Sobic006G064900 Sobic006G064900 Sobic009G184450--Sobic006G064900 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic009G184450--Sobic001G440401 Sobic009G184450--Sobic010G123650 Sobic001G087850--Sobic010G123650 Sobic001G087850--Sobic004G207733 Sobic001G087850--Sobic001G436450 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic001G087850--Sobic002G147550 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic001G087850--Sobic006G176900 Sobic003G404050 Sobic003G404050 Sobic001G087850--Sobic003G404050 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic001G087850--Sobic001G045900 Sobic004G187701 Sobic004G187701 Sobic001G087850--Sobic004G187701 Sobic001G087850--Sobic006G065000 Sobic010G123650--Sobic001G087850 Sobic010G123650--Sobic004G207733 Sobic010G123650--Sobic003G404050 Sobic010G123650--Sobic002G147550 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic010G123650--Sobic003G112100 Sobic010G123650--Sobic001G436450 Sobic003G168700 Sobic003G168700 Sobic010G123650--Sobic003G168700 Sobic010G123650--Sobic006G176900 Sobic010G123650--Sobic001G045900 Sobic010G157600 Sobic010G157600 Sobic006G171801--Sobic010G157600 Sobic002G286500 Sobic002G286500 Sobic006G171801--Sobic002G286500 Sobic006G171801--Sobic003G404050 Sobic006G171801--Sobic010G028366 Sobic006G171801--Sobic010G123650 Sobic006G171801--Sobic001G087850 Sobic006G171801--Sobic001G436450 Sobic006G171801--Sobic009G184450 Sobic002G136500 Sobic002G136500 Sobic006G171801--Sobic002G136500 Sobic006G065000--Sobic009G184450 Sobic006G065000--Sobic004G023800 Sobic006G065000--Sobic001G087850 Sobic006G065000--Sobic003G288700 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic006G065000--Sobic008G056000 Sobic001G504300 Sobic001G504300 Sobic006G065000--Sobic001G504300 Sobic006G065000--Sobic006G064900 Sobic006G065000--Sobic001G440401 Sobic006G065000--Sobic004G207733 Sobic010G028366--Sobic001G258700 Sobic004G238000 Sobic004G238000 Sobic010G028366--Sobic004G238000 Sobic010G028366--Sobic006G171801 Sobic010G028366--Sobic009G184450 Sobic010G028366--Sobic010G157600 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic010G028366--Sobic003G076300 Sobic010G028366--Sobic002G147550 Sobic010G028366--Sobic003G404050 Sobic010G028366--Sobic010G123650 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic004G023800--Sobic003G024450 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic004G023800--Sobic004G143550 Sobic004G023800--Sobic003G288700 Sobic004G023800--Sobic006G065000 Sobic008G053800 Sobic008G053800 Sobic004G023800--Sobic008G053800 Sobic004G023800--Sobic001G440401 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic004G023800--Sobic004G092950 Sobic004G023800--Sobic009G184450 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic004G023800--Sobic010G149000 Sobic001G436450--Sobic003G404050 Sobic001G249800 Sobic001G249800 Sobic001G436450--Sobic001G249800 Sobic001G436450--Sobic001G087850 Sobic010G011100 Sobic010G011100 Sobic001G436450--Sobic010G011100 Sobic003G244250 Sobic003G244250 Sobic001G436450--Sobic003G244250 Sobic001G436450--Sobic006G176900 Sobic001G436450--Sobic004G207733 Sobic001G436450--Sobic004G187701 Sobic001G436450--Sobic010G123650 Sobic004G207733--Sobic001G087850 Sobic004G207733--Sobic001G045900 Sobic004G207733--Sobic006G176900 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic004G207733--Sobic004G127733 Sobic004G207733--Sobic010G123650 Sobic004G207733--Sobic002G147550 Sobic004G207733--Sobic003G112100 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic004G207733--Sobic002G154450 Sobic004G207733--Sobic001G436450
Octagon: transcription factors


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