Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G310500.2
Synonym ATSSL4, Sb01g030270, SSL4
Functional annotation strictosidine synthase, putative, expressed
UniProt A0A1Z5S8F8
Pfam PF08450
Panther DB PTHR10426 PTHR10426:SF4
NCBI CDD KOG1520; Predicted alkaloid synthase/Surface mucin Hemomucin
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G51420 : strictosidine synthase-like 4
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g39710.1 : strictosidine synthase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ97633
Barley HORVU1Hr1G052450.12 , HORVU1Hr1G052450.11 , HORVU1Hr1G052450.10 , HORVU1Hr1G052450.15 , HORVU1Hr1G052450.13 , HORVU1Hr1G052450.8 , HORVU1Hr1G052450.3 , HORVU1Hr1G052450.2
Wheat TraesCS1B02G217600
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G310500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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3 Sobic.005G210100 uncharacterized glycosyltransferase, putative, expressed K06611: stachyose synthetase
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5 Sobic.001G262000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G129000 - -
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8 Sobic.007G090442 - -
9 Sobic.010G095300 - -
10 Sobic.001G341001 - -
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14 Sobic.004G285400 ZOS2-15 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
15 Sobic.003G425600 - -
16 Sobic.005G226150 - -
17 Sobic.005G112066 - -
18 Sobic.001G166401 - -
19 Sobic.007G049400 OsFBX381 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.007G156300 similar to Abscisic acid 8'-hydroxylase 2(PubMedID : 29862293)@cytochrome P450, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G310500 Sobic001G310500 Sobic006G180900 Sobic006G180900 Sobic001G310500--Sobic006G180900 Sobic007G181600 Sobic007G181600 Sobic001G310500--Sobic007G181600 Sobic005G210100 Sobic005G210100 Sobic001G310500--Sobic005G210100 Sobic001G351300 Sobic001G351300 Sobic001G310500--Sobic001G351300 Sobic001G262000 Sobic001G262000 Sobic001G310500--Sobic001G262000 Sobic005G129000 Sobic005G129000 Sobic001G310500--Sobic005G129000 Sobic002G282900 Sobic002G282900 Sobic001G310500--Sobic002G282900 Sobic007G090442 Sobic007G090442 Sobic001G310500--Sobic007G090442 Sobic010G095300 Sobic010G095300 Sobic001G310500--Sobic010G095300 Sobic004G285400 Sobic004G285400 Sobic006G180900--Sobic004G285400 Sobic006G180900--Sobic007G181600 Sobic006G180900--Sobic001G310500 Sobic008G013000 Sobic008G013000 Sobic006G180900--Sobic008G013000 Sobic006G245000 Sobic006G245000 Sobic006G180900--Sobic006G245000 Sobic006G180900--Sobic002G282900 Sobic007G170400 Sobic007G170400 Sobic006G180900--Sobic007G170400 Sobic006G180900--Sobic005G129000 Sobic004G158300 Sobic004G158300 Sobic006G180900--Sobic004G158300 Sobic004G298700 Sobic004G298700 Sobic007G181600--Sobic004G298700 Sobic007G181600--Sobic007G090442 Sobic007G181600--Sobic006G180900 Sobic007G181600--Sobic001G310500 Sobic007G181600--Sobic008G013000 Sobic007G181600--Sobic010G095300 Sobic003G111400 Sobic003G111400 Sobic007G181600--Sobic003G111400 Sobic001G037800 Sobic001G037800 Sobic007G181600--Sobic001G037800 Sobic001G011800 Sobic001G011800 Sobic007G181600--Sobic001G011800 Sobic005G210100--Sobic001G310500 Sobic005G210100--Sobic001G351300 Sobic005G210100--Sobic001G262000 Sobic005G210100--Sobic007G090442 Sobic005G210100--Sobic007G170400 Sobic008G087100 Sobic008G087100 Sobic005G210100--Sobic008G087100 Sobic004G003000 Sobic004G003000 Sobic005G210100--Sobic004G003000 Sobic009G041100 Sobic009G041100 Sobic005G210100--Sobic009G041100 Sobic005G193260 Sobic005G193260 Sobic005G210100--Sobic005G193260 Sobic001G351300--Sobic001G262000 Sobic001G369300 Sobic001G369300 Sobic001G351300--Sobic001G369300 Sobic001G351300--Sobic009G041100 Sobic001G381250 Sobic001G381250 Sobic001G351300--Sobic001G381250 Sobic001G262000--Sobic001G351300 Sobic001G262000--Sobic001G369300 Sobic001G262000--Sobic009G041100 Sobic001G262000--Sobic001G381250 Sobic005G129000--Sobic001G310500 Sobic001G125700 Sobic001G125700 Sobic005G129000--Sobic001G125700 Sobic006G005500 Sobic006G005500 Sobic005G129000--Sobic006G005500 Sobic006G005400 Sobic006G005400 Sobic005G129000--Sobic006G005400 Sobic007G076000 Sobic007G076000 Sobic005G129000--Sobic007G076000 Sobic005G219100 Sobic005G219100 Sobic005G129000--Sobic005G219100 Sobic007G055600 Sobic007G055600 Sobic005G129000--Sobic007G055600 Sobic009G014600 Sobic009G014600 Sobic005G129000--Sobic009G014600 Sobic005G219000 Sobic005G219000 Sobic005G129000--Sobic005G219000 Sobic005G173800 Sobic005G173800 Sobic002G282900--Sobic005G173800 Sobic010G200400 Sobic010G200400 Sobic002G282900--Sobic010G200400 Sobic007G205100 Sobic007G205100 Sobic002G282900--Sobic007G205100 Sobic002G338600 Sobic002G338600 Sobic002G282900--Sobic002G338600 Sobic010G200200 Sobic010G200200 Sobic002G282900--Sobic010G200200 Sobic002G089400 Sobic002G089400 Sobic002G282900--Sobic002G089400 Sobic008G081700 Sobic008G081700 Sobic002G282900--Sobic008G081700 Sobic007G025300 Sobic007G025300 Sobic002G282900--Sobic007G025300 Sobic001G259250 Sobic001G259250 Sobic002G282900--Sobic001G259250 Sobic007G090442--Sobic009G041100 Sobic005G110000 Sobic005G110000 Sobic007G090442--Sobic005G110000 Sobic002G362400 Sobic002G362400 Sobic007G090442--Sobic002G362400 Sobic005G087666 Sobic005G087666 Sobic007G090442--Sobic005G087666 Sobic010G237100 Sobic010G237100 Sobic007G090442--Sobic010G237100 Sobic010G044600 Sobic010G044600 Sobic007G090442--Sobic010G044600 Sobic009G010000 Sobic009G010000 Sobic007G090442--Sobic009G010000 Sobic003G392500 Sobic003G392500 Sobic007G090442--Sobic003G392500 Sobic005G199300 Sobic005G199300 Sobic007G090442--Sobic005G199300 Sobic006G031600 Sobic006G031600 Sobic010G095300--Sobic006G031600 Sobic007G156300 Sobic007G156300 Sobic010G095300--Sobic007G156300 Sobic001G326000 Sobic001G326000 Sobic010G095300--Sobic001G326000 Sobic005G112066 Sobic005G112066 Sobic010G095300--Sobic005G112066 Sobic010G095300--Sobic003G392500 Sobic002G077500 Sobic002G077500 Sobic010G095300--Sobic002G077500 Sobic005G223200 Sobic005G223200 Sobic010G095300--Sobic005G223200 Sobic009G009900 Sobic009G009900 Sobic010G095300--Sobic009G009900 Sobic002G344900 Sobic002G344900 Sobic010G095300--Sobic002G344900
Octagon: transcription factors


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