Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G501701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SBI6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g05700.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a000689
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G097800 - -
2 Sobic.003G396050 - -
3 Sobic.009G200632 - -
4 Sobic.001G499400 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
5 Sobic.003G039800 expressed protein -
6 Sobic.006G205800 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
7 Sobic.003G314200 TKL_IRAK_DUF26-lc.7 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
8 Sobic.006G192150 - -
9 Sobic.007G138600 no apical meristem protein, putative, expressed -
10 Sobic.002G314100 dimethyladenosine transferase, putative, expressed K14191: 18S rRNA (adenine1779-N6/adenine1780-N6)-dimethyltransferase
11 Sobic.008G040800 OsFBX396 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.007G159300 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
13 Sobic.006G033601 - -
14 Sobic.005G005300 expressed protein -
15 Sobic.006G112000 expressed protein -
16 Sobic.001G062066 - -
17 Sobic.003G388201 - -
18 Sobic.004G143550 - -
19 Sobic.010G053700 expressed protein -
20 Sobic.003G024450 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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