Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G041366.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W272
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G264800 expressed protein -
2 Sobic.007G032200 - -
3 Sobic.004G282200 DUF623 domain containing protein, expressed -
4 Sobic.003G253650 - -
5 Sobic.007G072700 - -
6 Sobic.001G371650 - -
7 Sobic.002G211400 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
8 Sobic.002G123750 - -
9 Sobic.007G156400 Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@alpha-amylase precursor, putative, expressed K01176: AMY, amyA, alpha-amylase
10 Sobic.003G071800 - -
11 Sobic.007G091800 GDU1, putative, expressed -
12 Sobic.006G056300 expressed high in CK60 (an inefficient nitrogen user)(PubMedID : 28697783)@reticuline oxidase-like protein precursor, putative, expressed -
13 Sobic.007G064400 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed K18819: inositol 3-alpha-galactosyltransferase
14 Sobic.003G193900 - -
15 Sobic.003G231200 - -
16 Sobic.002G132201 - -
17 Sobic.003G048900 - -
18 Sobic.004G111650 - -
19 Sobic.001G432750 - -
20 Sobic.002G172300 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G041366 Sobic002G041366 Sobic004G264800 Sobic004G264800 Sobic002G041366--Sobic004G264800 Sobic007G032200 Sobic007G032200 Sobic002G041366--Sobic007G032200 Sobic004G282200 Sobic004G282200 Sobic002G041366--Sobic004G282200 Sobic003G253650 Sobic003G253650 Sobic002G041366--Sobic003G253650 Sobic007G072700 Sobic007G072700 Sobic002G041366--Sobic007G072700 Sobic001G371650 Sobic001G371650 Sobic002G041366--Sobic001G371650 Sobic002G211400 Sobic002G211400 Sobic002G041366--Sobic002G211400 Sobic002G123750 Sobic002G123750 Sobic002G041366--Sobic002G123750 Sobic007G156400 Sobic007G156400 Sobic002G041366--Sobic007G156400 Sobic004G264800--Sobic007G072700 Sobic004G264800--Sobic007G156400 Sobic004G264800--Sobic004G282200 Sobic004G264800--Sobic003G253650 Sobic002G172300 Sobic002G172300 Sobic004G264800--Sobic002G172300 Sobic004G264800--Sobic001G371650 Sobic008G030801 Sobic008G030801 Sobic004G264800--Sobic008G030801 Sobic003G229900 Sobic003G229900 Sobic004G264800--Sobic003G229900 Sobic010G011500 Sobic010G011500 Sobic004G264800--Sobic010G011500 Sobic007G032200--Sobic001G371650 Sobic002G132201 Sobic002G132201 Sobic007G032200--Sobic002G132201 Sobic002G054800 Sobic002G054800 Sobic007G032200--Sobic002G054800 Sobic002G240200 Sobic002G240200 Sobic007G032200--Sobic002G240200 Sobic007G032200--Sobic004G282200 Sobic005G073300 Sobic005G073300 Sobic007G032200--Sobic005G073300 Sobic003G048900 Sobic003G048900 Sobic007G032200--Sobic003G048900 Sobic001G071500 Sobic001G071500 Sobic007G032200--Sobic001G071500 Sobic009G022600 Sobic009G022600 Sobic007G032200--Sobic009G022600 Sobic004G282200--Sobic004G264800 Sobic004G282200--Sobic007G072700 Sobic004G282200--Sobic001G371650 Sobic004G282200--Sobic007G156400 Sobic004G282200--Sobic007G032200 Sobic004G282200--Sobic008G030801 Sobic004G282200--Sobic002G172300 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic004G282200--Sobic009G239400 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic004G282200--Sobic004G020150 Sobic003G253650--Sobic002G054800 Sobic001G421100 Sobic001G421100 Sobic003G253650--Sobic001G421100 Sobic003G253650--Sobic002G132201 Sobic003G253650--Sobic008G030801 Sobic003G253650--Sobic001G071500 Sobic006G141200 Sobic006G141200 Sobic003G253650--Sobic006G141200 Sobic003G253650--Sobic007G072700 Sobic003G253650--Sobic002G172300 Sobic003G253650--Sobic005G073300 Sobic007G072700--Sobic004G264800 Sobic007G072700--Sobic007G156400 Sobic007G072700--Sobic003G253650 Sobic007G072700--Sobic004G282200 Sobic007G072700--Sobic001G371650 Sobic007G072700--Sobic008G030801 Sobic007G072700--Sobic010G011500 Sobic007G072700--Sobic003G229900 Sobic001G297900 Sobic001G297900 Sobic007G072700--Sobic001G297900 Sobic001G371650--Sobic002G054800 Sobic001G371650--Sobic002G240200 Sobic001G371650--Sobic002G132201 Sobic001G371650--Sobic001G071500 Sobic010G215201 Sobic010G215201 Sobic001G371650--Sobic010G215201 Sobic001G371650--Sobic005G073300 Sobic001G371650--Sobic007G032200 Sobic001G371650--Sobic008G030801 Sobic001G371650--Sobic002G172300 Sobic007G069800 Sobic007G069800 Sobic002G211400--Sobic007G069800 Sobic001G112350 Sobic001G112350 Sobic002G211400--Sobic001G112350 Sobic005G052100 Sobic005G052100 Sobic002G211400--Sobic005G052100 Sobic007G127700 Sobic007G127700 Sobic002G211400--Sobic007G127700 Sobic008G143400 Sobic008G143400 Sobic002G211400--Sobic008G143400 Sobic007G091800 Sobic007G091800 Sobic002G211400--Sobic007G091800 Sobic001G328350 Sobic001G328350 Sobic002G211400--Sobic001G328350 Sobic004G090200 Sobic004G090200 Sobic002G211400--Sobic004G090200 Sobic007G064400 Sobic007G064400 Sobic002G211400--Sobic007G064400 Sobic003G071800 Sobic003G071800 Sobic002G123750--Sobic003G071800 Sobic001G228500 Sobic001G228500 Sobic002G123750--Sobic001G228500 Sobic001G432750 Sobic001G432750 Sobic002G123750--Sobic001G432750 Sobic002G043201 Sobic002G043201 Sobic002G123750--Sobic002G043201 Sobic002G160300 Sobic002G160300 Sobic002G123750--Sobic002G160300 Sobic002G375000 Sobic002G375000 Sobic002G123750--Sobic002G375000 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic002G123750--Sobic001G208166 Sobic002G099932 Sobic002G099932 Sobic002G123750--Sobic002G099932 Sobic002G123750--Sobic002G041366 Sobic007G156400--Sobic007G072700 Sobic007G156400--Sobic004G264800 Sobic007G156400--Sobic004G282200 Sobic007G156400--Sobic001G371650 Sobic007G156400--Sobic003G253650 Sobic007G156400--Sobic007G064400 Sobic007G156400--Sobic002G172300 Sobic007G156400--Sobic007G032200 Sobic007G156400--Sobic002G054800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.