Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G365500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QN27
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
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cDNA sequences
Sobic.001G365500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G089400 - -
2 Sobic.007G198500 BTB/POZ domain containing protein, expressed K10523: speckle-type POZ protein
3 Sobic.004G253700 - -
4 Sobic.002G118101 - -
5 Sobic.007G010700 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
6 Sobic.008G122100 - -
7 Sobic.004G304000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G321800 60S ribosomal protein L44, putative, expressed K02929: RP-L44e, large subunit ribosomal protein L44e
9 Sobic.005G053200 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
10 Sobic.001G000501 - -
11 Sobic.001G459600 expressed protein -
12 Sobic.004G261900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@diacylglycerol O-acyltransferase, putative, expressed K14457: MOGAT2, 2-acylglycerol O-acyltransferase 2
13 Sobic.001G223550 - -
14 Sobic.001G359500 cytochrome P450, putative, expressed -
15 Sobic.007G198400 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
16 Sobic.008G187632 - -
17 Sobic.001G517800 NIN, putative, expressed -
18 Sobic.008G101200 powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed -
19 Sobic.002G017500 expressed protein -
20 Sobic.005G067850 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G365500 Sobic001G365500 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic001G365500--Sobic005G089400 Sobic007G198500 Sobic007G198500 Sobic001G365500--Sobic007G198500 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic001G365500--Sobic004G253700 Sobic002G118101 Sobic002G118101 Sobic001G365500--Sobic002G118101 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic001G365500--Sobic007G010700 Sobic008G122100 Sobic008G122100 Sobic001G365500--Sobic008G122100 Sobic004G304000 Sobic004G304000 Sobic001G365500--Sobic004G304000 Sobic002G321800 Sobic002G321800 Sobic001G365500--Sobic002G321800 Sobic005G053200 Sobic005G053200 Sobic001G365500--Sobic005G053200 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic005G089400--Sobic001G000501 Sobic005G089400--Sobic004G253700 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic005G089400--Sobic001G223550 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic005G089400--Sobic008G101100 Sobic003G416000 Sobic003G416000 Sobic005G089400--Sobic003G416000 Sobic005G089400--Sobic007G010700 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic005G089400--Sobic001G459600 Sobic010G145500 Sobic010G145500 Sobic005G089400--Sobic010G145500 Sobic005G089400--Sobic008G122100 Sobic005G043600 Sobic005G043600 Sobic007G198500--Sobic005G043600 Sobic008G048900 Sobic008G048900 Sobic007G198500--Sobic008G048900 Sobic008G175032 Sobic008G175032 Sobic007G198500--Sobic008G175032 Sobic001G359500 Sobic001G359500 Sobic007G198500--Sobic001G359500 Sobic001G247550 Sobic001G247550 Sobic007G198500--Sobic001G247550 Sobic003G203200 Sobic003G203200 Sobic007G198500--Sobic003G203200 Sobic005G043900 Sobic005G043900 Sobic007G198500--Sobic005G043900 Sobic004G253700--Sobic008G101100 Sobic004G253700--Sobic005G089400 Sobic004G253700--Sobic008G122100 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic004G253700--Sobic005G133600 Sobic004G253700--Sobic007G010700 Sobic004G253700--Sobic001G000501 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic004G253700--Sobic009G248801 Sobic004G253700--Sobic003G416000 Sobic008G105366 Sobic008G105366 Sobic004G253700--Sobic008G105366 Sobic001G053200 Sobic001G053200 Sobic002G118101--Sobic001G053200 Sobic002G118101--Sobic002G321800 Sobic008G089800 Sobic008G089800 Sobic002G118101--Sobic008G089800 Sobic008G027200 Sobic008G027200 Sobic002G118101--Sobic008G027200 Sobic004G044900 Sobic004G044900 Sobic002G118101--Sobic004G044900 Sobic007G084300 Sobic007G084300 Sobic002G118101--Sobic007G084300 Sobic003G080800 Sobic003G080800 Sobic002G118101--Sobic003G080800 Sobic002G017500 Sobic002G017500 Sobic002G118101--Sobic002G017500 Sobic001G413000 Sobic001G413000 Sobic002G118101--Sobic001G413000 Sobic004G070500 Sobic004G070500 Sobic007G010700--Sobic004G070500 Sobic007G010700--Sobic005G053200 Sobic007G010700--Sobic001G000501 Sobic007G010700--Sobic004G253700 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic007G010700--Sobic004G034600 Sobic007G010700--Sobic005G133600 Sobic003G061200 Sobic003G061200 Sobic007G010700--Sobic003G061200 Sobic002G249300 Sobic002G249300 Sobic007G010700--Sobic002G249300 Sobic007G010700--Sobic005G089400 Sobic008G122100--Sobic004G253700 Sobic008G122100--Sobic008G101100 Sobic008G122100--Sobic009G248801 Sobic008G122100--Sobic005G089400 Sobic008G122100--Sobic001G459600 Sobic008G122100--Sobic001G000501 Sobic008G122100--Sobic002G017500 Sobic008G122100--Sobic005G133600 Sobic008G088833 Sobic008G088833 Sobic008G122100--Sobic008G088833 Sobic002G292100 Sobic002G292100 Sobic004G304000--Sobic002G292100 Sobic006G030700 Sobic006G030700 Sobic004G304000--Sobic006G030700 Sobic001G162700 Sobic001G162700 Sobic004G304000--Sobic001G162700 Sobic009G029600 Sobic009G029600 Sobic004G304000--Sobic009G029600 Sobic002G011600 Sobic002G011600 Sobic004G304000--Sobic002G011600 Sobic003G257100 Sobic003G257100 Sobic004G304000--Sobic003G257100 Sobic006G199000 Sobic006G199000 Sobic004G304000--Sobic006G199000 Sobic003G398100 Sobic003G398100 Sobic004G304000--Sobic003G398100 Sobic001G150600 Sobic001G150600 Sobic004G304000--Sobic001G150600 Sobic002G321800--Sobic005G133600 Sobic002G321800--Sobic001G053200 Sobic002G321800--Sobic009G248801 Sobic002G321800--Sobic002G118101 Sobic004G086150 Sobic004G086150 Sobic002G321800--Sobic004G086150 Sobic003G160100 Sobic003G160100 Sobic002G321800--Sobic003G160100 Sobic002G321800--Sobic004G253700 Sobic002G321800--Sobic008G122100 Sobic002G321800--Sobic001G000501 Sobic005G053200--Sobic007G010700 Sobic005G053200--Sobic004G070500 Sobic005G053200--Sobic002G249300 Sobic003G174301 Sobic003G174301 Sobic005G053200--Sobic003G174301 Sobic005G053200--Sobic001G000501 Sobic005G053200--Sobic009G248801 Sobic005G053200--Sobic005G133600 Sobic010G227800 Sobic010G227800 Sobic005G053200--Sobic010G227800 Sobic005G053200--Sobic005G089400
Octagon: transcription factors


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