Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G504500.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QQK7
Pfam PF12274
Panther DB PTHR23068 PTHR23068:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g44792.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G453600 beta-hexosaminidase precursor, putative, expressed K12373: hexosaminidase
2 Sobic.002G389600 transcription regulator, putative, expressed -
3 Sobic.001G024400 pectinesterase inhibitor domain containing protein, expressed -
4 Sobic.004G349450 - -
5 Sobic.010G202200 - -
6 Sobic.003G024100 MRH1, putative, expressed -
7 Sobic.001G133400 - -
8 Sobic.002G414800 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.007G039200 MYB family transcription factor, putative, expressed -
10 Sobic.006G093600 - -
11 Sobic.010G193501 - -
12 Sobic.008G148600 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
13 Sobic.008G136601 - -
14 Sobic.003G236000 CGMC_MAPKCMGC_2.5 - CGMC includes CDA, MAPK, GSK3, and CLKC kinases, expressed K04371: ERK, mitogen-activated protein kinase 1/3
15 Sobic.005G128550 - -
16 Sobic.009G061500 - -
17 Sobic.004G358000 CAMK_CAMK_like.16 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
18 Sobic.008G056600 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.006G269101 - -
20 Sobic.001G340800 exocyst complex component 6, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G504500 Sobic001G504500 Sobic001G453600 Sobic001G453600 Sobic001G504500--Sobic001G453600 Sobic002G389600 Sobic002G389600 Sobic001G504500--Sobic002G389600 Sobic001G024400 Sobic001G024400 Sobic001G504500--Sobic001G024400 Sobic004G349450 Sobic004G349450 Sobic001G504500--Sobic004G349450 Sobic010G202200 Sobic010G202200 Sobic001G504500--Sobic010G202200 Sobic003G024100 Sobic003G024100 Sobic001G504500--Sobic003G024100 Sobic001G133400 Sobic001G133400 Sobic001G504500--Sobic001G133400 Sobic002G414800 Sobic002G414800 Sobic001G504500--Sobic002G414800 Sobic007G039200 Sobic007G039200 Sobic001G504500--Sobic007G039200 Sobic010G145100 Sobic010G145100 Sobic001G453600--Sobic010G145100 Sobic004G046800 Sobic004G046800 Sobic001G453600--Sobic004G046800 Sobic006G093600 Sobic006G093600 Sobic001G453600--Sobic006G093600 Sobic009G229400 Sobic009G229400 Sobic001G453600--Sobic009G229400 Sobic009G202000 Sobic009G202000 Sobic001G453600--Sobic009G202000 Sobic006G162400 Sobic006G162400 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Sobic007G039200--Sobic001G384200 Sobic008G159701 Sobic008G159701 Sobic007G039200--Sobic008G159701
Octagon: transcription factors


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