Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G197200.2
Synonym Sb01g017400
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S6G5
Pfam PF03087
Panther DB PTHR33070 PTHR33070:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G76240 : Arabidopsis protein of unknown function (DUF241)
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g36670.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006349
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G039800 expressed protein -
2 Sobic.002G325700 expressed protein -
3 Sobic.008G141501 - -
4 Sobic.004G172201 - -
5 Sobic.007G138600 no apical meristem protein, putative, expressed -
6 Sobic.007G159300 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
7 Sobic.003G392800 gibberellin response modulator protein, putative, expressed -
8 Sobic.007G099700 - -
9 Sobic.003G314200 TKL_IRAK_DUF26-lc.7 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed -
10 Sobic.007G006501 - K01183: chitinase
11 Sobic.001G501701 - -
12 Sobic.001G206600 vacuolar protein-sorting protein bro1, putative, expressed K12200: PDCD6IP, ALIX, programmed cell death 6-interacting protein
13 Sobic.007G128900 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
14 Sobic.007G181500 "Phylogenetic analysis of canonical DREB1 and DREB2 genes in sorghum with those genes in maize, rice, and Arabidopsis. "(PubMedID : 24086146)@SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@Dehydration-responsive element binding 1 A(PubMedID : 26320239)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Not investigated(PubMedID : 23766026)@dehydration-responsive element-binding protein, putative, expressed -
15 Sobic.001G026950 - -
16 Sobic.003G226600 WRKY12, expressed -
17 Sobic.008G040800 OsFBX396 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G062066 - -
19 Sobic.003G396050 - -
20 Sobic.008G079500 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase


Gene co-expression network
sample Sobic001G197200 Sobic001G197200 Sobic003G039800 Sobic003G039800 Sobic001G197200--Sobic003G039800 Sobic002G325700 Sobic002G325700 Sobic001G197200--Sobic002G325700 Sobic008G141501 Sobic008G141501 Sobic001G197200--Sobic008G141501 Sobic004G172201 Sobic004G172201 Sobic001G197200--Sobic004G172201 Sobic007G138600 Sobic007G138600 Sobic001G197200--Sobic007G138600 Sobic007G159300 Sobic007G159300 Sobic001G197200--Sobic007G159300 Sobic003G392800 Sobic003G392800 Sobic001G197200--Sobic003G392800 Sobic007G099700 Sobic007G099700 Sobic001G197200--Sobic007G099700 Sobic003G314200 Sobic003G314200 Sobic001G197200--Sobic003G314200 Sobic008G040800 Sobic008G040800 Sobic003G039800--Sobic008G040800 Sobic009G200632 Sobic009G200632 Sobic003G039800--Sobic009G200632 Sobic001G499400 Sobic001G499400 Sobic003G039800--Sobic001G499400 Sobic001G501701 Sobic001G501701 Sobic003G039800--Sobic001G501701 Sobic003G039800--Sobic001G197200 Sobic003G365450 Sobic003G365450 Sobic003G039800--Sobic003G365450 Sobic006G192150 Sobic006G192150 Sobic003G039800--Sobic006G192150 Sobic003G039800--Sobic003G314200 Sobic010G023132 Sobic010G023132 Sobic003G039800--Sobic010G023132 Sobic002G325700--Sobic001G197200 Sobic004G094900 Sobic004G094900 Sobic002G325700--Sobic004G094900 Sobic001G197300 Sobic001G197300 Sobic002G325700--Sobic001G197300 Sobic007G100032 Sobic007G100032 Sobic002G325700--Sobic007G100032 Sobic001G381400 Sobic001G381400 Sobic002G325700--Sobic001G381400 Sobic002G347200 Sobic002G347200 Sobic002G325700--Sobic002G347200 Sobic002G388800 Sobic002G388800 Sobic002G325700--Sobic002G388800 Sobic002G390000 Sobic002G390000 Sobic002G325700--Sobic002G390000 Sobic002G250900 Sobic002G250900 Sobic002G325700--Sobic002G250900 Sobic001G026950 Sobic001G026950 Sobic008G141501--Sobic001G026950 Sobic002G391501 Sobic002G391501 Sobic008G141501--Sobic002G391501 Sobic010G203800 Sobic010G203800 Sobic008G141501--Sobic010G203800 Sobic008G141501--Sobic003G392800 Sobic008G141501--Sobic004G172201 Sobic008G141501--Sobic001G197200 Sobic008G079500 Sobic008G079500 Sobic008G141501--Sobic008G079500 Sobic009G123733 Sobic009G123733 Sobic008G141501--Sobic009G123733 Sobic001G206600 Sobic001G206600 Sobic008G141501--Sobic001G206600 Sobic007G128900 Sobic007G128900 Sobic004G172201--Sobic007G128900 Sobic004G172201--Sobic003G392800 Sobic004G172201--Sobic008G141501 Sobic010G113500 Sobic010G113500 Sobic004G172201--Sobic010G113500 Sobic004G135000 Sobic004G135000 Sobic004G172201--Sobic004G135000 Sobic004G105001 Sobic004G105001 Sobic004G172201--Sobic004G105001 Sobic004G172201--Sobic008G079500 Sobic004G172201--Sobic007G100032 Sobic004G172201--Sobic001G197200 Sobic008G033800 Sobic008G033800 Sobic007G138600--Sobic008G033800 Sobic006G135701 Sobic006G135701 Sobic007G138600--Sobic006G135701 Sobic001G118050 Sobic001G118050 Sobic007G138600--Sobic001G118050 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic007G138600--Sobic006G206600 Sobic006G112000 Sobic006G112000 Sobic007G138600--Sobic006G112000 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic007G138600--Sobic010G053700 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic007G138600--Sobic002G220400 Sobic006G059150 Sobic006G059150 Sobic007G138600--Sobic006G059150 Sobic005G021400 Sobic005G021400 Sobic007G138600--Sobic005G021400 Sobic003G076100 Sobic003G076100 Sobic007G159300--Sobic003G076100 Sobic006G163033 Sobic006G163033 Sobic007G159300--Sobic006G163033 Sobic006G205800 Sobic006G205800 Sobic007G159300--Sobic006G205800 Sobic006G174000 Sobic006G174000 Sobic007G159300--Sobic006G174000 Sobic006G252532 Sobic006G252532 Sobic007G159300--Sobic006G252532 Sobic007G122866 Sobic007G122866 Sobic007G159300--Sobic007G122866 Sobic007G159300--Sobic001G501701 Sobic004G271100 Sobic004G271100 Sobic007G159300--Sobic004G271100 Sobic004G279900 Sobic004G279900 Sobic007G159300--Sobic004G279900 Sobic003G392800--Sobic004G105001 Sobic003G392800--Sobic008G141501 Sobic001G037600 Sobic001G037600 Sobic003G392800--Sobic001G037600 Sobic003G392800--Sobic004G172201 Sobic001G006101 Sobic001G006101 Sobic003G392800--Sobic001G006101 Sobic001G420600 Sobic001G420600 Sobic003G392800--Sobic001G420600 Sobic001G052500 Sobic001G052500 Sobic003G392800--Sobic001G052500 Sobic003G392800--Sobic007G128900 Sobic010G043350 Sobic010G043350 Sobic003G392800--Sobic010G043350 Sobic004G161850 Sobic004G161850 Sobic007G099700--Sobic004G161850 Sobic005G019000 Sobic005G019000 Sobic007G099700--Sobic005G019000 Sobic007G099700--Sobic006G174000 Sobic010G094200 Sobic010G094200 Sobic007G099700--Sobic010G094200 Sobic003G061850 Sobic003G061850 Sobic007G099700--Sobic003G061850 Sobic009G248200 Sobic009G248200 Sobic007G099700--Sobic009G248200 Sobic002G025200 Sobic002G025200 Sobic007G099700--Sobic002G025200 Sobic004G193100 Sobic004G193100 Sobic007G099700--Sobic004G193100 Sobic002G314100 Sobic002G314100 Sobic007G099700--Sobic002G314100 Sobic003G314200--Sobic008G040800 Sobic003G314200--Sobic006G205800 Sobic006G094800 Sobic006G094800 Sobic003G314200--Sobic006G094800 Sobic001G148000 Sobic001G148000 Sobic003G314200--Sobic001G148000 Sobic003G226600 Sobic003G226600 Sobic003G314200--Sobic003G226600 Sobic009G027200 Sobic009G027200 Sobic003G314200--Sobic009G027200 Sobic001G207301 Sobic001G207301 Sobic003G314200--Sobic001G207301 Sobic003G314200--Sobic001G501701 Sobic004G338200 Sobic004G338200 Sobic003G314200--Sobic004G338200
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.