Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G037900.1
Synonym Sb02g003280
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
expressed protein
UniProt C5X9M3
Pfam PF02576
Panther DB PTHR34544 PTHR34544:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G69210 : Uncharacterised protein family UPF0090
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g06090.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016155
Brachypodium KQK20893
Barley -
Wheat TraesCS2B02G271100 , TraesCS2A02G249800 , TraesCS2D02G251200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G358900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G089900 seven in absentia protein family protein, putative, expressed -
3 Sobic.005G110550 - -
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7 Sobic.004G199400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat protein PPR986-12, putative, expressed -
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11 Sobic.002G105501 - -
12 Sobic.007G220066 - -
13 Sobic.003G386350 - -
14 Sobic.001G005400 - -
15 Sobic.001G250900 - -
16 Sobic.004G043101 - -
17 Sobic.004G351932 - -
18 Sobic.004G252850 - -
19 Sobic.009G066000 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
20 Sobic.003G120200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G037900 Sobic002G037900 Sobic002G358900 Sobic002G358900 Sobic002G037900--Sobic002G358900 Sobic003G089900 Sobic003G089900 Sobic002G037900--Sobic003G089900 Sobic005G110550 Sobic005G110550 Sobic002G037900--Sobic005G110550 Sobic010G046200 Sobic010G046200 Sobic002G037900--Sobic010G046200 Sobic005G151000 Sobic005G151000 Sobic002G037900--Sobic005G151000 Sobic006G084701 Sobic006G084701 Sobic002G037900--Sobic006G084701 Sobic004G199400 Sobic004G199400 Sobic002G037900--Sobic004G199400 Sobic009G096566 Sobic009G096566 Sobic002G037900--Sobic009G096566 Sobic002G095800 Sobic002G095800 Sobic002G037900--Sobic002G095800 Sobic002G358900--Sobic005G110550 Sobic002G358900--Sobic002G037900 Sobic002G358900--Sobic004G199400 Sobic001G491700 Sobic001G491700 Sobic002G358900--Sobic001G491700 Sobic009G205000 Sobic009G205000 Sobic002G358900--Sobic009G205000 Sobic005G024600 Sobic005G024600 Sobic002G358900--Sobic005G024600 Sobic006G085800 Sobic006G085800 Sobic002G358900--Sobic006G085800 Sobic010G123100 Sobic010G123100 Sobic002G358900--Sobic010G123100 Sobic003G399900 Sobic003G399900 Sobic002G358900--Sobic003G399900 Sobic003G386350 Sobic003G386350 Sobic003G089900--Sobic003G386350 Sobic007G220066 Sobic007G220066 Sobic003G089900--Sobic007G220066 Sobic004G056100 Sobic004G056100 Sobic003G089900--Sobic004G056100 Sobic002G105501 Sobic002G105501 Sobic003G089900--Sobic002G105501 Sobic003G089900--Sobic010G046200 Sobic001G001066 Sobic001G001066 Sobic003G089900--Sobic001G001066 Sobic009G066000 Sobic009G066000 Sobic003G089900--Sobic009G066000 Sobic003G331550 Sobic003G331550 Sobic003G089900--Sobic003G331550 Sobic007G172900 Sobic007G172900 Sobic003G089900--Sobic007G172900 Sobic005G110550--Sobic010G046200 Sobic005G110550--Sobic002G358900 Sobic005G008700 Sobic005G008700 Sobic005G110550--Sobic005G008700 Sobic005G110550--Sobic003G399900 Sobic005G110550--Sobic003G089900 Sobic002G279200 Sobic002G279200 Sobic005G110550--Sobic002G279200 Sobic005G110550--Sobic001G001066 Sobic003G162200 Sobic003G162200 Sobic005G110550--Sobic003G162200 Sobic006G115400 Sobic006G115400 Sobic005G110550--Sobic006G115400 Sobic010G046200--Sobic003G386350 Sobic010G046200--Sobic003G331550 Sobic010G046200--Sobic009G066000 Sobic007G139950 Sobic007G139950 Sobic010G046200--Sobic007G139950 Sobic010G046200--Sobic006G115400 Sobic010G046200--Sobic007G220066 Sobic010G046200--Sobic002G105501 Sobic010G046200--Sobic007G172900 Sobic009G244450 Sobic009G244450 Sobic010G046200--Sobic009G244450 Sobic005G151000--Sobic009G096566 Sobic004G349500 Sobic004G349500 Sobic005G151000--Sobic004G349500 Sobic001G005400 Sobic001G005400 Sobic005G151000--Sobic001G005400 Sobic004G351932 Sobic004G351932 Sobic005G151000--Sobic004G351932 Sobic001G522800 Sobic001G522800 Sobic005G151000--Sobic001G522800 Sobic005G151000--Sobic002G105501 Sobic005G151000--Sobic007G220066 Sobic001G250900 Sobic001G250900 Sobic005G151000--Sobic001G250900 Sobic004G251701 Sobic004G251701 Sobic005G151000--Sobic004G251701 Sobic006G084701--Sobic003G089900 Sobic006G084701--Sobic007G172900 Sobic006G084701--Sobic005G151000 Sobic006G084701--Sobic009G096566 Sobic003G120200 Sobic003G120200 Sobic006G084701--Sobic003G120200 Sobic006G084701--Sobic002G105501 Sobic006G084701--Sobic007G220066 Sobic006G084701--Sobic010G046200 Sobic002G303200 Sobic002G303200 Sobic006G084701--Sobic002G303200 Sobic004G199400--Sobic002G358900 Sobic003G142400 Sobic003G142400 Sobic004G199400--Sobic003G142400 Sobic004G070100 Sobic004G070100 Sobic004G199400--Sobic004G070100 Sobic010G088200 Sobic010G088200 Sobic004G199400--Sobic010G088200 Sobic001G478900 Sobic001G478900 Sobic004G199400--Sobic001G478900 Sobic001G292800 Sobic001G292800 Sobic004G199400--Sobic001G292800 Sobic004G199400--Sobic002G037900 Sobic004G199400--Sobic010G123100 Sobic010G066900 Sobic010G066900 Sobic004G199400--Sobic010G066900 Sobic009G096566--Sobic004G349500 Sobic009G096566--Sobic001G005400 Sobic009G096566--Sobic004G351932 Sobic009G096566--Sobic002G105501 Sobic009G096566--Sobic007G220066 Sobic004G051500 Sobic004G051500 Sobic009G096566--Sobic004G051500 Sobic009G096566--Sobic001G522800 Sobic004G252850 Sobic004G252850 Sobic009G096566--Sobic004G252850 Sobic009G096566--Sobic005G151000 Sobic003G384100 Sobic003G384100 Sobic002G095800--Sobic003G384100 Sobic009G166650 Sobic009G166650 Sobic002G095800--Sobic009G166650 Sobic002G074500 Sobic002G074500 Sobic002G095800--Sobic002G074500 Sobic002G390700 Sobic002G390700 Sobic002G095800--Sobic002G390700 Sobic002G095800--Sobic007G172900 Sobic006G234500 Sobic006G234500 Sobic002G095800--Sobic006G234500 Sobic002G095200 Sobic002G095200 Sobic002G095800--Sobic002G095200 Sobic002G095800--Sobic010G046200 Sobic001G303300 Sobic001G303300 Sobic002G095800--Sobic001G303300
Octagon: transcription factors


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