Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G039800.2
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VVK9
Pfam -
Panther DB PTHR33120 PTHR33120:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g08900.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G040800 OsFBX396 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.009G200632 - -
3 Sobic.001G499400 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G501701 - -
5 Sobic.001G197200 expressed protein -
6 Sobic.003G365450 - -
7 Sobic.006G192150 - -
8 Sobic.003G314200 TKL_IRAK_DUF26-lc.7 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
9 Sobic.010G023132 - -
10 Sobic.003G396050 - -
11 Sobic.002G314100 dimethyladenosine transferase, putative, expressed K14191: 18S rRNA (adenine1779-N6/adenine1780-N6)-dimethyltransferase
12 Sobic.009G087360 - -
13 Sobic.004G304475 - -
14 Sobic.001G097800 - -
15 Sobic.007G159300 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
16 Sobic.004G193100 potassium channel AKT1, putative, expressed -
17 Sobic.010G043350 - -
18 Sobic.003G024450 - -
19 Sobic.007G099700 - -
20 Sobic.004G143550 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G039800 Sobic003G039800 Sobic008G040800 Sobic008G040800 Sobic003G039800--Sobic008G040800 Sobic009G200632 Sobic009G200632 Sobic003G039800--Sobic009G200632 Sobic001G499400 Sobic001G499400 Sobic003G039800--Sobic001G499400 Sobic001G501701 Sobic001G501701 Sobic003G039800--Sobic001G501701 Sobic001G197200 Sobic001G197200 Sobic003G039800--Sobic001G197200 Sobic003G365450 Sobic003G365450 Sobic003G039800--Sobic003G365450 Sobic006G192150 Sobic006G192150 Sobic003G039800--Sobic006G192150 Sobic003G314200 Sobic003G314200 Sobic003G039800--Sobic003G314200 Sobic010G023132 Sobic010G023132 Sobic003G039800--Sobic010G023132 Sobic008G040800--Sobic003G314200 Sobic009G027200 Sobic009G027200 Sobic008G040800--Sobic009G027200 Sobic001G097800 Sobic001G097800 Sobic008G040800--Sobic001G097800 Sobic003G396050 Sobic003G396050 Sobic008G040800--Sobic003G396050 Sobic009G229500 Sobic009G229500 Sobic008G040800--Sobic009G229500 Sobic008G040800--Sobic003G039800 Sobic003G395800 Sobic003G395800 Sobic008G040800--Sobic003G395800 Sobic002G153600 Sobic002G153600 Sobic008G040800--Sobic002G153600 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic008G040800--Sobic007G127200 Sobic010G247700 Sobic010G247700 Sobic009G200632--Sobic010G247700 Sobic009G087360 Sobic009G087360 Sobic009G200632--Sobic009G087360 Sobic009G200632--Sobic001G499400 Sobic006G128233 Sobic006G128233 Sobic009G200632--Sobic006G128233 Sobic006G280700 Sobic006G280700 Sobic009G200632--Sobic006G280700 Sobic009G200632--Sobic006G192150 Sobic002G323800 Sobic002G323800 Sobic009G200632--Sobic002G323800 Sobic004G304475 Sobic004G304475 Sobic009G200632--Sobic004G304475 Sobic009G200632--Sobic003G365450 Sobic001G499400--Sobic006G128233 Sobic001G499400--Sobic004G304475 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic001G499400--Sobic004G023800 Sobic001G499400--Sobic003G396050 Sobic001G499400--Sobic006G192150 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic001G499400--Sobic003G024450 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic001G499400--Sobic004G143550 Sobic001G499400--Sobic009G087360 Sobic006G033601 Sobic006G033601 Sobic001G499400--Sobic006G033601 Sobic001G501701--Sobic001G097800 Sobic001G501701--Sobic003G396050 Sobic001G501701--Sobic009G200632 Sobic001G501701--Sobic001G499400 Sobic001G501701--Sobic003G039800 Sobic006G205800 Sobic006G205800 Sobic001G501701--Sobic006G205800 Sobic001G501701--Sobic003G314200 Sobic001G501701--Sobic006G192150 Sobic007G138600 Sobic007G138600 Sobic001G501701--Sobic007G138600 Sobic001G197200--Sobic003G039800 Sobic002G325700 Sobic002G325700 Sobic001G197200--Sobic002G325700 Sobic008G141501 Sobic008G141501 Sobic001G197200--Sobic008G141501 Sobic004G172201 Sobic004G172201 Sobic001G197200--Sobic004G172201 Sobic001G197200--Sobic007G138600 Sobic007G159300 Sobic007G159300 Sobic001G197200--Sobic007G159300 Sobic003G392800 Sobic003G392800 Sobic001G197200--Sobic003G392800 Sobic007G099700 Sobic007G099700 Sobic001G197200--Sobic007G099700 Sobic001G197200--Sobic003G314200 Sobic002G025900 Sobic002G025900 Sobic003G365450--Sobic002G025900 Sobic003G365450--Sobic003G024450 Sobic003G361150 Sobic003G361150 Sobic003G365450--Sobic003G361150 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic003G365450--Sobic004G092950 Sobic004G194600 Sobic004G194600 Sobic003G365450--Sobic004G194600 Sobic003G365450--Sobic004G143550 Sobic002G289300 Sobic002G289300 Sobic003G365450--Sobic002G289300 Sobic006G064900 Sobic006G064900 Sobic003G365450--Sobic006G064900 Sobic010G225175 Sobic010G225175 Sobic003G365450--Sobic010G225175 Sobic006G192150--Sobic009G087360 Sobic004G193100 Sobic004G193100 Sobic006G192150--Sobic004G193100 Sobic002G314100 Sobic002G314100 Sobic006G192150--Sobic002G314100 Sobic003G388201 Sobic003G388201 Sobic006G192150--Sobic003G388201 Sobic006G192150--Sobic010G023132 Sobic006G192150--Sobic001G499400 Sobic006G192150--Sobic004G143550 Sobic006G192150--Sobic003G024450 Sobic006G192150--Sobic003G396050 Sobic003G314200--Sobic008G040800 Sobic003G314200--Sobic006G205800 Sobic006G094800 Sobic006G094800 Sobic003G314200--Sobic006G094800 Sobic001G148000 Sobic001G148000 Sobic003G314200--Sobic001G148000 Sobic003G226600 Sobic003G226600 Sobic003G314200--Sobic003G226600 Sobic003G314200--Sobic009G027200 Sobic001G207301 Sobic001G207301 Sobic003G314200--Sobic001G207301 Sobic003G314200--Sobic001G501701 Sobic004G338200 Sobic004G338200 Sobic003G314200--Sobic004G338200 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic010G023132--Sobic002G117800 Sobic010G023132--Sobic009G087360 Sobic004G039000 Sobic004G039000 Sobic010G023132--Sobic004G039000 Sobic008G133750 Sobic008G133750 Sobic010G023132--Sobic008G133750 Sobic010G023132--Sobic004G092950 Sobic009G190100 Sobic009G190100 Sobic010G023132--Sobic009G190100 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic010G023132--Sobic001G202800 Sobic010G023132--Sobic006G192150 Sobic010G023132--Sobic003G024450
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.