Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G101200.1
Synonym Sb08g015350
Functional annotation powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed
UniProt A0A1Z5R6E8
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF579
NCBI CDD KOG4658; Apoptotic ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G14460 : LRR and NB-ARC domains-containing disease resistance protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g63150.2 : powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ86490
Barley HORVU3Hr1G113690.7 , HORVU3Hr1G113690.6 , HORVU3Hr1G113690.5 , HORVU3Hr1G113690.4 , HORVU3Hr1G113690.3 , HORVU3Hr1G113690.2 , HORVU5Hr1G017950.2 , HORVU3Hr1G113690.1 , HORVU3Hr1G113690.9 , HORVU3Hr1G113690.8 , HORVU3Hr1G113690.12 , HORVU3Hr1G113690.11 , HORVU3Hr1G113690.10 , HORVU5Hr1G017940.1 , HORVU5Hr1G017950.1
Wheat TraesCS1B02G014800
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G088833 - -
2 Sobic.005G089400 - -
3 Sobic.004G253700 - -
4 Sobic.008G101100 powdery mildew resistance protein PM3A, putative, expressed -
5 Sobic.008G122100 - -
6 Sobic.009G248801 - -
7 Sobic.001G000501 - -
8 Sobic.003G416000 - -
9 Sobic.004G086150 - -
10 Sobic.008G084300 - -
11 Sobic.001G223550 - -
12 Sobic.007G010700 OsFBL6 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
13 Sobic.008G166550 - -
14 Sobic.005G133600 - -
15 Sobic.002G017500 expressed protein -
16 Sobic.005G095000 -(PubMedID : 22050783)@-(PubMedID : 25928459)@disease resistance protein RPM1, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
17 Sobic.005G053200 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
18 Sobic.003G160100 - -
19 Sobic.002G321800 60S ribosomal protein L44, putative, expressed K02929: RP-L44e, large subunit ribosomal protein L44e
20 Sobic.001G000700 glutathione S-transferase, N-terminal domain containing protein, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase


Gene co-expression network
sample Sobic008G101200 Sobic008G101200 Sobic008G088833 Sobic008G088833 Sobic008G101200--Sobic008G088833 Sobic005G089400 Sobic005G089400 Sobic008G101200--Sobic005G089400 Sobic004G253700 Sobic004G253700 Sobic008G101200--Sobic004G253700 Sobic008G101100 Sobic008G101100 Sobic008G101200--Sobic008G101100 Sobic008G122100 Sobic008G122100 Sobic008G101200--Sobic008G122100 Sobic009G248801 Sobic009G248801 Sobic008G101200--Sobic009G248801 Sobic001G000501 Sobic001G000501 Sobic008G101200--Sobic001G000501 Sobic003G416000 Sobic003G416000 Sobic008G101200--Sobic003G416000 Sobic004G086150 Sobic004G086150 Sobic008G101200--Sobic004G086150 Sobic008G084300 Sobic008G084300 Sobic008G088833--Sobic008G084300 Sobic008G088833--Sobic009G248801 Sobic008G088833--Sobic008G101200 Sobic001G000300 Sobic001G000300 Sobic008G088833--Sobic001G000300 Sobic008G088833--Sobic001G000501 Sobic008G088833--Sobic008G101100 Sobic001G459600 Sobic001G459600 Sobic008G088833--Sobic001G459600 Sobic008G088833--Sobic008G122100 Sobic008G166550 Sobic008G166550 Sobic008G088833--Sobic008G166550 Sobic005G089400--Sobic001G000501 Sobic005G089400--Sobic004G253700 Sobic001G223550 Sobic001G223550 Sobic005G089400--Sobic001G223550 Sobic005G089400--Sobic008G101100 Sobic005G089400--Sobic003G416000 Sobic007G010700 Sobic007G010700 Sobic005G089400--Sobic007G010700 Sobic005G089400--Sobic001G459600 Sobic010G145500 Sobic010G145500 Sobic005G089400--Sobic010G145500 Sobic005G089400--Sobic008G122100 Sobic004G253700--Sobic008G101100 Sobic004G253700--Sobic005G089400 Sobic004G253700--Sobic008G122100 Sobic005G133600 Sobic005G133600 Sobic004G253700--Sobic005G133600 Sobic004G253700--Sobic007G010700 Sobic004G253700--Sobic001G000501 Sobic004G253700--Sobic009G248801 Sobic004G253700--Sobic003G416000 Sobic008G105366 Sobic008G105366 Sobic004G253700--Sobic008G105366 Sobic008G101100--Sobic003G416000 Sobic008G101100--Sobic004G253700 Sobic008G101100--Sobic008G166550 Sobic008G101100--Sobic001G223550 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic008G101100--Sobic007G202300 Sobic008G101100--Sobic009G248801 Sobic008G101100--Sobic005G133600 Sobic008G101100--Sobic005G089400 Sobic002G017500 Sobic002G017500 Sobic008G101100--Sobic002G017500 Sobic008G122100--Sobic004G253700 Sobic008G122100--Sobic008G101100 Sobic008G122100--Sobic009G248801 Sobic008G122100--Sobic005G089400 Sobic008G122100--Sobic001G459600 Sobic008G122100--Sobic001G000501 Sobic008G122100--Sobic002G017500 Sobic008G122100--Sobic005G133600 Sobic008G122100--Sobic008G088833 Sobic009G248801--Sobic004G086150 Sobic002G244200 Sobic002G244200 Sobic009G248801--Sobic002G244200 Sobic003G160100 Sobic003G160100 Sobic009G248801--Sobic003G160100 Sobic005G095000 Sobic005G095000 Sobic009G248801--Sobic005G095000 Sobic009G248801--Sobic007G202300 Sobic009G248801--Sobic005G133600 Sobic009G248801--Sobic008G101100 Sobic007G090403 Sobic007G090403 Sobic009G248801--Sobic007G090403 Sobic009G248801--Sobic008G166550 Sobic001G000501--Sobic001G459600 Sobic001G000700 Sobic001G000700 Sobic001G000501--Sobic001G000700 Sobic001G000501--Sobic005G089400 Sobic001G000501--Sobic007G010700 Sobic001G000501--Sobic008G084300 Sobic005G149700 Sobic005G149700 Sobic001G000501--Sobic005G149700 Sobic004G034600 Sobic004G034600 Sobic001G000501--Sobic004G034600 Sobic005G053200 Sobic005G053200 Sobic001G000501--Sobic005G053200 Sobic001G000501--Sobic004G253700 Sobic003G416000--Sobic002G017500 Sobic003G416000--Sobic008G101100 Sobic003G416000--Sobic008G166550 Sobic003G416000--Sobic002G244200 Sobic003G416000--Sobic005G089400 Sobic001G227900 Sobic001G227900 Sobic003G416000--Sobic001G227900 Sobic003G416000--Sobic007G202300 Sobic003G080700 Sobic003G080700 Sobic003G416000--Sobic003G080700 Sobic003G416000--Sobic005G133600 Sobic004G086150--Sobic009G248801 Sobic004G086150--Sobic003G160100 Sobic004G086150--Sobic002G244200 Sobic004G086150--Sobic005G095000 Sobic002G196600 Sobic002G196600 Sobic004G086150--Sobic002G196600 Sobic005G068700 Sobic005G068700 Sobic004G086150--Sobic005G068700 Sobic009G123900 Sobic009G123900 Sobic004G086150--Sobic009G123900 Sobic004G086150--Sobic007G090403 Sobic004G175400 Sobic004G175400 Sobic004G086150--Sobic004G175400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.